72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6992 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  100 
 
 		 1087 aa  2211    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0074  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.69 
 
 		 1133 aa  272  2e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659099  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.39 
 
 		 1015 aa  179  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.12 
 
 		 1052 aa  85.5  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  28.65 
 
 		 688 aa  76.6  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  29.28 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  32.16 
 
 		 1029 aa  73.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  38.6 
 
 		 4697 aa  68.6  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0220  PKD domain containing protein  36.8 
 
 		 705 aa  67.4  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0937242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  24.29 
 
 		 1668 aa  65.1  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  26.34 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  25 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  24.43 
 
 		 541 aa  64.7  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1294 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  26.4 
 
 		 1147 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  25.43 
 
 		 371 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  24.63 
 
 		 757 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  37.4 
 
 		 692 aa  63.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  26.82 
 
 		 495 aa  62.4  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  27.37 
 
 		 996 aa  62  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.77 
 
 		 1372 aa  62  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1003 aa  61.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1263 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  26.7 
 
 		 347 aa  60.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1933 aa  60.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  29.17 
 
 		 376 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  33.73 
 
 		 1055 aa  58.9  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  25.9 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  27.04 
 
 		 362 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  26.04 
 
 		 1174 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  25.57 
 
 		 408 aa  56.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.41 
 
 		 1783 aa  56.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  23.71 
 
 		 1437 aa  55.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  31.53 
 
 		 1838 aa  55.8  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  25.86 
 
 		 1433 aa  55.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  29.85 
 
 		 2852 aa  54.3  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  30 
 
 		 1587 aa  54.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  30.52 
 
 		 394 aa  54.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  26.9 
 
 		 1296 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  27.74 
 
 		 1575 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  25.27 
 
 		 803 aa  53.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  30.93 
 
 		 366 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.64 
 
 		 1795 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  22.03 
 
 		 477 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  28.07 
 
 		 2667 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0295  Laminin G sub domain 2  25.56 
 
 		 545 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.252604  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  24.75 
 
 		 336 aa  50.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  24.07 
 
 		 634 aa  50.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  23.73 
 
 		 558 aa  49.7  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  26.28 
 
 		 571 aa  49.7  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  29.34 
 
 		 665 aa  49.3  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  27.49 
 
 		 367 aa  48.9  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  27.37 
 
 		 341 aa  48.9  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1215 aa  48.9  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  31.19 
 
 		 1557 aa  48.5  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  24.17 
 
 		 3977 aa  48.5  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  38.89 
 
 		 254 aa  48.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  24.42 
 
 		 647 aa  48.1  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  23.18 
 
 		 501 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  26.09 
 
 		 686 aa  48.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  21.81 
 
 		 646 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.84 
 
 		 900 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  25 
 
 		 846 aa  47  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  25.26 
 
 		 543 aa  47.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  25.61 
 
 		 324 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  31.76 
 
 		 2839 aa  46.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  31.71 
 
 		 657 aa  46.6  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  31.76 
 
 		 308 aa  45.8  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1235  hypothetical protein  29.95 
 
 		 2024 aa  45.8  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  22.91 
 
 		 725 aa  45.8  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  27.06 
 
 		 933 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  31.68 
 
 		 2796 aa  45.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>