More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3665 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
1052 aa  2088    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.9 
 
 
1073 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1000  hypothetical protein  41.92 
 
 
1076 aa  451  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.55 
 
 
1795 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5836  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.36 
 
 
592 aa  348  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  35.97 
 
 
788 aa  342  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.82 
 
 
788 aa  341  5e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.02 
 
 
788 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.86 
 
 
788 aa  338  5e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  35.5 
 
 
788 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.24 
 
 
790 aa  337  7.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.19 
 
 
647 aa  335  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220034  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.5 
 
 
788 aa  334  6e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  35.34 
 
 
788 aa  333  8e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  35.18 
 
 
788 aa  333  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.25 
 
 
788 aa  331  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1075  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.25 
 
 
583 aa  331  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3663  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  36.99 
 
 
586 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00731274  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15630  predicted extracellular nuclease  35.42 
 
 
802 aa  280  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.35443  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  31.14 
 
 
2667 aa  280  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.25 
 
 
810 aa  277  9e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0195  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.39 
 
 
821 aa  267  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937646  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  82.53 
 
 
2345 aa  263  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.86 
 
 
940 aa  261  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.799398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  31.52 
 
 
2775 aa  260  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1932  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.89 
 
 
802 aa  245  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09210)  33.28 
 
 
600 aa  220  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174042  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1073  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.33 
 
 
597 aa  213  1e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0085  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.68 
 
 
598 aa  206  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.33 
 
 
868 aa  144  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.67 
 
 
1284 aa  129  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.6 
 
 
601 aa  118  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.91 
 
 
1266 aa  108  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2121  hemolysin-type calcium-binding region  45.39 
 
 
368 aa  107  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190728  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4655  hemolysin-type calcium-binding region  46.5 
 
 
375 aa  106  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  27.05 
 
 
795 aa  106  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.86 
 
 
641 aa  104  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.89 
 
 
942 aa  103  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.48 
 
 
942 aa  102  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4762  hemolysin-type calcium-binding region  43.15 
 
 
172 aa  99  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.73 
 
 
1148 aa  97.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.82 
 
 
1148 aa  94.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.79 
 
 
573 aa  93.6  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  25.82 
 
 
1310 aa  92.4  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  31.12 
 
 
1087 aa  91.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  43.97 
 
 
2796 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.77 
 
 
1075 aa  89.4  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  46.61 
 
 
1838 aa  89  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.34 
 
 
1052 aa  87.8  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.18 
 
 
944 aa  87  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  25.08 
 
 
948 aa  85.1  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.84 
 
 
947 aa  84.7  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  24.6 
 
 
944 aa  84.7  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.84 
 
 
586 aa  84.7  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  26.43 
 
 
1346 aa  84  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  24.29 
 
 
944 aa  84  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  25.24 
 
 
948 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  45.13 
 
 
1933 aa  82.4  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.84 
 
 
2346 aa  82  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.19 
 
 
940 aa  82  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  24.11 
 
 
944 aa  81.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  24.78 
 
 
948 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.55 
 
 
955 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  24.76 
 
 
944 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.28 
 
 
1641 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  25.41 
 
 
871 aa  77  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.12 
 
 
1641 aa  76.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.88 
 
 
826 aa  75.5  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  24.44 
 
 
948 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01770  predicted extracellular nuclease  25.37 
 
 
863 aa  75.1  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.609758  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  40.71 
 
 
692 aa  74.7  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.19 
 
 
876 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  26.31 
 
 
1503 aa  73.6  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03816  nuclease  25.3 
 
 
572 aa  73.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  25.51 
 
 
780 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  25.81 
 
 
780 aa  72.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  24.92 
 
 
1506 aa  72  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  24.16 
 
 
865 aa  72  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  35.71 
 
 
1699 aa  71.2  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.21 
 
 
885 aa  71.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.17 
 
 
945 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  51.32 
 
 
5839 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  35.71 
 
 
7284 aa  68.9  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.61 
 
 
892 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  47.83 
 
 
1166 aa  68.6  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  48.68 
 
 
2768 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.08 
 
 
1092 aa  67.8  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  25.09 
 
 
869 aa  67.4  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  32.8 
 
 
5442 aa  67.8  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.62 
 
 
870 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  47.78 
 
 
6662 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.62 
 
 
870 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.78 
 
 
6683 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.78 
 
 
2239 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  47.78 
 
 
6779 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  38.46 
 
 
1587 aa  66.6  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4119  hypothetical protein  37.8 
 
 
129 aa  66.6  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0916185  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.1 
 
 
3977 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  49.28 
 
 
4798 aa  66.6  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.54 
 
 
870 aa  66.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>