More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4762 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4762  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
172 aa  337  4e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  40.13 
 
 
2345 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2121  hemolysin-type calcium-binding region  42.96 
 
 
368 aa  99.8  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190728  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.15 
 
 
1052 aa  99  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4119  hypothetical protein  43.08 
 
 
129 aa  84  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0916185  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4655  hemolysin-type calcium-binding region  43.36 
 
 
375 aa  75.9  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  53.75 
 
 
2452 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  39.66 
 
 
424 aa  60.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  34.16 
 
 
760 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  29.81 
 
 
608 aa  58.5  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  35.81 
 
 
2667 aa  58.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  44.74 
 
 
833 aa  58.5  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.57 
 
 
1236 aa  57.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  48.68 
 
 
1699 aa  57.8  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  49.38 
 
 
8682 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2843  hypothetical protein  45.88 
 
 
132 aa  57.4  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0331098  normal  0.0204354 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0412  beta-Ig-H3/fasciclin  45.57 
 
 
510 aa  57.4  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.821212  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  41.84 
 
 
4334 aa  57  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.04 
 
 
588 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  44.32 
 
 
280 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  46.25 
 
 
547 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  44.32 
 
 
280 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  56.36 
 
 
942 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  48.15 
 
 
9030 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  50.85 
 
 
1855 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  46.05 
 
 
5171 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  47.3 
 
 
539 aa  55.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  41.24 
 
 
2954 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  51.35 
 
 
928 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  34.9 
 
 
2885 aa  55.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  49.21 
 
 
5839 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  54.72 
 
 
679 aa  54.7  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  45.57 
 
 
243 aa  54.7  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  47.3 
 
 
7919 aa  54.3  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  53.33 
 
 
245 aa  54.7  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  36.31 
 
 
677 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  37.63 
 
 
553 aa  54.3  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  36.42 
 
 
1145 aa  54.3  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  51.79 
 
 
585 aa  54.3  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  45.76 
 
 
4798 aa  53.9  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  37.04 
 
 
542 aa  54.3  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  52.83 
 
 
582 aa  53.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  44.58 
 
 
7679 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  44.3 
 
 
5218 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  42.31 
 
 
1029 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  42.68 
 
 
850 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  40.37 
 
 
767 aa  53.9  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.31 
 
 
1029 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  53.7 
 
 
1963 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3106  hemolysin-type calcium-binding region  42.27 
 
 
375 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  56.86 
 
 
959 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  40.54 
 
 
727 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0060  peptidase, metallopeptidase  43.9 
 
 
421 aa  53.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210793  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  45.21 
 
 
221 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  47.37 
 
 
3314 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  46.15 
 
 
219 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  56.36 
 
 
741 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  53.45 
 
 
485 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2989  hemolysin-type calcium-binding region  48.48 
 
 
2469 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
561 aa  52.4  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  41.03 
 
 
260 aa  52.4  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  53.85 
 
 
7284 aa  52.4  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  52.83 
 
 
2567 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  43.75 
 
 
1202 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  54.55 
 
 
1079 aa  52.4  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  34.81 
 
 
759 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  48.05 
 
 
6753 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  56.86 
 
 
860 aa  52  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5172  hemolysin-type calcium-binding region  33.82 
 
 
516 aa  52  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.743168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  36 
 
 
1383 aa  52  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  49.21 
 
 
950 aa  52  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  49.15 
 
 
5962 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  46.05 
 
 
2097 aa  52  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  42.27 
 
 
2704 aa  52  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  34.68 
 
 
2542 aa  52  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 
507 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  43.53 
 
 
1610 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.84 
 
 
2668 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  37.84 
 
 
460 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  42.53 
 
 
3954 aa  51.6  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  35.16 
 
 
768 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  46.67 
 
 
1156 aa  51.2  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.59 
 
 
868 aa  51.2  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  45.78 
 
 
744 aa  51.6  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  54.9 
 
 
2950 aa  51.2  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  44.29 
 
 
1538 aa  51.2  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.05 
 
 
5787 aa  51.6  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  54.39 
 
 
946 aa  51.2  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  43.82 
 
 
855 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1622  putative hemolysin precursor  37.84 
 
 
504 aa  51.2  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0615311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  54.55 
 
 
3209 aa  51.2  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3576  hemolysin-type calcium-binding region  47.22 
 
 
547 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.996068  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  52 
 
 
1164 aa  51.2  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  46.88 
 
 
303 aa  51.2  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  56.6 
 
 
709 aa  51.2  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  35.96 
 
 
1346 aa  51.2  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1087  hemolysin-type calcium-binding region  34.88 
 
 
195 aa  51.2  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0714  Cadherin  60.42 
 
 
1134 aa  50.8  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.48369  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  46.58 
 
 
491 aa  50.8  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  51.92 
 
 
2145 aa  50.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>