111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3663 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3663  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  100 
 
 
586 aa  1155    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00731274  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5836  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.41 
 
 
592 aa  488  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.9 
 
 
940 aa  441  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.799398 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15630  predicted extracellular nuclease  45.22 
 
 
802 aa  418  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.35443  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0195  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.47 
 
 
821 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937646  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2406  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.23 
 
 
647 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.220034  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1932  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.2 
 
 
802 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4013  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.3 
 
 
810 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.95 
 
 
1073 aa  356  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1000  hypothetical protein  36.52 
 
 
1076 aa  313  4.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
788 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.33 
 
 
788 aa  309  8e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1075  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.33 
 
 
583 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  33.5 
 
 
788 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.85 
 
 
788 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.99 
 
 
1052 aa  306  6e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.16 
 
 
788 aa  306  7e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.16 
 
 
788 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  33.16 
 
 
788 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  33.33 
 
 
788 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.39 
 
 
790 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  32.41 
 
 
788 aa  295  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0085  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.08 
 
 
598 aa  281  2e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.13 
 
 
1795 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09210)  32.56 
 
 
600 aa  243  7.999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174042  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1073  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 
597 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.98 
 
 
947 aa  96.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  24.63 
 
 
795 aa  90.5  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.84 
 
 
826 aa  88.2  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.7 
 
 
586 aa  87.4  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.54 
 
 
1266 aa  85.9  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.11 
 
 
1148 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.11 
 
 
1148 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03816  nuclease  25.2 
 
 
572 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  25.39 
 
 
780 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.47 
 
 
573 aa  76.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  25.08 
 
 
780 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  22.31 
 
 
1310 aa  72.8  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  23.7 
 
 
948 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  23.71 
 
 
948 aa  72  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.16 
 
 
942 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  23.24 
 
 
944 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.83 
 
 
944 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  23.09 
 
 
944 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  23.44 
 
 
948 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.36 
 
 
870 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  24.11 
 
 
948 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  23.09 
 
 
944 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23 
 
 
870 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.69 
 
 
1075 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.5 
 
 
870 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23 
 
 
870 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.08 
 
 
870 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.71 
 
 
870 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  23.24 
 
 
944 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.24 
 
 
945 aa  67  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.11 
 
 
1092 aa  66.6  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.36 
 
 
870 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.27 
 
 
601 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.3 
 
 
2346 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  23.91 
 
 
865 aa  65.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.18 
 
 
955 aa  65.1  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.05 
 
 
940 aa  64.3  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  22.38 
 
 
871 aa  64.3  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.16 
 
 
868 aa  63.9  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.5 
 
 
1284 aa  62.4  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.57 
 
 
641 aa  62.8  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  23.39 
 
 
1525 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.54 
 
 
1641 aa  62  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.2 
 
 
894 aa  62  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.55 
 
 
1091 aa  61.6  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1364  putative exported nuclease  21.44 
 
 
890 aa  61.6  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.04 
 
 
603 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.5 
 
 
873 aa  60.8  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.12 
 
 
604 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25 
 
 
624 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.92 
 
 
871 aa  59.7  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  25 
 
 
624 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  25 
 
 
624 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  25 
 
 
624 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25 
 
 
624 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25 
 
 
624 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.75 
 
 
604 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.75 
 
 
604 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.75 
 
 
604 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.535753 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.83 
 
 
892 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.69 
 
 
876 aa  57.4  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.22 
 
 
604 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.71 
 
 
929 aa  55.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  22.95 
 
 
869 aa  55.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
1641 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  37.1 
 
 
2796 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  22.42 
 
 
902 aa  53.5  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  28.12 
 
 
2667 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.61 
 
 
604 aa  52.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.49 
 
 
1010 aa  52.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.434546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  28.88 
 
 
2775 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.76 
 
 
870 aa  51.2  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.38 
 
 
885 aa  50.8  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  42.53 
 
 
1577 aa  48.5  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>