More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27420 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  100 
 
 
826 aa  1631    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  39.88 
 
 
1577 aa  378  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  39.79 
 
 
1652 aa  363  8e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  39.83 
 
 
1506 aa  362  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  38.24 
 
 
1512 aa  355  2e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  37.85 
 
 
870 aa  335  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  35.8 
 
 
1311 aa  335  3e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.44 
 
 
1525 aa  330  8e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  36.28 
 
 
1591 aa  324  4e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  36.73 
 
 
1577 aa  308  4.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03620  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  31.91 
 
 
750 aa  236  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.422162  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.05 
 
 
731 aa  229  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  30.36 
 
 
575 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  30.2 
 
 
655 aa  207  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  33.28 
 
 
597 aa  195  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.35 
 
 
578 aa  194  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  29.68 
 
 
588 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  28.74 
 
 
607 aa  191  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.88 
 
 
557 aa  188  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  30.02 
 
 
558 aa  188  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  27.84 
 
 
529 aa  187  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  28.47 
 
 
529 aa  187  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  28.78 
 
 
529 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.6 
 
 
529 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  28.42 
 
 
529 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  27.69 
 
 
529 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  29.67 
 
 
559 aa  184  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  28.42 
 
 
529 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  28.42 
 
 
529 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  30.63 
 
 
722 aa  183  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  28.24 
 
 
529 aa  183  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  28.24 
 
 
529 aa  183  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.23 
 
 
530 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  28.07 
 
 
560 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  27.1 
 
 
529 aa  178  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  27.27 
 
 
529 aa  178  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4307  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.92 
 
 
560 aa  178  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  27.1 
 
 
529 aa  177  7e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  27.1 
 
 
529 aa  177  7e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  27.4 
 
 
580 aa  177  9e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  27.35 
 
 
555 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  26.93 
 
 
529 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  26.93 
 
 
529 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1414  5`-nucleotidase  26.63 
 
 
560 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.93 
 
 
529 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  29.57 
 
 
569 aa  175  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  27.1 
 
 
529 aa  175  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  26.32 
 
 
529 aa  174  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  27.01 
 
 
578 aa  172  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  26.93 
 
 
529 aa  170  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00130  5-nucleotidase/phosphoesterase  27.35 
 
 
571 aa  169  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  27.69 
 
 
611 aa  164  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  27.44 
 
 
602 aa  164  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0306  5'-nucleotidase-like protein  30.17 
 
 
556 aa  163  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0268  5'-nucleotidase domain-containing protein  29.41 
 
 
567 aa  163  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0229  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.81 
 
 
567 aa  162  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1794  5'-nucleotidase  25 
 
 
504 aa  155  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4841  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.92 
 
 
586 aa  154  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.374418  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0741  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.95 
 
 
508 aa  153  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0181082  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3391  5'-Nucleotidase domain protein  29.55 
 
 
585 aa  150  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0559  5'-nucleotidase  29.24 
 
 
583 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.562968  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4541  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.04 
 
 
604 aa  148  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101042  normal  0.534355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1147  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.29 
 
 
561 aa  144  8e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4846  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.34 
 
 
578 aa  144  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2751  5'-nucleotidase-like  28.6 
 
 
520 aa  137  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273963  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2724  5'-nucleotidase-like  25.56 
 
 
581 aa  134  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00164791  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1917  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  26.99 
 
 
1175 aa  132  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1162  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.3 
 
 
509 aa  132  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.587696  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2695  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.91 
 
 
577 aa  130  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.432031 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2206  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  27.36 
 
 
1181 aa  130  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0272  5'-nucleotidase domain-containing protein  26.08 
 
 
1284 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1918  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.87 
 
 
1202 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0941  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  28.13 
 
 
508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0919  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  28.13 
 
 
508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.455321  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2207  bifunctional 2',3'-cyclic nucleotide 2'-phosphodiesterase/3'-nucleotidase precursor protein  25.5 
 
 
1215 aa  128  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2645  5'-Nucleotidase domain-containing protein  27.66 
 
 
555 aa  128  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1952  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  27.93 
 
 
569 aa  127  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.643025  normal  0.0714944 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2731  hypothetical protein  23.8 
 
 
575 aa  126  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2604  hypothetical protein  23.29 
 
 
574 aa  126  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3032  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.3 
 
 
550 aa  124  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0631  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.54 
 
 
587 aa  124  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1461  5'-Nucleotidase domain protein  26.27 
 
 
583 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.899956  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3605  5'-Nucleotidase domain protein  25.2 
 
 
657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2961  5'-nucleotidase-like  26.91 
 
 
532 aa  122  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.969714  normal  0.02857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4357  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.35 
 
 
535 aa  120  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000122656  decreased coverage  0.0000528459 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2690  5'-nucleotidase domain-containing protein  25.49 
 
 
627 aa  120  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526931  normal  0.659093 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0860  5'-Nucleotidase domain protein  25.59 
 
 
580 aa  119  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0875  5'-Nucleotidase domain protein  24.01 
 
 
580 aa  119  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608431  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0658  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.66 
 
 
517 aa  118  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275133  normal  0.788742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3303  5'-Nucleotidase domain protein  25.7 
 
 
659 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737364  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3032  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  24.67 
 
 
551 aa  117  7.999999999999999e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0289029  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2487  5'-Nucleotidase domain protein  26.63 
 
 
558 aa  117  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1751  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  25.25 
 
 
553 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000978587  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  24.36 
 
 
523 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.225236 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0037  5'-Nucleotidase domain protein  24.19 
 
 
520 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.361552  normal  0.180073 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0038  5'-Nucleotidase domain protein  24.19 
 
 
520 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0998  5'-Nucleotidase domain protein  24.16 
 
 
515 aa  114  7.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003789  5'-nucleotidase  24.59 
 
 
502 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00210298  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2882  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.92 
 
 
533 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02665  bifunctional UDP-sugar hydrolase/5'-nucleotidase periplasmic precursor  26.27 
 
 
578 aa  112  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>