136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2198 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2694  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.54 
 
 		 1010 aa  716    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.434546 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  100 
 
 		 869 aa  1795    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00081  nuclease  51.59 
 
 		 982 aa  794    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1364  putative exported nuclease  45.42 
 
 		 890 aa  719    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  51.01 
 
 		 984 aa  793    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  43.23 
 
 		 865 aa  611  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.03 
 
 		 873 aa  601  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.67 
 
 		 871 aa  590  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.35 
 
 		 870 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.44 
 
 		 870 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.77 
 
 		 870 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.32 
 
 		 870 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.5 
 
 		 870 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.09 
 
 		 870 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.87 
 
 		 876 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.66 
 
 		 870 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.66 
 
 		 870 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  40.41 
 
 		 871 aa  560  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.62 
 
 		 892 aa  531  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.98 
 
 		 894 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.95 
 
 		 885 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.439448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.64 
 
 		 1075 aa  342  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.66 
 
 		 947 aa  343  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  33.69 
 
 		 1310 aa  342  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  34.28 
 
 		 944 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  34.17 
 
 		 944 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.71 
 
 		 944 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  33.26 
 
 		 948 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.07 
 
 		 942 aa  337  5e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  33.79 
 
 		 944 aa  337  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  33.33 
 
 		 948 aa  335  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  33.83 
 
 		 944 aa  334  4e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  34.23 
 
 		 780 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.79 
 
 		 945 aa  331  4e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  33.03 
 
 		 948 aa  328  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  33.53 
 
 		 780 aa  327  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  32.88 
 
 		 948 aa  326  9e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.72 
 
 		 940 aa  326  9e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.11 
 
 		 955 aa  323  7e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  33.02 
 
 		 1346 aa  322  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01770  predicted extracellular nuclease  30.92 
 
 		 863 aa  313  9e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.609758  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.58 
 
 		 826 aa  290  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.95 
 
 		 848 aa  281  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  31.11 
 
 		 1503 aa  274  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.02 
 
 		 818 aa  272  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.62 
 
 		 1641 aa  267  5.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.65 
 
 		 818 aa  266  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.02 
 
 		 1641 aa  255  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.91 
 
 		 1052 aa  238  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.29 
 
 		 1148 aa  237  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.32 
 
 		 601 aa  236  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.69 
 
 		 641 aa  231  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.88 
 
 		 1148 aa  231  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.59 
 
 		 1266 aa  227  9e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.06 
 
 		 2346 aa  226  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.29 
 
 		 1284 aa  224  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  30.97 
 
 		 795 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  31.7 
 
 		 624 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  31.7 
 
 		 624 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  31.7 
 
 		 624 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.59 
 
 		 624 aa  219  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.7 
 
 		 624 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.59 
 
 		 624 aa  218  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.95 
 
 		 604 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.41 
 
 		 604 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.11 
 
 		 604 aa  214  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.11 
 
 		 604 aa  214  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0532  extracellular nuclease, putative  31.09 
 
 		 622 aa  212  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.56 
 
 		 604 aa  211  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.68 
 
 		 603 aa  211  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.86 
 
 		 604 aa  210  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  29 
 
 		 2667 aa  197  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.69 
 
 		 573 aa  197  7e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.07 
 
 		 653 aa  197  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240387  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0934  extracellular nuclease  32.03 
 
 		 514 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  28.98 
 
 		 1512 aa  193  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  29.4 
 
 		 2775 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.97 
 
 		 942 aa  192  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.71 
 
 		 600 aa  190  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187879  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  27.89 
 
 		 1525 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2843  extracellular nuclease-like  25.64 
 
 		 945 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0894144  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  27.21 
 
 		 1591 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  30.22 
 
 		 2796 aa  185  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5536  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.08 
 
 		 627 aa  184  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.8971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  27.4 
 
 		 1652 aa  183  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2286  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.51 
 
 		 621 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.86 
 
 		 868 aa  177  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  28.36 
 
 		 1577 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  27.41 
 
 		 1577 aa  176  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4553  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.68 
 
 		 620 aa  173  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3810  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.68 
 
 		 599 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.95 
 
 		 586 aa  171  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3714  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.79 
 
 		 620 aa  170  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495775 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3281  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.89 
 
 		 1123 aa  169  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0697  5'-Nucleotidase domain protein  28.53 
 
 		 1506 aa  167  9e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.208594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.84 
 
 		 929 aa  165  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03816  nuclease  28.17 
 
 		 572 aa  141  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  26.15 
 
 		 902 aa  138  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0201  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.92 
 
 		 481 aa  136  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.418254  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1737  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.09 
 
 		 570 aa  132  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.979917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>