80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1957 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  65.59 
 
 		 627 aa  781    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  65.16 
 
 		 624 aa  778    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  64.19 
 
 		 624 aa  777    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  64.12 
 
 		 624 aa  756    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  65.48 
 
 		 624 aa  783    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  65.32 
 
 		 624 aa  771    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  100 
 
 		 635 aa  1270    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  63.87 
 
 		 624 aa  780    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  63.06 
 
 		 624 aa  755    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  63.39 
 
 		 624 aa  761    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  65.48 
 
 		 624 aa  782    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  44.19 
 
 		 621 aa  484  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  43.84 
 
 		 622 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 629 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  39.38 
 
 		 600 aa  411  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  46.04 
 
 		 600 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  44.16 
 
 		 592 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  43.92 
 
 		 539 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  43.73 
 
 		 539 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  43.45 
 
 		 546 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  41.28 
 
 		 633 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  42.54 
 
 		 1355 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  40.31 
 
 		 589 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  39.2 
 
 		 601 aa  372  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  40.58 
 
 		 598 aa  372  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  41.85 
 
 		 533 aa  369  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  38.99 
 
 		 622 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  40.37 
 
 		 857 aa  369  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  39.59 
 
 		 589 aa  365  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  41.07 
 
 		 774 aa  361  2e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  40.11 
 
 		 551 aa  361  2e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  43.29 
 
 		 1587 aa  356  5.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  39.06 
 
 		 567 aa  340  7e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  39.86 
 
 		 576 aa  335  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  37.79 
 
 		 1322 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  38.91 
 
 		 575 aa  329  9e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  39.11 
 
 		 506 aa  303  6.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  38.31 
 
 		 501 aa  297  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  34.85 
 
 		 599 aa  293  9e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  35.63 
 
 		 498 aa  280  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  53.48 
 
 		 1175 aa  273  6e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  38.29 
 
 		 2182 aa  263  6e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  40.83 
 
 		 2701 aa  257  5e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.56 
 
 		 1795 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  34.46 
 
 		 2796 aa  238  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.41 
 
 		 3977 aa  121  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  33.46 
 
 		 2852 aa  107  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  25.86 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.94 
 
 		 1641 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27 
 
 		 1641 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  24.04 
 
 		 760 aa  71.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  20.55 
 
 		 721 aa  67.4  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  24.1 
 
 		 732 aa  63.9  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  24.7 
 
 		 723 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  22.53 
 
 		 775 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  24.4 
 
 		 723 aa  61.6  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  23.37 
 
 		 754 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  23.37 
 
 		 754 aa  61.6  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  23.56 
 
 		 731 aa  60.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  23.87 
 
 		 732 aa  60.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  25 
 
 		 793 aa  60.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  22.59 
 
 		 733 aa  58.9  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  22.65 
 
 		 776 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0580  alkaline phosphatase  35.23 
 
 		 748 aa  55.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00489448 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  29.85 
 
 		 723 aa  55.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  23.58 
 
 		 721 aa  54.3  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  33.61 
 
 		 640 aa  52.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  25.37 
 
 		 729 aa  52.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  25.07 
 
 		 729 aa  52.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  23.09 
 
 		 719 aa  50.8  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  32.56 
 
 		 720 aa  50.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  38.89 
 
 		 513 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  38.89 
 
 		 513 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  38.89 
 
 		 513 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  37.5 
 
 		 513 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  33.56 
 
 		 616 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.6 
 
 		 328 aa  44.3  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.83 
 
 		 348 aa  44.3  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.1 
 
 		 334 aa  44.3  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.03 
 
 		 338 aa  43.9  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>