86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2477 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  57.37 
 
 
622 aa  722    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  100 
 
 
633 aa  1277    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  49.52 
 
 
576 aa  475  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  45.7 
 
 
1355 aa  437  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  42.73 
 
 
629 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  44.01 
 
 
592 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  46.48 
 
 
533 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  44.19 
 
 
774 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  44.06 
 
 
551 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  43.15 
 
 
539 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  43.75 
 
 
1587 aa  403  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  42.98 
 
 
539 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  41.04 
 
 
546 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  41.16 
 
 
600 aa  381  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  41.28 
 
 
635 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  41.9 
 
 
567 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  39.72 
 
 
1322 aa  367  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  40.43 
 
 
624 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  40.78 
 
 
857 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  40.1 
 
 
624 aa  363  4e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  40.67 
 
 
627 aa  362  9e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  38.93 
 
 
624 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  38.78 
 
 
624 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  40.46 
 
 
624 aa  359  8e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  38.62 
 
 
624 aa  359  8e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  39.93 
 
 
624 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  38.05 
 
 
624 aa  352  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  37.83 
 
 
624 aa  349  7e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  38.25 
 
 
598 aa  341  2.9999999999999998e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  36.57 
 
 
575 aa  340  5.9999999999999996e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  38.12 
 
 
501 aa  339  8e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  34.81 
 
 
621 aa  325  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  36.2 
 
 
589 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  35.74 
 
 
589 aa  319  1e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  35.03 
 
 
506 aa  319  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  37.33 
 
 
498 aa  318  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  34.84 
 
 
601 aa  316  9.999999999999999e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  34.18 
 
 
600 aa  306  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  33.48 
 
 
622 aa  297  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  37.65 
 
 
2182 aa  290  6e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  37.09 
 
 
2701 aa  287  5e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  34.67 
 
 
599 aa  283  7.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  36.17 
 
 
2796 aa  274  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.47 
 
 
1795 aa  261  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  54.36 
 
 
1175 aa  240  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  41.39 
 
 
2852 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.74 
 
 
3977 aa  143  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  21.86 
 
 
721 aa  94.7  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  30.61 
 
 
423 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  25.58 
 
 
776 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  27.39 
 
 
775 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.69 
 
 
1641 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.04 
 
 
1641 aa  63.9  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  31.37 
 
 
723 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  31.37 
 
 
723 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  27.73 
 
 
793 aa  61.2  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  31.37 
 
 
720 aa  60.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  25.09 
 
 
729 aa  59.7  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  30.94 
 
 
754 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  25.09 
 
 
729 aa  59.3  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  32.47 
 
 
723 aa  59.3  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  32.71 
 
 
754 aa  58.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  25.6 
 
 
760 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  27.27 
 
 
732 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  26.88 
 
 
732 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  31.41 
 
 
733 aa  53.5  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.4 
 
 
1170 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  25 
 
 
721 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  30.4 
 
 
719 aa  52.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.45 
 
 
347 aa  51.6  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  26.6 
 
 
731 aa  50.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6812  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.82 
 
 
363 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.444472  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.48 
 
 
348 aa  49.7  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.76 
 
 
517 aa  47.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.71 
 
 
348 aa  47.4  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  24.49 
 
 
387 aa  47.4  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.62 
 
 
689 aa  46.2  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3065  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.42 
 
 
356 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  24.68 
 
 
479 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  29.49 
 
 
1189 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.4 
 
 
348 aa  44.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  25.6 
 
 
810 aa  44.3  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0690  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.61 
 
 
299 aa  44.3  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.408931 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  23.11 
 
 
580 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3533  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.62 
 
 
488 aa  43.9  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.04 
 
 
384 aa  43.5  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>