More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2482 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  68.64 
 
 		 560 aa  727    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  66.67 
 
 		 559 aa  706    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  68.71 
 
 		 558 aa  737    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  65.36 
 
 		 607 aa  724    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  100 
 
 		 555 aa  1121    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  55.98 
 
 		 557 aa  622  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  48.64 
 
 		 655 aa  478  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  45.95 
 
 		 567 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  45.95 
 
 		 567 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.86 
 
 		 604 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  48.17 
 
 		 585 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  46.94 
 
 		 611 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  45.32 
 
 		 580 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  44.03 
 
 		 578 aa  429  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  42.78 
 
 		 588 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  44.4 
 
 		 578 aa  416  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  42.25 
 
 		 575 aa  398  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  42.38 
 
 		 569 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  37.94 
 
 		 602 aa  364  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  42.83 
 
 		 583 aa  363  4e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  41.47 
 
 		 556 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00130  5-nucleotidase/phosphoesterase  39.15 
 
 		 571 aa  360  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  38.67 
 
 		 560 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.49 
 
 		 722 aa  350  4e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.24 
 
 		 560 aa  349  9e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.93 
 
 		 530 aa  345  8e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  35.95 
 
 		 529 aa  340  4e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  36.13 
 
 		 529 aa  340  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  36.13 
 
 		 529 aa  340  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  35.95 
 
 		 529 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  35.95 
 
 		 529 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  36.13 
 
 		 529 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  36.13 
 
 		 529 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  39.37 
 
 		 597 aa  338  9.999999999999999e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  36.41 
 
 		 529 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  35.95 
 
 		 529 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  36.23 
 
 		 529 aa  336  7e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  36.23 
 
 		 529 aa  336  7e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  35.58 
 
 		 529 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  36.23 
 
 		 529 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  36.41 
 
 		 529 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  36.23 
 
 		 529 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.28 
 
 		 529 aa  335  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  36.26 
 
 		 529 aa  334  3e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  36.26 
 
 		 529 aa  334  3e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  37.04 
 
 		 529 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.35 
 
 		 529 aa  331  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.52 
 
 		 509 aa  293  5e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  35.64 
 
 		 580 aa  287  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.31 
 
 		 561 aa  287  4e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  34.95 
 
 		 580 aa  266  8.999999999999999e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1086  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.58 
 
 		 571 aa  265  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.244523  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  32.37 
 
 		 575 aa  265  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  32.37 
 
 		 574 aa  263  8e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4846  5'-Nucleotidase domain-containing protein  32.82 
 
 		 578 aa  262  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2724  5'-nucleotidase-like  33.57 
 
 		 581 aa  251  3e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00164791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4841  5'-Nucleotidase domain-containing protein  31.86 
 
 		 586 aa  248  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.374418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.9 
 
 		 731 aa  241  4e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  33.99 
 
 		 870 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  32.33 
 
 		 1512 aa  237  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  32.46 
 
 		 1577 aa  236  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  32.58 
 
 		 1652 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  31.87 
 
 		 1577 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1461  5'-Nucleotidase domain protein  30.59 
 
 		 583 aa  233  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.899956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  31.07 
 
 		 1506 aa  223  4.9999999999999996e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.04 
 
 		 1525 aa  223  8e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  31.86 
 
 		 1591 aa  219  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.02 
 
 		 508 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  28.6 
 
 		 1311 aa  202  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  29.35 
 
 		 504 aa  200  5e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1029  cell wall anchor domain-containing protein  31.45 
 
 		 752 aa  199  9e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0457373  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4030  5'-Nucleotidase domain protein  28.57 
 
 		 530 aa  192  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000108753  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1333  5'-nucleotidase family protein  27.36 
 
 		 690 aa  181  4e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00306106  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1067  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase related esterase  28.35 
 
 		 765 aa  178  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000206277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  27.35 
 
 		 826 aa  177  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.42 
 
 		 520 aa  173  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4352  5'-Nucleotidase domain protein  29.78 
 
 		 518 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4322  5'-Nucleotidase domain protein  29.78 
 
 		 518 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4439  5'-Nucleotidase domain-containing protein  29.78 
 
 		 518 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.088476 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4507  5'-Nucleotidase domain-containing protein  29.82 
 
 		 518 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4436  5'-Nucleotidase domain protein  29.6 
 
 		 518 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.67 
 
 		 517 aa  170  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4388  serine/threonine protein phosphatase family protein  30.22 
 
 		 517 aa  167  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.693263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2906  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.59 
 
 		 872 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.865364  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  27.66 
 
 		 558 aa  160  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4386  serine/threonine protein phosphatase family protein  26.69 
 
 		 516 aa  159  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4385  serine/threonine protein phosphatase family protein  27.52 
 
 		 539 aa  157  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.970271 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2615  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.24 
 
 		 523 aa  156  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  29.15 
 
 		 555 aa  154  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1442  2',3'-cyclic-nucleotide 2'-phosphodiesterase  26.65 
 
 		 547 aa  153  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  28.69 
 
 		 1181 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.95 
 
 		 1215 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0843  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.09 
 
 		 607 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234407 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.74 
 
 		 587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0955  5'-nucleotidase  28.88 
 
 		 523 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.488215  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.95 
 
 		 1202 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27.87 
 
 		 1175 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1226  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.3 
 
 		 605 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03620  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  27.02 
 
 		 750 aa  141  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.422162  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.49 
 
 		 533 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.255702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>