More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0677 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  52.93 
 
 
1652 aa  1289    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  78.88 
 
 
1512 aa  2322    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  51.54 
 
 
1577 aa  1284    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  52.5 
 
 
902 aa  740    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  100 
 
 
1525 aa  3053    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  49.21 
 
 
1591 aa  1197    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  50.93 
 
 
1506 aa  1101    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  53.99 
 
 
1577 aa  1315    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.01 
 
 
929 aa  636  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0036  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like esterase  52.55 
 
 
1311 aa  622  1e-176  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3554  5'-Nucleotidase domain protein  55.32 
 
 
870 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00406796  hitchhiker  0.00346018 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27420  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  36.28 
 
 
826 aa  340  8e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  35.47 
 
 
795 aa  334  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.77 
 
 
868 aa  319  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2321  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.73 
 
 
731 aa  310  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.857665  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.27 
 
 
1266 aa  297  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  28.49 
 
 
2667 aa  294  7e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0452  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.26 
 
 
578 aa  280  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.226129 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  27.82 
 
 
2775 aa  270  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0143  5'-Nucleotidase domain protein  35.61 
 
 
575 aa  268  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.84 
 
 
1075 aa  267  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  30.67 
 
 
1310 aa  266  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.51 
 
 
601 aa  265  4.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03620  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  33.43 
 
 
750 aa  263  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.422162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4009  5'-nucleotidase family protein  34.43 
 
 
529 aa  259  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3842  5'-nucleotidase  34.6 
 
 
529 aa  260  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3856  5'-nucleotidase  34.6 
 
 
529 aa  259  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4322  5'-nucleotidase family protein  34.43 
 
 
529 aa  259  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4124  5'-nucleotidase family protein  34.6 
 
 
529 aa  260  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000166834 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4169  5'-nucleotidase family protein  34.26 
 
 
529 aa  258  6e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4233  5'-nucleotidase family protein  34.67 
 
 
529 aa  258  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.45 
 
 
848 aa  256  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.81 
 
 
1641 aa  254  6e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1027  5'-nucleotidase family protein  33.74 
 
 
529 aa  253  1e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  31.06 
 
 
780 aa  254  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  35.16 
 
 
780 aa  253  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2091  putative 5'-nucleotidase  34.43 
 
 
529 aa  252  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0356  5'-nucleotidase  32.35 
 
 
655 aa  253  3e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0863234 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.34 
 
 
1641 aa  251  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.74 
 
 
818 aa  250  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1025  5'-Nucleotidase domain protein  33.27 
 
 
560 aa  250  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.587673  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1152  5'-nucleotidase-like  33.8 
 
 
558 aa  250  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3171  putative 5'-nucleotidase  34.07 
 
 
529 aa  249  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.43 
 
 
826 aa  249  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2939  5'-nucleotidase  34.07 
 
 
529 aa  249  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0202171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3162  5'-nucleotidase  34.07 
 
 
529 aa  249  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2913  5'-nucleotidase  34.07 
 
 
529 aa  249  4e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1425  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3181  putative 5'-nucleotidase  33.88 
 
 
529 aa  248  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.851775  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4210  5'-nucleotidase family protein  33.39 
 
 
529 aa  248  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3931  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.22 
 
 
529 aa  248  6.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.86 
 
 
818 aa  248  9e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3157  5'-nucleotidase, putative  33.7 
 
 
529 aa  247  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00131591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0894  putative 5'-nucleotidase family protein  32.5 
 
 
602 aa  247  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0448  5'-nucleotidase family protein  33.11 
 
 
580 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.82 
 
 
945 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3149  putative 5'-nucleotidase  33.88 
 
 
529 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.479602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2864  5'-nucleotidase  33.7 
 
 
529 aa  246  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0339862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2900  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.88 
 
 
529 aa  246  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.468468  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3482  5'-Nucleotidase domain protein  33.67 
 
 
611 aa  245  5e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4457  5'-nucleotidase-like protein  33.33 
 
 
559 aa  244  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.25099  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.6 
 
 
573 aa  243  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.16 
 
 
2346 aa  243  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2368  5'-nucleotidase-like  32.64 
 
 
578 aa  243  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.287077  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2799  5'-nucleotidase domain-containing protein  32.3 
 
 
530 aa  242  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.45 
 
 
722 aa  243  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3013  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.04 
 
 
557 aa  241  5.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.76 
 
 
1148 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.17 
 
 
641 aa  238  9e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4302  5'-nucleotidase-like  32.82 
 
 
607 aa  237  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.27 
 
 
942 aa  237  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.71 
 
 
1148 aa  237  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  33.76 
 
 
1503 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4270  5'-Nucleotidase domain-containing protein  32.58 
 
 
588 aa  233  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.67 
 
 
955 aa  231  6e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2145  5'-Nucleotidase domain protein  32.81 
 
 
569 aa  230  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.52 
 
 
942 aa  230  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  30.52 
 
 
948 aa  229  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.44 
 
 
947 aa  228  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.9 
 
 
1284 aa  228  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.65 
 
 
653 aa  224  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240387  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2482  putative 5'-nucleotidase  32.04 
 
 
555 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  32.36 
 
 
1346 aa  223  3e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  30.02 
 
 
948 aa  222  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  30.23 
 
 
948 aa  222  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.67 
 
 
940 aa  222  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.44 
 
 
624 aa  221  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  33.44 
 
 
624 aa  220  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.44 
 
 
624 aa  220  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  33.44 
 
 
624 aa  220  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  33.44 
 
 
624 aa  220  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.44 
 
 
624 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07100  5'-nucleotidase/2',3'-cyclic phosphodiesterase-like hydrolase  33.45 
 
 
597 aa  219  2.9999999999999998e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.593719  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.23 
 
 
604 aa  219  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.86 
 
 
604 aa  219  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.23 
 
 
586 aa  217  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  30.23 
 
 
948 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2286  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.55 
 
 
621 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.47 
 
 
600 aa  216  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187879  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.55 
 
 
603 aa  216  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.22 
 
 
1052 aa  214  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>