133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4989 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  68.48 
 
 		 624 aa  754    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  62.77 
 
 		 653 aa  693    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240387  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0934  extracellular nuclease  68.51 
 
 		 514 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2286  endonuclease/exonuclease/phosphatase  64.22 
 
 		 621 aa  698    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  67.94 
 
 		 604 aa  757    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  80.85 
 
 		 818 aa  1327    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0532  extracellular nuclease, putative  68.07 
 
 		 622 aa  731    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 848 aa  1713    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4553  endonuclease/exonuclease/phosphatase  62.74 
 
 		 620 aa  665    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  68.47 
 
 		 604 aa  758    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  66.49 
 
 		 604 aa  749    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5536  endonuclease/exonuclease/phosphatase  61.59 
 
 		 627 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.8971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  68.47 
 
 		 604 aa  758    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3810  endonuclease/exonuclease/phosphatase  62.74 
 
 		 599 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.24 
 
 		 826 aa  667    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  68.48 
 
 		 624 aa  754    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  68.48 
 
 		 624 aa  754    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  68.48 
 
 		 624 aa  754    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  68.3 
 
 		 624 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  68.48 
 
 		 624 aa  754    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  68.63 
 
 		 603 aa  773    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3714  endonuclease/exonuclease/phosphatase  62.56 
 
 		 620 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495775 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  68.29 
 
 		 604 aa  758    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  67.02 
 
 		 604 aa  753    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  62.63 
 
 		 600 aa  671    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187879  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  80.85 
 
 		 818 aa  1323    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.07 
 
 		 1075 aa  623  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  47.4 
 
 		 780 aa  609  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  47.54 
 
 		 780 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.7 
 
 		 945 aa  571  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.61 
 
 		 947 aa  565  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.19 
 
 		 942 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  45.06 
 
 		 948 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  44.61 
 
 		 948 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  42.26 
 
 		 1310 aa  561  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.98 
 
 		 955 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.01 
 
 		 940 aa  562  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  44.99 
 
 		 948 aa  557  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  43.62 
 
 		 948 aa  543  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  43.63 
 
 		 944 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  43.63 
 
 		 944 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.3 
 
 		 944 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  43.63 
 
 		 944 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  43.37 
 
 		 944 aa  539  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  41.75 
 
 		 1346 aa  488  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  40.57 
 
 		 1503 aa  463  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.78 
 
 		 2346 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.06 
 
 		 1641 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.73 
 
 		 1641 aa  411  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.15 
 
 		 1148 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.66 
 
 		 1148 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.73 
 
 		 601 aa  385  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.57 
 
 		 1266 aa  382  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.75 
 
 		 573 aa  379  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.69 
 
 		 641 aa  375  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.69 
 
 		 586 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.35 
 
 		 942 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.83 
 
 		 1052 aa  365  3e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  41.31 
 
 		 795 aa  350  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.37 
 
 		 870 aa  332  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.57 
 
 		 1284 aa  323  8e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.23 
 
 		 871 aa  317  5e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  33.71 
 
 		 2667 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.53 
 
 		 870 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 870 aa  307  7e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  31.83 
 
 		 865 aa  307  7e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 870 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.91 
 
 		 873 aa  300  6e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03816  nuclease  38.54 
 
 		 572 aa  300  9e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  35.52 
 
 		 1652 aa  296  9e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.02 
 
 		 885 aa  295  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  32.01 
 
 		 984 aa  294  6e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  34.65 
 
 		 2775 aa  293  6e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  32.01 
 
 		 871 aa  293  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  32.1 
 
 		 869 aa  293  7e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.97 
 
 		 870 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  40.1 
 
 		 1577 aa  293  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.16 
 
 		 870 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.16 
 
 		 870 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.16 
 
 		 870 aa  290  6e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.74 
 
 		 892 aa  290  9e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00081  nuclease  30.98 
 
 		 982 aa  289  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.29 
 
 		 876 aa  287  7e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  37.31 
 
 		 1577 aa  283  7.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0201  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.15 
 
 		 481 aa  280  6e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.418254  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.1 
 
 		 929 aa  278  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.27 
 
 		 894 aa  277  5e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1737  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.8 
 
 		 570 aa  274  4.0000000000000004e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.979917  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1364  putative exported nuclease  30.01 
 
 		 890 aa  275  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.92 
 
 		 868 aa  273  9e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3281  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.01 
 
 		 1123 aa  271  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  34.64 
 
 		 2796 aa  270  8.999999999999999e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01770  predicted extracellular nuclease  31.34 
 
 		 863 aa  268  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.609758  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.07 
 
 		 1010 aa  266  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.434546 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.89 
 
 		 1525 aa  266  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1188  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.96 
 
 		 575 aa  264  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219404  normal  0.0718602 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  36.82 
 
 		 902 aa  264  4.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2843  extracellular nuclease-like  31.32 
 
 		 945 aa  258  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0894144  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  36.08 
 
 		 1506 aa  258  5e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  35.38 
 
 		 1512 aa  247  6.999999999999999e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>