78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3684 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 
774 aa  1477    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  55.25 
 
 
567 aa  528  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  47.57 
 
 
551 aa  462  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  48.48 
 
 
533 aa  442  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  43.57 
 
 
592 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  48.16 
 
 
1355 aa  427  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  44.48 
 
 
633 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  46.7 
 
 
600 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  42.86 
 
 
622 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  42.4 
 
 
629 aa  402  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  42.91 
 
 
539 aa  399  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  42.72 
 
 
539 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  43.7 
 
 
857 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  45.39 
 
 
576 aa  385  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  41.37 
 
 
624 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  41.79 
 
 
624 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  42.54 
 
 
624 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  44.77 
 
 
599 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  41.61 
 
 
624 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  41.97 
 
 
546 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  41.68 
 
 
624 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  41.42 
 
 
624 aa  362  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  40.62 
 
 
624 aa  362  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  41.07 
 
 
635 aa  361  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  42.66 
 
 
1587 aa  360  7e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  41.42 
 
 
624 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  39.65 
 
 
598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  41.64 
 
 
627 aa  352  1e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  41.15 
 
 
624 aa  352  1e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  38.58 
 
 
621 aa  350  5e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  39.25 
 
 
575 aa  348  2e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  39.26 
 
 
1322 aa  342  2e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  40.14 
 
 
622 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  38.88 
 
 
601 aa  323  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  38.69 
 
 
600 aa  312  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  39.35 
 
 
501 aa  300  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  36.23 
 
 
589 aa  292  2e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  38.04 
 
 
589 aa  292  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  36.68 
 
 
498 aa  291  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  41.25 
 
 
2701 aa  279  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  36.69 
 
 
506 aa  272  1e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.25 
 
 
1795 aa  262  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  38.32 
 
 
2182 aa  258  3e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  48.16 
 
 
1175 aa  248  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  36.4 
 
 
2796 aa  239  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.74 
 
 
3977 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  36.54 
 
 
2852 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  27.9 
 
 
423 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.21 
 
 
1641 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.22 
 
 
1641 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  25.98 
 
 
775 aa  81.6  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  24.94 
 
 
760 aa  80.1  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  25.62 
 
 
754 aa  75.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  25.4 
 
 
754 aa  74.3  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  44 
 
 
2068 aa  69.7  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  26.88 
 
 
723 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  27.33 
 
 
723 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  22.51 
 
 
721 aa  61.2  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  40 
 
 
776 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  37.21 
 
 
723 aa  55.5  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  37.21 
 
 
720 aa  53.9  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  33.33 
 
 
556 aa  52.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  24.22 
 
 
729 aa  52  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  23.99 
 
 
729 aa  51.6  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  38.27 
 
 
733 aa  51.6  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  25.92 
 
 
731 aa  50.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  23.76 
 
 
732 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  27.71 
 
 
776 aa  48.9  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  38.1 
 
 
721 aa  48.9  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  34.41 
 
 
793 aa  48.1  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  33.72 
 
 
719 aa  47.8  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  40.79 
 
 
4672 aa  47.8  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.61 
 
 
320 aa  47.8  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.21 
 
 
348 aa  47  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4400  hypothetical protein  33.33 
 
 
561 aa  47.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  23.98 
 
 
819 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  76.92 
 
 
764 aa  44.7  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.97 
 
 
329 aa  44.3  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>