84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0744 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  100 
 
 		 1322 aa  2658    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  48.36 
 
 		 592 aa  469  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  48.14 
 
 		 539 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  48.14 
 
 		 539 aa  430  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  45.66 
 
 		 533 aa  425  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  47.78 
 
 		 1587 aa  421  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  44.89 
 
 		 576 aa  418  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  45.02 
 
 		 1355 aa  414  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  49.6 
 
 		 546 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 629 aa  411  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  44.8 
 
 		 551 aa  403  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  40.39 
 
 		 575 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  42.8 
 
 		 498 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  43.7 
 
 		 857 aa  382  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  40.07 
 
 		 622 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  44.35 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  43.24 
 
 		 506 aa  373  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  39.72 
 
 		 633 aa  366  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  40.84 
 
 		 567 aa  361  5e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  39.39 
 
 		 624 aa  342  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  39.26 
 
 		 774 aa  340  8e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  39.59 
 
 		 600 aa  338  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  38.62 
 
 		 624 aa  332  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  37.79 
 
 		 635 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  39.2 
 
 		 624 aa  319  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  39.77 
 
 		 624 aa  319  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  38.81 
 
 		 624 aa  319  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  39.01 
 
 		 624 aa  318  6e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  39.77 
 
 		 624 aa  317  7e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  38.24 
 
 		 624 aa  311  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  38.43 
 
 		 624 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  35.2 
 
 		 598 aa  302  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  38.23 
 
 		 627 aa  302  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  36.61 
 
 		 600 aa  295  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  40.42 
 
 		 2701 aa  291  8e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  35.91 
 
 		 601 aa  290  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  35.07 
 
 		 621 aa  290  2e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  40.04 
 
 		 2182 aa  282  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  35.19 
 
 		 589 aa  282  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  35.74 
 
 		 589 aa  276  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.86 
 
 		 1795 aa  275  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  33.93 
 
 		 622 aa  273  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  36.09 
 
 		 2796 aa  255  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  32.62 
 
 		 599 aa  251  8e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  48.44 
 
 		 1175 aa  216  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  38.27 
 
 		 3977 aa  138  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  37.45 
 
 		 2852 aa  125  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  27.08 
 
 		 423 aa  114  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.34 
 
 		 1641 aa  103  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  25.26 
 
 		 775 aa  103  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.4 
 
 		 1641 aa  97.8  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.23 
 
 		 2346 aa  83.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1790  hypothetical protein  36.71 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0838562 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  24.44 
 
 		 754 aa  75.5  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  24.55 
 
 		 754 aa  75.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  25 
 
 		 723 aa  69.3  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  26.03 
 
 		 776 aa  67.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  23.03 
 
 		 760 aa  64.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  27.34 
 
 		 733 aa  64.3  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  21.62 
 
 		 719 aa  58.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  31.25 
 
 		 536 aa  56.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  35.96 
 
 		 720 aa  56.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  31.08 
 
 		 723 aa  56.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  31.08 
 
 		 723 aa  55.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  32.77 
 
 		 685 aa  55.1  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  33.02 
 
 		 693 aa  54.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  36.84 
 
 		 732 aa  53.5  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  36.84 
 
 		 732 aa  53.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.85 
 
 		 3396 aa  52.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  37.62 
 
 		 731 aa  51.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  31.58 
 
 		 793 aa  50.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  37.5 
 
 		 2305 aa  49.7  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  30.77 
 
 		 2310 aa  49.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  32.89 
 
 		 1657 aa  49.3  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.41 
 
 		 1800 aa  49.3  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  30 
 
 		 1933 aa  48.5  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  32.81 
 
 		 1414 aa  48.5  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  29.63 
 
 		 767 aa  48.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.91 
 
 		 1052 aa  47.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.05 
 
 		 647 aa  46.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.37 
 
 		 2194 aa  46.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.87 
 
 		 1012 aa  45.8  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  34 
 
 		 1031 aa  46.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.57 
 
 		 1372 aa  46.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>