79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3826 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  100 
 
 		 575 aa  1172    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  42.61 
 
 		 592 aa  440  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  45.12 
 
 		 533 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  47.13 
 
 		 546 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  44.69 
 
 		 539 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  44.49 
 
 		 539 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  44 
 
 		 551 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  40.39 
 
 		 1322 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  43.95 
 
 		 1355 aa  389  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  41.86 
 
 		 1587 aa  381  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  39.07 
 
 		 857 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  38.66 
 
 		 622 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  41.18 
 
 		 576 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  40.15 
 
 		 600 aa  355  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 629 aa  355  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  38.96 
 
 		 567 aa  355  2e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  39.25 
 
 		 774 aa  347  4e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  38.89 
 
 		 498 aa  342  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  36.57 
 
 		 633 aa  340  5e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  37.85 
 
 		 627 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  36.82 
 
 		 624 aa  329  7e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  38.91 
 
 		 635 aa  329  8e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  36.99 
 
 		 624 aa  323  6e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  37.2 
 
 		 624 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  36.45 
 
 		 624 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  36.8 
 
 		 624 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  37.38 
 
 		 624 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  38.8 
 
 		 501 aa  320  7e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  39.02 
 
 		 506 aa  318  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  36.26 
 
 		 624 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  36.62 
 
 		 624 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  36.84 
 
 		 624 aa  302  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  34.39 
 
 		 598 aa  301  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  36.13 
 
 		 621 aa  295  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  33.88 
 
 		 601 aa  286  9e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  33.62 
 
 		 622 aa  279  9e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  33.1 
 
 		 589 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  33.1 
 
 		 589 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  34.19 
 
 		 600 aa  264  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  33.96 
 
 		 599 aa  258  2e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  34.35 
 
 		 2701 aa  258  3e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.48 
 
 		 1795 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  33.21 
 
 		 2796 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  36.29 
 
 		 2182 aa  246  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  45.52 
 
 		 1175 aa  221  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  27.35 
 
 		 423 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  35.68 
 
 		 3977 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  33.61 
 
 		 2852 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  26.12 
 
 		 776 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.69 
 
 		 1641 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.14 
 
 		 1641 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  24.05 
 
 		 754 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  24.72 
 
 		 723 aa  81.3  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  23.15 
 
 		 760 aa  80.5  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  23.85 
 
 		 754 aa  80.5  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  24.01 
 
 		 723 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  23.8 
 
 		 723 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  24.48 
 
 		 721 aa  77.4  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  31.94 
 
 		 775 aa  75.5  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  27.95 
 
 		 729 aa  72  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  24.77 
 
 		 732 aa  72  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  27.51 
 
 		 729 aa  71.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  24.24 
 
 		 732 aa  71.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  20.53 
 
 		 721 aa  67.8  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  23.14 
 
 		 719 aa  67.4  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  26.39 
 
 		 720 aa  58.9  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  26.42 
 
 		 731 aa  55.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  23.71 
 
 		 733 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.2 
 
 		 517 aa  50.8  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.83 
 
 		 338 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.34 
 
 		 336 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0690  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.05 
 
 		 299 aa  47  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.408931 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  22.84 
 
 		 329 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.17 
 
 		 348 aa  45.8  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.05 
 
 		 334 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1335  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.45 
 
 		 324 aa  45.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  0.360031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.36 
 
 		 327 aa  44.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.441743  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.86 
 
 		 328 aa  44.3  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1536  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.81 
 
 		 362 aa  43.9  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>