134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002273 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  48.38 
 
 		 871 aa  751    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50 
 
 		 873 aa  799    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.77 
 
 		 870 aa  768    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.77 
 
 		 870 aa  767    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.18 
 
 		 870 aa  786    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.65 
 
 		 870 aa  766    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  49.01 
 
 		 865 aa  780    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.48 
 
 		 870 aa  764    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.34 
 
 		 871 aa  824    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.77 
 
 		 876 aa  772    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  50.77 
 
 		 869 aa  811    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.36 
 
 		 870 aa  762    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00081  nuclease  86.37 
 
 		 982 aa  1691    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.93 
 
 		 885 aa  761    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.71 
 
 		 892 aa  753    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.36 
 
 		 870 aa  761    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.02 
 
 		 894 aa  732    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  100 
 
 		 984 aa  2015    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1364  putative exported nuclease  59.35 
 
 		 890 aa  1011    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.36 
 
 		 870 aa  764    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.02 
 
 		 1010 aa  612  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.434546 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.82 
 
 		 942 aa  365  3e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  33.99 
 
 		 780 aa  348  3e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  34.44 
 
 		 948 aa  346  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  33.79 
 
 		 948 aa  343  7e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.06 
 
 		 944 aa  343  9e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  34.4 
 
 		 948 aa  341  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  33.95 
 
 		 944 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  34.25 
 
 		 948 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  33.72 
 
 		 944 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.87 
 
 		 940 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  33.72 
 
 		 944 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  33.49 
 
 		 944 aa  337  5e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.23 
 
 		 955 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  33.53 
 
 		 780 aa  337  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.74 
 
 		 947 aa  333  8e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.6 
 
 		 945 aa  327  5e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  32.63 
 
 		 1310 aa  323  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.63 
 
 		 1075 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01770  predicted extracellular nuclease  31.19 
 
 		 863 aa  320  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.609758  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  32.59 
 
 		 1346 aa  318  4e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.81 
 
 		 826 aa  314  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.19 
 
 		 818 aa  296  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.73 
 
 		 818 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.78 
 
 		 848 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  31.63 
 
 		 1503 aa  280  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.05 
 
 		 1641 aa  277  9e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.97 
 
 		 601 aa  267  8e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.8 
 
 		 1266 aa  263  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.16 
 
 		 1641 aa  257  6e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.38 
 
 		 1148 aa  247  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  30.91 
 
 		 795 aa  245  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.7 
 
 		 1052 aa  245  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.44 
 
 		 1148 aa  245  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.21 
 
 		 2346 aa  244  7.999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.05 
 
 		 942 aa  241  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.56 
 
 		 641 aa  233  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.49 
 
 		 604 aa  230  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.23 
 
 		 624 aa  230  9e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  31.93 
 
 		 624 aa  230  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  31.93 
 
 		 624 aa  230  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  31.93 
 
 		 624 aa  230  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  32.23 
 
 		 624 aa  230  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.93 
 
 		 624 aa  230  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.95 
 
 		 604 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.49 
 
 		 604 aa  226  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.49 
 
 		 604 aa  226  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.72 
 
 		 603 aa  226  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.34 
 
 		 604 aa  226  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535753 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.29 
 
 		 604 aa  225  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.63 
 
 		 1284 aa  223  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0532  extracellular nuclease, putative  32.23 
 
 		 622 aa  220  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.47 
 
 		 573 aa  213  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2843  extracellular nuclease-like  27.44 
 
 		 945 aa  209  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0894144  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3281  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.34 
 
 		 1123 aa  209  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0934  extracellular nuclease  32.7 
 
 		 514 aa  209  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3714  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.8 
 
 		 620 aa  204  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495775 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3810  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.95 
 
 		 599 aa  204  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4553  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.8 
 
 		 620 aa  204  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2286  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.16 
 
 		 621 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  28.09 
 
 		 1525 aa  202  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.69 
 
 		 600 aa  199  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187879  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  30.17 
 
 		 1512 aa  197  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.24 
 
 		 929 aa  196  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  28.32 
 
 		 2667 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5536  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.56 
 
 		 627 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.8971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  28.59 
 
 		 2775 aa  193  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  30 
 
 		 1591 aa  189  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.82 
 
 		 653 aa  188  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240387  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.64 
 
 		 868 aa  186  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  29.6 
 
 		 2796 aa  183  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  28.61 
 
 		 1652 aa  182  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  27.85 
 
 		 1577 aa  178  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  26.45 
 
 		 1577 aa  170  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  30.33 
 
 		 1506 aa  170  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.08 
 
 		 586 aa  163  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0201  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.98 
 
 		 481 aa  150  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.418254  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  27.02 
 
 		 902 aa  139  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1188  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.54 
 
 		 575 aa  136  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219404  normal  0.0718602 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03816  nuclease  26.4 
 
 		 572 aa  136  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>