246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2543 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  70.04 
 
 		 527 aa  699    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  64.82 
 
 		 616 aa  833    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  72 
 
 		 532 aa  763    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  100 
 
 		 640 aa  1303    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  67.36 
 
 		 527 aa  655    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  68.87 
 
 		 552 aa  754    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  57.69 
 
 		 565 aa  571  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  60.5 
 
 		 543 aa  556  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  61.33 
 
 		 543 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  60.71 
 
 		 545 aa  555  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  60.5 
 
 		 535 aa  546  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  56.13 
 
 		 545 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  56.13 
 
 		 545 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  56.13 
 
 		 545 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  56.13 
 
 		 545 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  55.93 
 
 		 546 aa  522  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  55.93 
 
 		 546 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  55.93 
 
 		 546 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  54.17 
 
 		 499 aa  501  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  52.29 
 
 		 498 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  52.29 
 
 		 498 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  52.29 
 
 		 501 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  52.02 
 
 		 498 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  52.29 
 
 		 498 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  52.5 
 
 		 496 aa  491  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  52.71 
 
 		 498 aa  491  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  52.7 
 
 		 496 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  52.71 
 
 		 498 aa  490  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  52.7 
 
 		 502 aa  485  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  52.56 
 
 		 527 aa  469  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  53.6 
 
 		 505 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  45.77 
 
 		 548 aa  452  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  46.5 
 
 		 568 aa  415  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  46.04 
 
 		 568 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  47.25 
 
 		 565 aa  389  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1655  alkaline phosphatase  46.84 
 
 		 576 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.403448  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  41.03 
 
 		 501 aa  340  5.9999999999999996e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  40.73 
 
 		 464 aa  314  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  40.53 
 
 		 464 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  40.25 
 
 		 467 aa  309  9e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  38.14 
 
 		 518 aa  284  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  38.99 
 
 		 467 aa  278  3e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  38.63 
 
 		 486 aa  272  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  39.15 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  38.62 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  39.15 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  39.15 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  39.15 
 
 		 467 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  37.7 
 
 		 485 aa  268  2.9999999999999995e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  39.15 
 
 		 467 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  39.15 
 
 		 467 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  37.7 
 
 		 485 aa  267  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  38.33 
 
 		 466 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  38.05 
 
 		 468 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  38.84 
 
 		 480 aa  260  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  37.88 
 
 		 471 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  37.65 
 
 		 463 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  38.61 
 
 		 478 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  35.98 
 
 		 470 aa  253  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  38.22 
 
 		 483 aa  249  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  37.63 
 
 		 478 aa  246  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  37.22 
 
 		 557 aa  224  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  36.73 
 
 		 476 aa  220  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  36.73 
 
 		 479 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  36.75 
 
 		 509 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  36.73 
 
 		 476 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  36.73 
 
 		 476 aa  219  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  36.73 
 
 		 577 aa  218  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  30.72 
 
 		 434 aa  173  9e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737.1  alkaline phosphatase  57.14 
 
 		 215 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  30.5 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  34.71 
 
 		 671 aa  159  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  28.89 
 
 		 581 aa  151  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  30.85 
 
 		 455 aa  151  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  28.71 
 
 		 547 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  31.32 
 
 		 461 aa  142  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  31.79 
 
 		 461 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  32 
 
 		 461 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2299  6-phosphatase  31.42 
 
 		 468 aa  140  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0558896 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  31.11 
 
 		 461 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  30.79 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  31.37 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  31.37 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  30.99 
 
 		 461 aa  140  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3069  alkaline phosphatase  30.98 
 
 		 461 aa  139  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.13276  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  31.7 
 
 		 436 aa  139  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  30.9 
 
 		 461 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  30.24 
 
 		 525 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  31.2 
 
 		 461 aa  137  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  30.95 
 
 		 541 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  31.99 
 
 		 388 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  32.11 
 
 		 525 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10563  alkaline phosphatase Pho8 (AFU_orthologue; AFUA_2G03110)  31.43 
 
 		 606 aa  135  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00384867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  29.25 
 
 		 581 aa  135  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  31.78 
 
 		 676 aa  134  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  28.85 
 
 		 581 aa  134  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  29.43 
 
 		 506 aa  134  6e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  30.55 
 
 		 589 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  27.56 
 
 		 584 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  28.17 
 
 		 585 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>