103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0978 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  100 
 
 
498 aa  1009    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  51.59 
 
 
506 aa  503  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  52 
 
 
501 aa  498  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  53.23 
 
 
1587 aa  473  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  42.8 
 
 
1322 aa  381  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  44.71 
 
 
539 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  42.68 
 
 
592 aa  378  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  44.51 
 
 
539 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  45.38 
 
 
546 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  40.18 
 
 
576 aa  358  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  43.3 
 
 
533 aa  353  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  38.89 
 
 
575 aa  343  5.999999999999999e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  43.57 
 
 
1355 aa  341  1e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  39.84 
 
 
551 aa  333  6e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  41.63 
 
 
857 aa  327  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  37.79 
 
 
633 aa  316  6e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 
629 aa  301  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  34.16 
 
 
622 aa  300  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  37.43 
 
 
624 aa  300  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  39.72 
 
 
2701 aa  290  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.07 
 
 
774 aa  290  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  38.58 
 
 
624 aa  290  6e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  36.96 
 
 
600 aa  289  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  38.58 
 
 
624 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  36.56 
 
 
567 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  37.5 
 
 
624 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  37.69 
 
 
624 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  37.69 
 
 
624 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  38.46 
 
 
624 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  35.63 
 
 
635 aa  281  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  38.27 
 
 
624 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  37.96 
 
 
624 aa  279  7e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  35 
 
 
627 aa  265  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.76 
 
 
1795 aa  262  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  36.14 
 
 
601 aa  261  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  35.8 
 
 
599 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  36.21 
 
 
589 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  37.42 
 
 
2182 aa  254  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  33.83 
 
 
589 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  31.08 
 
 
598 aa  246  6.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  32.68 
 
 
621 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  31.42 
 
 
622 aa  239  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  35.33 
 
 
2796 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  33.02 
 
 
600 aa  230  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  43.95 
 
 
1175 aa  190  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  27.94 
 
 
423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.81 
 
 
1641 aa  140  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  29.85 
 
 
723 aa  126  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.15 
 
 
1641 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  37.6 
 
 
2852 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.3 
 
 
3977 aa  120  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  29.06 
 
 
723 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  29.06 
 
 
723 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  26.3 
 
 
775 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  28.28 
 
 
760 aa  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  25.9 
 
 
733 aa  111  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  26.7 
 
 
719 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  27.09 
 
 
721 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  27.5 
 
 
754 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  27 
 
 
754 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  26.55 
 
 
720 aa  101  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  42.5 
 
 
776 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  26.46 
 
 
793 aa  94.7  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  26.54 
 
 
732 aa  87  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  25.71 
 
 
729 aa  80.1  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  25.96 
 
 
729 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  40.46 
 
 
731 aa  78.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  38.17 
 
 
732 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  21.91 
 
 
721 aa  60.1  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.82 
 
 
347 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.82 
 
 
329 aa  55.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.48 
 
 
332 aa  53.5  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2496  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.33 
 
 
357 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.33 
 
 
357 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.4 
 
 
354 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.81 
 
 
335 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  23.1 
 
 
354 aa  49.7  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.56 
 
 
345 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.67 
 
 
328 aa  48.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.5 
 
 
362 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.82 
 
 
348 aa  47.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4869  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.17 
 
 
362 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.130812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.28 
 
 
348 aa  47.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.41 
 
 
348 aa  47  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  25.13 
 
 
329 aa  46.6  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  24.22 
 
 
387 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.86 
 
 
328 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  25.2 
 
 
580 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25 
 
 
324 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.17 
 
 
328 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.47 
 
 
327 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.27 
 
 
328 aa  44.3  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.85 
 
 
366 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  24.77 
 
 
776 aa  44.3  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  25.48 
 
 
306 aa  43.9  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1947  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.79 
 
 
321 aa  43.9  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107167  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.37 
 
 
329 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6194  hypothetical protein  25.91 
 
 
348 aa  43.9  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209099  hitchhiker  0.000235981 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0062  hypothetical protein  22.5 
 
 
345 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.37 
 
 
329 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>