More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2372 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  100 
 
 		 2796 aa  5518    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  55.56 
 
 		 2667 aa  777    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  54.94 
 
 		 2775 aa  748    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2843  extracellular nuclease-like  46.92 
 
 		 945 aa  509  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0894144  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  42.46 
 
 		 1355 aa  460  1e-127  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1464  5'-Nucleotidase domain protein  40.79 
 
 		 657 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  41.94 
 
 		 808 aa  437  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.32 
 
 		 1148 aa  424  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.32 
 
 		 1795 aa  424  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.2 
 
 		 1148 aa  417  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.36 
 
 		 980 aa  410  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.75 
 
 		 2346 aa  405  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6734  5'-Nucleotidase domain protein  37.73 
 
 		 726 aa  399  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0580  alkaline phosphatase  38.47 
 
 		 748 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00489448 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.17 
 
 		 3977 aa  397  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.36 
 
 		 1641 aa  394  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.17 
 
 		 1641 aa  389  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  58.24 
 
 		 2342 aa  385  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  57.95 
 
 		 2342 aa  385  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3214  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.31 
 
 		 668 aa  388  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  41.13 
 
 		 780 aa  383  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  37.7 
 
 		 2852 aa  381  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  40.66 
 
 		 780 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.91 
 
 		 1075 aa  372  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.77 
 
 		 1266 aa  366  4e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  59.21 
 
 		 1806 aa  364  1e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.5 
 
 		 641 aa  364  1e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  58.88 
 
 		 1632 aa  362  7e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3281  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.49 
 
 		 1123 aa  360  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.7 
 
 		 601 aa  351  9e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.88 
 
 		 942 aa  341  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.02 
 
 		 944 aa  333  4e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.54 
 
 		 573 aa  329  5e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  38.76 
 
 		 944 aa  326  5e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  38.76 
 
 		 944 aa  324  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  38.76 
 
 		 944 aa  323  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  38.91 
 
 		 944 aa  323  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.68 
 
 		 1052 aa  322  9e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  36.18 
 
 		 1310 aa  320  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  40.51 
 
 		 592 aa  319  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  37.04 
 
 		 795 aa  318  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  38.36 
 
 		 948 aa  317  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  38.52 
 
 		 948 aa  316  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.24 
 
 		 947 aa  311  9e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  42.28 
 
 		 539 aa  310  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  38.5 
 
 		 948 aa  310  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  38.21 
 
 		 948 aa  309  6e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  37.13 
 
 		 1503 aa  307  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  42.08 
 
 		 539 aa  307  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.79 
 
 		 945 aa  302  8e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  37.66 
 
 		 1346 aa  300  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.7 
 
 		 942 aa  296  5e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.73 
 
 		 826 aa  295  6e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  38.7 
 
 		 576 aa  294  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36 
 
 		 940 aa  287  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.32 
 
 		 955 aa  287  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  39.89 
 
 		 546 aa  286  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  39.39 
 
 		 533 aa  284  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.87 
 
 		 1284 aa  280  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  34.97 
 
 		 624 aa  279  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.97 
 
 		 624 aa  279  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  34.97 
 
 		 624 aa  279  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  34.97 
 
 		 624 aa  279  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.97 
 
 		 624 aa  279  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0532  extracellular nuclease, putative  34.55 
 
 		 622 aa  278  9e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.81 
 
 		 624 aa  278  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  36.52 
 
 		 633 aa  275  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.38 
 
 		 603 aa  273  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.4 
 
 		 868 aa  268  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.86 
 
 		 604 aa  266  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.33 
 
 		 848 aa  266  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  36.28 
 
 		 551 aa  265  8.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  36.74 
 
 		 1322 aa  264  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.63 
 
 		 818 aa  263  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  37.84 
 
 		 857 aa  263  5.0000000000000005e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.76 
 
 		 604 aa  261  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.76 
 
 		 604 aa  261  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.76 
 
 		 604 aa  261  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.38 
 
 		 818 aa  258  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.38 
 
 		 604 aa  258  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.71 
 
 		 604 aa  256  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  33.7 
 
 		 575 aa  254  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  40.92 
 
 		 2701 aa  254  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  36.07 
 
 		 624 aa  254  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 629 aa  253  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  35.5 
 
 		 624 aa  253  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.17 
 
 		 653 aa  250  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240387  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  38.34 
 
 		 1587 aa  250  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  36.01 
 
 		 624 aa  250  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0934  extracellular nuclease  35.09 
 
 		 514 aa  249  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  36.19 
 
 		 624 aa  249  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  34.83 
 
 		 635 aa  244  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  37.89 
 
 		 567 aa  242  6.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.59 
 
 		 774 aa  242  6.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  36.06 
 
 		 624 aa  241  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.12 
 
 		 586 aa  241  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2286  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.91 
 
 		 621 aa  240  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  35.75 
 
 		 624 aa  239  7e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5536  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.7 
 
 		 627 aa  238  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.8971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  39.48 
 
 		 2182 aa  238  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>