More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3513 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  49.89 
 
 
946 aa  815    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  41.99 
 
 
2156 aa  680    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  41.83 
 
 
1117 aa  812    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  49.42 
 
 
1855 aa  777    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  48.12 
 
 
991 aa  761    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  48.81 
 
 
1176 aa  996    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  100 
 
 
1331 aa  2680    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  52.43 
 
 
1025 aa  987    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  60.44 
 
 
1975 aa  1291    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  46.72 
 
 
891 aa  790    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  57.84 
 
 
2068 aa  1184    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  61.53 
 
 
1891 aa  1295    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  53.8 
 
 
1248 aa  1206    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  53.38 
 
 
1942 aa  883    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  39.7 
 
 
1329 aa  618  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  40.06 
 
 
1328 aa  615  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.39 
 
 
1035 aa  616  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.22 
 
 
1440 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.22 
 
 
1440 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  40.51 
 
 
1062 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.9 
 
 
1124 aa  606  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  40.24 
 
 
1441 aa  587  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  37.2 
 
 
998 aa  576  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  38.71 
 
 
1432 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  34.82 
 
 
1450 aa  512  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  42.02 
 
 
717 aa  504  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  36.42 
 
 
1429 aa  488  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  34.12 
 
 
1472 aa  486  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  31.02 
 
 
1043 aa  306  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  30.03 
 
 
655 aa  281  7e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  30.03 
 
 
655 aa  280  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  28.74 
 
 
1136 aa  274  7e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  28.15 
 
 
640 aa  270  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  30.82 
 
 
2638 aa  270  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  28.13 
 
 
852 aa  266  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  28.01 
 
 
850 aa  264  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  27.84 
 
 
852 aa  263  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  27.84 
 
 
852 aa  263  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  27.84 
 
 
852 aa  263  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  29.61 
 
 
848 aa  258  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  28.8 
 
 
647 aa  258  6e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  29.66 
 
 
856 aa  248  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  28.82 
 
 
899 aa  248  6.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  29.33 
 
 
848 aa  247  9e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  27.95 
 
 
874 aa  246  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  30.3 
 
 
825 aa  244  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  26.99 
 
 
843 aa  243  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  32.55 
 
 
718 aa  243  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  27.25 
 
 
852 aa  242  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  27.32 
 
 
852 aa  240  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  25.6 
 
 
1064 aa  239  3e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  25.36 
 
 
1064 aa  236  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  26.53 
 
 
843 aa  233  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  28.77 
 
 
1888 aa  232  4e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  28.7 
 
 
928 aa  228  7e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  27.9 
 
 
841 aa  227  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  47.86 
 
 
1401 aa  224  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  25.75 
 
 
842 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  25.72 
 
 
713 aa  217  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  25.65 
 
 
713 aa  217  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  25.72 
 
 
713 aa  217  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  25.58 
 
 
713 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  26.11 
 
 
713 aa  216  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  25.45 
 
 
713 aa  215  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  25.69 
 
 
713 aa  213  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  26.8 
 
 
712 aa  213  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  25.79 
 
 
713 aa  213  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  49.38 
 
 
1401 aa  213  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  25.79 
 
 
713 aa  213  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  25.69 
 
 
713 aa  209  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  27.16 
 
 
601 aa  207  1e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  28.15 
 
 
669 aa  206  3e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  25.35 
 
 
776 aa  194  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  28.55 
 
 
766 aa  191  5.999999999999999e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  25.32 
 
 
640 aa  184  8.000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  25.47 
 
 
1252 aa  181  8e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  51.78 
 
 
870 aa  172  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  42.93 
 
 
1005 aa  144  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  41.12 
 
 
1017 aa  132  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  41.01 
 
 
1643 aa  123  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  33.47 
 
 
1847 aa  122  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5195  Alpha-amylase  44.62 
 
 
707 aa  122  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  25.97 
 
 
700 aa  114  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  24.64 
 
 
817 aa  108  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  26.29 
 
 
701 aa  108  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  26.36 
 
 
701 aa  107  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  25.19 
 
 
703 aa  107  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  24.61 
 
 
721 aa  106  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  26.64 
 
 
701 aa  105  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2363  glycogen debranching enzyme GlgX  25.78 
 
 
701 aa  105  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0149674 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  39.11 
 
 
1652 aa  104  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  24.23 
 
 
718 aa  104  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  26.22 
 
 
721 aa  104  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  35.78 
 
 
774 aa  103  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  26.34 
 
 
706 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1462  glycogen debranching enzyme GlgX  32.76 
 
 
679 aa  103  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  27.59 
 
 
718 aa  102  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1844  glycoside hydrolase family 13 domain protein  29.89 
 
 
414 aa  102  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.521996  normal  0.198003 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  24.53 
 
 
711 aa  102  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  23.73 
 
 
711 aa  102  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>