More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0398 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1000  hypothetical protein  55.74 
 
 
1076 aa  1060    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
1073 aa  2096    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.75 
 
 
1052 aa  525  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.29 
 
 
1795 aa  458  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.3 
 
 
647 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220034  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5836  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.94 
 
 
592 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  39.34 
 
 
788 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  38.99 
 
 
788 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  39.16 
 
 
788 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  38.81 
 
 
788 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  38.81 
 
 
788 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.99 
 
 
788 aa  376  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.81 
 
 
788 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.81 
 
 
788 aa  376  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  38.99 
 
 
788 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1075  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  38.81 
 
 
583 aa  373  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.38 
 
 
790 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.23 
 
 
940 aa  360  6e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.799398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3663  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  38.04 
 
 
586 aa  360  7e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00731274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.23 
 
 
810 aa  337  5.999999999999999e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0195  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.64 
 
 
821 aa  337  7.999999999999999e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937646  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15630  predicted extracellular nuclease  38.13 
 
 
802 aa  334  5e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.35443  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09210)  36.35 
 
 
600 aa  314  6.999999999999999e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174042  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1932  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.27 
 
 
802 aa  303  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0085  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.63 
 
 
598 aa  234  7.000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1073  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.55 
 
 
597 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.4 
 
 
1148 aa  184  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.13 
 
 
1148 aa  183  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0543  endonuclease I  52.5 
 
 
466 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.84 
 
 
942 aa  158  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6326  Endonuclease I  49.69 
 
 
442 aa  152  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3628  Endonuclease I  45.79 
 
 
596 aa  146  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.32 
 
 
868 aa  142  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  29.23 
 
 
795 aa  140  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.15 
 
 
601 aa  138  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3281  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.01 
 
 
1123 aa  137  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310372  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.6 
 
 
1266 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.79 
 
 
947 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  26.14 
 
 
871 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.55 
 
 
1075 aa  127  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.91 
 
 
942 aa  127  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.43 
 
 
2346 aa  126  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  27.64 
 
 
1310 aa  125  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  26.03 
 
 
780 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  25.56 
 
 
780 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.29 
 
 
870 aa  116  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.29 
 
 
870 aa  115  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.05 
 
 
940 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  26.88 
 
 
1346 aa  114  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.71 
 
 
870 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.36 
 
 
573 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  25.55 
 
 
948 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.11 
 
 
870 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  47.89 
 
 
844 aa  112  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  27.03 
 
 
1503 aa  111  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.38 
 
 
870 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  25.73 
 
 
948 aa  110  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  26.64 
 
 
944 aa  110  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.78 
 
 
1284 aa  108  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.23 
 
 
870 aa  108  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.96 
 
 
955 aa  108  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.7 
 
 
945 aa  107  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  26.76 
 
 
1506 aa  107  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.93 
 
 
944 aa  107  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.08 
 
 
870 aa  107  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.54 
 
 
1641 aa  106  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  26.82 
 
 
2667 aa  106  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  24.92 
 
 
948 aa  106  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.83 
 
 
586 aa  105  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  26.24 
 
 
944 aa  105  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  26.2 
 
 
944 aa  104  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  25.41 
 
 
948 aa  103  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.34 
 
 
885 aa  103  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.29 
 
 
1525 aa  102  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.65 
 
 
876 aa  102  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.09 
 
 
826 aa  102  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  26.09 
 
 
944 aa  101  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.09 
 
 
873 aa  101  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2843  extracellular nuclease-like  24.46 
 
 
945 aa  101  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0894144  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  27.18 
 
 
1577 aa  99.4  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.48 
 
 
1091 aa  99  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.74 
 
 
641 aa  99.4  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.68 
 
 
894 aa  98.2  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.81 
 
 
871 aa  97.8  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  26.32 
 
 
2775 aa  97.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.69 
 
 
1641 aa  95.9  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.15 
 
 
1092 aa  95.9  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.41 
 
 
870 aa  94.7  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  24.08 
 
 
865 aa  94.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.19 
 
 
1052 aa  94  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.68 
 
 
892 aa  92.4  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01770  predicted extracellular nuclease  25.41 
 
 
863 aa  89.7  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.609758  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  37.93 
 
 
4285 aa  89  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  23.6 
 
 
869 aa  87  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  36.99 
 
 
3209 aa  86.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  33.17 
 
 
1610 aa  85.5  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03816  nuclease  24.39 
 
 
572 aa  84  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1364  putative exported nuclease  22.99 
 
 
890 aa  83.2  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.31 
 
 
5839 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.76 
 
 
848 aa  82.8  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>