More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2526 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 764 aa  1553    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  49.61 
 
 		 890 aa  635    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  50.76 
 
 		 836 aa  635  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  46.77 
 
 		 859 aa  551  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3701  glycosyl transferase family 51  42.53 
 
 		 803 aa  515  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4341  glycosyl transferase family 51  42.92 
 
 		 764 aa  497  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00883822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  42.92 
 
 		 825 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  42.06 
 
 		 808 aa  482  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1277  transglycosylase  42.58 
 
 		 774 aa  466  9.999999999999999e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  41.69 
 
 		 695 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1278  membrane carboxypeptidase  39.45 
 
 		 727 aa  440  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4676  glycosyl transferase family protein  37.57 
 
 		 778 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.94 
 
 		 1129 aa  394  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  36.26 
 
 		 719 aa  395  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5193  glycosyl transferase family 51  37.58 
 
 		 752 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  38.36 
 
 		 724 aa  378  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1268  glycosyl transferase family 51  37.54 
 
 		 1306 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.796636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9363  Membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)-like protein  34.63 
 
 		 822 aa  356  6.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.575493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4955  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.42 
 
 		 747 aa  351  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 		 806 aa  345  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.409444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5372  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 		 806 aa  345  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5461  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 		 806 aa  345  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10049  bifunctional penicillin-binding protein 1A/1B ponA1: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  35.85 
 
 		 821 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.57903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  37.42 
 
 		 1117 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3097  putative penicillin-binding protein  32.61 
 
 		 961 aa  324  3e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5071  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.04 
 
 		 725 aa  321  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.404123  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3566  peptidoglycan glycosyltransferase  32.23 
 
 		 867 aa  314  4.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.71222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  36.18 
 
 		 761 aa  312  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39340  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.75 
 
 		 814 aa  306  7e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.794703 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 		 1065 aa  304  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5078  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 		 979 aa  301  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111802 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  34.1 
 
 		 710 aa  301  4e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  34.19 
 
 		 643 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  33.44 
 
 		 643 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4845  glycosyl transferase family 51  33.1 
 
 		 978 aa  298  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  33.44 
 
 		 643 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0871  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 		 815 aa  298  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  35.11 
 
 		 755 aa  294  5e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  33.39 
 
 		 654 aa  292  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4745  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.6 
 
 		 769 aa  291  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 		 1245 aa  290  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  32.58 
 
 		 618 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  35.16 
 
 		 734 aa  290  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4560  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 		 975 aa  288  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  34.84 
 
 		 683 aa  288  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  33.23 
 
 		 905 aa  287  5.999999999999999e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4192  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.88 
 
 		 950 aa  286  7e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.495608  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  34.31 
 
 		 712 aa  286  9e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  34.27 
 
 		 817 aa  285  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  33.88 
 
 		 681 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6036  glycosyl transferase family protein  34.57 
 
 		 830 aa  283  8.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.852412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  33.38 
 
 		 734 aa  282  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  33.28 
 
 		 776 aa  282  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  34.74 
 
 		 728 aa  281  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  34.98 
 
 		 714 aa  280  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  35.08 
 
 		 728 aa  279  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  33.38 
 
 		 723 aa  279  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  32.84 
 
 		 649 aa  279  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 		 714 aa  280  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  33.56 
 
 		 626 aa  279  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  34.97 
 
 		 727 aa  278  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  34.4 
 
 		 732 aa  277  6e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  31.33 
 
 		 784 aa  277  6e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  34.58 
 
 		 727 aa  276  9e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  33.65 
 
 		 761 aa  276  9e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7034  glycosyl transferase family 51  33.7 
 
 		 838 aa  275  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  32.68 
 
 		 770 aa  275  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  31.37 
 
 		 811 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  33.66 
 
 		 648 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  33.44 
 
 		 683 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  34.21 
 
 		 710 aa  271  4e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  33.95 
 
 		 735 aa  270  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  33.28 
 
 		 683 aa  269  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  33.28 
 
 		 683 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  32.59 
 
 		 709 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  31.99 
 
 		 640 aa  268  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  33.28 
 
 		 683 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  33.17 
 
 		 775 aa  268  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  33.9 
 
 		 739 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  30.26 
 
 		 806 aa  267  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  34.98 
 
 		 732 aa  267  5e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  32.02 
 
 		 730 aa  267  5e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  34.91 
 
 		 720 aa  267  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  31.87 
 
 		 763 aa  266  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  33.11 
 
 		 683 aa  266  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  33.11 
 
 		 683 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  33.49 
 
 		 722 aa  265  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  32.3 
 
 		 720 aa  266  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  30.87 
 
 		 727 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  33.11 
 
 		 683 aa  265  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  33.02 
 
 		 765 aa  264  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  31.77 
 
 		 683 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  30.2 
 
 		 648 aa  263  8e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  33.12 
 
 		 683 aa  263  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  31.96 
 
 		 683 aa  262  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  31.96 
 
 		 683 aa  263  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0345  glycosyl transferase family 51  29.58 
 
 		 987 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0145524 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0163  1A family penicillin-binding protein  31.48 
 
 		 713 aa  261  2e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  31.31 
 
 		 723 aa  261  4e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  32.24 
 
 		 824 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>