100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1752 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2267  alkaline phosphatase  96.15 
 
 
624 aa  1203    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1832  alkaline phosphatase  98.88 
 
 
624 aa  1253    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.348845  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1752  alkaline phosphatase  100 
 
 
624 aa  1265    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.188317  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2281  alkaline phosphatase  90.06 
 
 
624 aa  1120    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2384  alkaline phosphatase  84.78 
 
 
624 aa  1077    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1779  alkaline phosphatase  67.09 
 
 
627 aa  790    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00922398  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2135  alkaline phosphatase  82.37 
 
 
624 aa  1033    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2372  alkaline phosphatase  85.1 
 
 
624 aa  1081    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2487  alkaline phosphatase  84.94 
 
 
624 aa  1064    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.498769  decreased coverage  0.000143129 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1975  alkaline phosphatase  84.94 
 
 
624 aa  1080    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0753581  hitchhiker  0.000000246694 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1957  alkaline phosphatase  63.39 
 
 
635 aa  800    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223046  normal  0.0148411 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3908  MerR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
629 aa  459  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1758  putative alkaline phosphatase  42.12 
 
 
621 aa  454  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0727302  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2541  alkaline phosphatase-like  46.93 
 
 
592 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1270  Collagen triple helix repeat protein  41.18 
 
 
600 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  hitchhiker  0.000000745074 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03288  putative alkaline phosphatase  42.5 
 
 
600 aa  422  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1379  putative alkaline phosphatase  42.66 
 
 
622 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45680  alkaline phosphatase  46.43 
 
 
533 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2478  protein of unknown function DUF1555  44.44 
 
 
539 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304731  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  44.99 
 
 
1355 aa  413  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3636  protein of unknown function DUF1555  44.07 
 
 
539 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0276  alkaline phosphatase-like protein  44.12 
 
 
551 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000391321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1973  alkaline phosphatase-like protein  45.66 
 
 
546 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0635  transcriptional regulator, MerR family protein  42.22 
 
 
598 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.693916  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2477  alkaline phosphatase-like protein  41.68 
 
 
633 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4764  alkaline phosphatase-like protein  42.14 
 
 
567 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  43.17 
 
 
857 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3684  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  41.42 
 
 
774 aa  382  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3484  hypothetical protein  39.45 
 
 
622 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1228  hypothetical protein  41.26 
 
 
601 aa  372  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933019  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2207  Alkaline phosphatase  44.68 
 
 
1587 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05423  hypothetical protein  39.68 
 
 
589 aa  363  5.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001482  alkaline phosphatase  38.8 
 
 
589 aa  356  7.999999999999999e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  40.34 
 
 
1322 aa  355  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3215  hypothetical protein  41.13 
 
 
576 aa  350  5e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3826  alkaline phosphatase  37.2 
 
 
575 aa  347  5e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0978  hypothetical protein  38.58 
 
 
498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.121724  normal  0.659416 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10670  hypothetical protein  35.41 
 
 
599 aa  304  3.0000000000000004e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143126  normal  0.504233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6653  alkaline phosphatase-like protein  38.61 
 
 
501 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3414  hypothetical protein  38.81 
 
 
506 aa  290  6e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  39.89 
 
 
2182 aa  283  9e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  40.53 
 
 
2701 aa  278  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  49.84 
 
 
1175 aa  265  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  35.51 
 
 
2796 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.03 
 
 
1795 aa  234  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.21 
 
 
3977 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1685  5'-Nucleotidase domain protein  30.8 
 
 
2852 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4261  hypothetical protein  25.42 
 
 
423 aa  97.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194386  normal  0.0872951 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47869  predicted protein  22.33 
 
 
721 aa  84.3  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0720  putative secreted protein  26.61 
 
 
760 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.522606  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0580  alkaline phosphatase  45.56 
 
 
748 aa  77.4  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00489448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.72 
 
 
1641 aa  75.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5115  hypothetical protein  24.48 
 
 
720 aa  74.3  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.44963  normal  0.774948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5160  secreted protein  25.29 
 
 
775 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.976383  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3413  hypothetical protein  24.32 
 
 
733 aa  73.9  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  43.48 
 
 
640 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1155  secreted protein  23.13 
 
 
776 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00335606  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0581  hypothetical protein  27.8 
 
 
729 aa  73.2  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0616  hypothetical protein  30.43 
 
 
729 aa  72.4  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2495  hypothetical protein  23.38 
 
 
723 aa  72  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11501  alkaline phosphatase  25 
 
 
754 aa  71.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.991815  normal  0.0150777 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0439  putative secreted protein  25 
 
 
754 aa  71.2  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.92 
 
 
1641 aa  70.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47612  predicted protein  23.38 
 
 
793 aa  67.8  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0876  hypothetical protein  23.44 
 
 
731 aa  67.4  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0399  hypothetical protein  22.3 
 
 
723 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1753  hypothetical protein  22.3 
 
 
723 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  41.56 
 
 
616 aa  65.1  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2901  hypothetical protein  22.8 
 
 
719 aa  62  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.427774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1343  putative alkaline phosphatase protein  24 
 
 
732 aa  61.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1252  hypothetical protein  22.92 
 
 
732 aa  60.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176304  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.57 
 
 
689 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0223  hypothetical protein  40 
 
 
513 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  29.73 
 
 
354 aa  57  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4234  hypothetical protein  40 
 
 
513 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000811354 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0225  hypothetical protein  40 
 
 
513 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0695472 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.86 
 
 
347 aa  55.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4114  hypothetical protein  42.25 
 
 
513 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1794  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.01 
 
 
338 aa  53.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000588252 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1180  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.5 
 
 
348 aa  52.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3851  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.99 
 
 
334 aa  52.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3328  hypothetical protein  21.86 
 
 
721 aa  51.6  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.498692  normal  0.26053 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.43 
 
 
348 aa  52  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.53 
 
 
354 aa  51.2  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  28.77 
 
 
810 aa  50.8  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.28 
 
 
348 aa  50.8  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.23 
 
 
353 aa  50.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  25.69 
 
 
580 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  34.29 
 
 
556 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26 
 
 
366 aa  48.5  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.58 
 
 
332 aa  47.8  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  25.97 
 
 
354 aa  47  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  23.64 
 
 
391 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3145  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.27 
 
 
327 aa  47  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.58 
 
 
328 aa  46.2  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1847  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.54 
 
 
328 aa  45.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1798  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.16 
 
 
328 aa  45.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4136  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.27 
 
 
345 aa  44.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0910022  normal  0.508786 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  26.72 
 
 
819 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.71 
 
 
328 aa  44.3  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0147653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>