100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2487 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  65.43 
 
 
627 aa  768    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  84.94 
 
 
624 aa  1062    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  85.1 
 
 
624 aa  1059    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  84.62 
 
 
624 aa  1075    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  98.56 
 
 
624 aa  1243    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  97.6 
 
 
624 aa  1208    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  87.82 
 
 
624 aa  1083    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  98.24 
 
 
624 aa  1242    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  83.49 
 
 
624 aa  1054    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  100 
 
 
624 aa  1261    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  65.32 
 
 
635 aa  806    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  41.77 
 
 
621 aa  450  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
629 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  46.47 
 
 
592 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  42.58 
 
 
622 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  41.18 
 
 
600 aa  420  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  43.5 
 
 
539 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  41.62 
 
 
600 aa  409  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  43.31 
 
 
539 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  43.55 
 
 
533 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  42.52 
 
 
598 aa  392  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  41.05 
 
 
551 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  43.53 
 
 
1355 aa  389  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  44.11 
 
 
546 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  41.57 
 
 
567 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  41.68 
 
 
774 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  41.38 
 
 
857 aa  376  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  39.93 
 
 
633 aa  368  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  40.18 
 
 
601 aa  363  6e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  39.32 
 
 
589 aa  363  7.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  38.51 
 
 
622 aa  361  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  38.55 
 
 
589 aa  362  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  42.77 
 
 
1587 aa  349  9e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  38.81 
 
 
1322 aa  340  7e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  39.82 
 
 
576 aa  338  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  36.62 
 
 
575 aa  331  3e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  37.69 
 
 
498 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  38.67 
 
 
506 aa  290  5.0000000000000004e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  33.87 
 
 
599 aa  287  4e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  39.69 
 
 
501 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  39.39 
 
 
2701 aa  265  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  39.03 
 
 
2182 aa  264  4.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  47.91 
 
 
1175 aa  256  7e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  35.94 
 
 
2796 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.23 
 
 
1795 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.57 
 
 
3977 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  33.7 
 
 
2852 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  24.88 
 
 
423 aa  94.7  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  24.62 
 
 
776 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0580  alkaline phosphatase  48.89 
 
 
748 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00489448 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  25.22 
 
 
775 aa  77.4  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  25.93 
 
 
760 aa  77  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.4 
 
 
1641 aa  74.7  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  24.61 
 
 
720 aa  74.3  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  26.36 
 
 
733 aa  74.3  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.44 
 
 
1641 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  26.13 
 
 
754 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  26.13 
 
 
754 aa  69.7  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  38.97 
 
 
640 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  32.93 
 
 
616 aa  68.2  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  30.43 
 
 
729 aa  67.8  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  29.95 
 
 
729 aa  67.4  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  24.41 
 
 
723 aa  67  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  25 
 
 
723 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  25 
 
 
723 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  24.02 
 
 
731 aa  65.1  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  21.92 
 
 
721 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  22.94 
 
 
793 aa  62.4  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  40 
 
 
513 aa  57.8  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  40 
 
 
513 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  38.75 
 
 
513 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  24.39 
 
 
732 aa  55.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  38.75 
 
 
513 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.5 
 
 
348 aa  54.3  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  28.77 
 
 
354 aa  54.3  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.67 
 
 
338 aa  53.5  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  23.93 
 
 
732 aa  53.5  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  23.04 
 
 
719 aa  52.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.81 
 
 
334 aa  52.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  21.85 
 
 
721 aa  53.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.65 
 
 
332 aa  52.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.27 
 
 
689 aa  48.5  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.35 
 
 
347 aa  47.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  31.85 
 
 
328 aa  48.1  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.95 
 
 
328 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.21 
 
 
354 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.71 
 
 
327 aa  47  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  26.03 
 
 
810 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  26.81 
 
 
819 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.5 
 
 
328 aa  46.2  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  24.14 
 
 
391 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  35.94 
 
 
556 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2848  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.22 
 
 
329 aa  45.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.221591  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.95 
 
 
328 aa  45.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5316  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.68 
 
 
330 aa  44.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131426  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.95 
 
 
328 aa  44.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1839  hypothetical protein  26.96 
 
 
330 aa  43.9  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.172437  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4977  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.15 
 
 
336 aa  43.9  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.370165  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.95 
 
 
348 aa  43.9  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5946  hypothetical protein  25.32 
 
 
335 aa  43.9  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.413052  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>