85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6653 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  100 
 
 		 501 aa  1012    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  57.43 
 
 		 506 aa  568  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  52.8 
 
 		 498 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  53.7 
 
 		 1587 aa  455  1.0000000000000001e-126  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  48.11 
 
 		 592 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  46.6 
 
 		 539 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  46.39 
 
 		 539 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  48 
 
 		 546 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  44.35 
 
 		 1322 aa  388  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  42.04 
 
 		 857 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  44.86 
 
 		 1355 aa  367  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  43.58 
 
 		 576 aa  354  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  39.96 
 
 		 633 aa  350  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  42.38 
 
 		 533 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  39.25 
 
 		 551 aa  333  6e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  37.89 
 
 		 622 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  38.8 
 
 		 575 aa  331  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 629 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  39.22 
 
 		 600 aa  311  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  38.31 
 
 		 635 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  39.62 
 
 		 774 aa  309  8e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  44.19 
 
 		 2701 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  38.92 
 
 		 624 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  39.69 
 
 		 624 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  39.03 
 
 		 627 aa  300  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  41.24 
 
 		 2182 aa  292  9e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  38.61 
 
 		 624 aa  290  4e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  37.21 
 
 		 567 aa  290  6e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  38.61 
 
 		 624 aa  290  6e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  39.69 
 
 		 624 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  39.88 
 
 		 624 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  39.69 
 
 		 624 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  39.88 
 
 		 624 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  39.15 
 
 		 624 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  36.43 
 
 		 621 aa  266  5e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  33.28 
 
 		 598 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  37.47 
 
 		 601 aa  262  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  35.73 
 
 		 589 aa  257  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  34.47 
 
 		 622 aa  253  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  35.85 
 
 		 599 aa  251  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  35.5 
 
 		 589 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  32.45 
 
 		 600 aa  242  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.68 
 
 		 1795 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  35.52 
 
 		 2796 aa  232  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  48.67 
 
 		 1175 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.8 
 
 		 3977 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  27.85 
 
 		 423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.62 
 
 		 1641 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.78 
 
 		 1641 aa  130  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  35.51 
 
 		 2852 aa  125  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  27.55 
 
 		 754 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  27.63 
 
 		 754 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  27 
 
 		 723 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  27 
 
 		 723 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  27.63 
 
 		 793 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  24.68 
 
 		 775 aa  111  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  25.75 
 
 		 723 aa  110  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  26.09 
 
 		 760 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  25.75 
 
 		 776 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  25.06 
 
 		 721 aa  100  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  25.42 
 
 		 733 aa  96.3  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  25 
 
 		 719 aa  94.7  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  27.12 
 
 		 731 aa  94.7  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  26.86 
 
 		 732 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  25.34 
 
 		 720 aa  85.1  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  27.19 
 
 		 732 aa  74.7  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  37.4 
 
 		 729 aa  71.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  36.8 
 
 		 729 aa  68.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  26.56 
 
 		 387 aa  50.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0690  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.03 
 
 		 299 aa  49.7  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.408931 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.43 
 
 		 345 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.81 
 
 		 334 aa  48.9  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.58 
 
 		 345 aa  47.4  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.6 
 
 		 338 aa  47.4  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.66 
 
 		 348 aa  46.6  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.29 
 
 		 347 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.85 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2785  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.36 
 
 		 341 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0917922  hitchhiker  0.00370167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.26 
 
 		 328 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  27.21 
 
 		 412 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  27.04 
 
 		 354 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1252  putative signal peptide protein  28.39 
 
 		 330 aa  44.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603691  normal  0.989203 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.5 
 
 		 320 aa  44.3  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3685  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.25 
 
 		 384 aa  44.3  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.54 
 
 		 362 aa  43.5  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>