More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1564 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  54.94 
 
 		 2796 aa  751    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  72.77 
 
 		 2667 aa  3786    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  100 
 
 		 2775 aa  5401    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2843  extracellular nuclease-like  45.35 
 
 		 945 aa  538  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0894144  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.74 
 
 		 980 aa  531  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1464  5'-Nucleotidase domain protein  44.72 
 
 		 657 aa  521  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  42.63 
 
 		 1355 aa  486  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  43.38 
 
 		 808 aa  482  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  44.04 
 
 		 3977 aa  481  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  44.54 
 
 		 2852 aa  477  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3214  5'-nucleotidase domain-containing protein  43.63 
 
 		 668 aa  475  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6734  5'-Nucleotidase domain protein  43.63 
 
 		 726 aa  476  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0580  alkaline phosphatase  43.24 
 
 		 748 aa  442  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00489448 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  69.44 
 
 		 1236 aa  417  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.1 
 
 		 2346 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.41 
 
 		 1148 aa  388  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.72 
 
 		 1148 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3281  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.28 
 
 		 1123 aa  381  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  40.88 
 
 		 780 aa  384  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  40.31 
 
 		 780 aa  383  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.55 
 
 		 1075 aa  377  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.59 
 
 		 1641 aa  363  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.91 
 
 		 1641 aa  362  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.24 
 
 		 641 aa  360  9.999999999999999e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  39.49 
 
 		 2885 aa  356  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.55 
 
 		 1266 aa  341  9.999999999999999e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.06 
 
 		 1052 aa  338  9e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.11 
 
 		 826 aa  325  7e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  37.3 
 
 		 1310 aa  323  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.22 
 
 		 947 aa  320  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.56 
 
 		 601 aa  313  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.12 
 
 		 942 aa  304  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  35.01 
 
 		 795 aa  303  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.95 
 
 		 945 aa  300  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.77 
 
 		 573 aa  294  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.93 
 
 		 955 aa  293  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  37.85 
 
 		 944 aa  291  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  37.85 
 
 		 944 aa  290  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.49 
 
 		 848 aa  290  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  37.85 
 
 		 944 aa  289  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.29 
 
 		 624 aa  288  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  36.16 
 
 		 1346 aa  288  8e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.27 
 
 		 944 aa  287  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.29 
 
 		 624 aa  286  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  35.18 
 
 		 624 aa  286  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.18 
 
 		 624 aa  286  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  35.18 
 
 		 624 aa  286  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  35.18 
 
 		 624 aa  286  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  37.69 
 
 		 944 aa  286  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.65 
 
 		 818 aa  282  6e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.4 
 
 		 940 aa  282  8e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.23 
 
 		 603 aa  281  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  37.05 
 
 		 948 aa  281  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  36.62 
 
 		 1503 aa  281  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.67 
 
 		 942 aa  278  9e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.49 
 
 		 818 aa  278  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  37 
 
 		 948 aa  277  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.66 
 
 		 1052 aa  275  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0532  extracellular nuclease, putative  34.87 
 
 		 622 aa  274  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  36.59 
 
 		 948 aa  273  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.54 
 
 		 604 aa  272  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  36.17 
 
 		 948 aa  271  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.65 
 
 		 1525 aa  271  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  28 
 
 		 1652 aa  271  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.6 
 
 		 604 aa  271  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.91 
 
 		 1284 aa  267  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.11 
 
 		 604 aa  267  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.26 
 
 		 604 aa  266  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.95 
 
 		 604 aa  266  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.95 
 
 		 604 aa  266  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.44 
 
 		 600 aa  264  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187879  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2286  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.23 
 
 		 621 aa  265  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  27.6 
 
 		 1512 aa  263  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5536  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.97 
 
 		 627 aa  263  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.8971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.69 
 
 		 653 aa  261  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.96 
 
 		 586 aa  261  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  27.45 
 
 		 1577 aa  259  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0934  extracellular nuclease  35.56 
 
 		 514 aa  258  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  28.05 
 
 		 1591 aa  255  8.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3810  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.44 
 
 		 599 aa  249  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4553  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.44 
 
 		 620 aa  249  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3714  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.28 
 
 		 620 aa  246  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.89 
 
 		 1795 aa  244  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.6 
 
 		 868 aa  243  5.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  30.5 
 
 		 1577 aa  242  5.999999999999999e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  38.62 
 
 		 2911 aa  242  5.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0854  5'-Nucleotidase domain protein  33.43 
 
 		 619 aa  242  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0825  5'-Nucleotidase domain protein  33.43 
 
 		 619 aa  242  9e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  27.04 
 
 		 1506 aa  240  3e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.54 
 
 		 929 aa  236  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  39.86 
 
 		 1079 aa  233  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.12 
 
 		 2678 aa  229  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1235  5'-Nucleotidase domain protein  32.03 
 
 		 613 aa  221  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.798144  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  42.67 
 
 		 2105 aa  213  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  44.39 
 
 		 1424 aa  210  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  36.4 
 
 		 556 aa  206  5e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  30.21 
 
 		 869 aa  196  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  38.04 
 
 		 946 aa  195  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  28.86 
 
 		 984 aa  194  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  29.52 
 
 		 902 aa  192  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>