226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1349 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  100 
 
 
543 aa  1109    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  79.63 
 
 
545 aa  885    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  83.24 
 
 
535 aa  882    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  79.63 
 
 
545 aa  885    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  79.85 
 
 
546 aa  888    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  79.85 
 
 
546 aa  889    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  87.29 
 
 
543 aa  950    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  80.22 
 
 
546 aa  892    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  79.63 
 
 
545 aa  885    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  79.89 
 
 
545 aa  899    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  83.21 
 
 
545 aa  928    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  52.38 
 
 
616 aa  563  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  55.05 
 
 
552 aa  561  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  57.91 
 
 
496 aa  548  1e-155  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  57.49 
 
 
501 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  57.49 
 
 
498 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  61.33 
 
 
640 aa  547  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  57.49 
 
 
498 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  57.73 
 
 
502 aa  546  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  57.49 
 
 
498 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  57.29 
 
 
496 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  58.11 
 
 
499 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  56.88 
 
 
498 aa  535  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  56.88 
 
 
498 aa  534  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  56.88 
 
 
498 aa  535  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  53.86 
 
 
527 aa  531  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  55.25 
 
 
532 aa  526  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  56.04 
 
 
527 aa  526  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  50.36 
 
 
565 aa  509  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  56.5 
 
 
505 aa  511  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  52.68 
 
 
527 aa  476  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  51.47 
 
 
548 aa  468  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  53.38 
 
 
568 aa  459  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  50.92 
 
 
565 aa  430  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  50.54 
 
 
568 aa  426  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1655  alkaline phosphatase  50.71 
 
 
576 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.403448  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  43.78 
 
 
501 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  41.08 
 
 
464 aa  299  8e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  41.29 
 
 
464 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  40.86 
 
 
467 aa  293  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  39.34 
 
 
467 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  39.24 
 
 
518 aa  280  4e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  41.07 
 
 
468 aa  279  8e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  38.68 
 
 
478 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  39.2 
 
 
467 aa  273  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  39.2 
 
 
467 aa  273  7e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  39.2 
 
 
467 aa  273  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  39.2 
 
 
467 aa  273  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  39.96 
 
 
471 aa  273  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  38.1 
 
 
485 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  39.2 
 
 
467 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  39.2 
 
 
467 aa  272  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  38.99 
 
 
467 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  37.93 
 
 
485 aa  271  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  39.02 
 
 
470 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  39.2 
 
 
463 aa  269  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  38.69 
 
 
466 aa  269  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  37.91 
 
 
486 aa  266  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  39.15 
 
 
557 aa  259  9e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  39.34 
 
 
480 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  38.26 
 
 
479 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  38.26 
 
 
509 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  38.26 
 
 
476 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  38.26 
 
 
476 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  38.26 
 
 
476 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  38.26 
 
 
577 aa  254  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  39.23 
 
 
478 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  37.76 
 
 
483 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  34.02 
 
 
671 aa  178  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  30.02 
 
 
581 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737.1  alkaline phosphatase  54.94 
 
 
215 aa  163  7e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1075  Alkaline phosphatase  31.71 
 
 
635 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  30.97 
 
 
434 aa  162  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  29.75 
 
 
589 aa  160  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  30.98 
 
 
434 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  30.95 
 
 
455 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  30.63 
 
 
581 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  29.34 
 
 
584 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  30.22 
 
 
581 aa  153  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  33.53 
 
 
506 aa  150  5e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  29.24 
 
 
585 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  30.04 
 
 
584 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  29.25 
 
 
609 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  29.04 
 
 
585 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  29.04 
 
 
585 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  29.48 
 
 
584 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  29.96 
 
 
582 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  33.23 
 
 
436 aa  143  7e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  35.26 
 
 
525 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  31.93 
 
 
541 aa  141  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  29.23 
 
 
547 aa  141  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  34.53 
 
 
388 aa  140  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2299  6-phosphatase  29.57 
 
 
468 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0558896 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2364  alkaline phosphatase  28.27 
 
 
575 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0542806  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3000  alkaline phosphatase  27.74 
 
 
575 aa  138  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  34.78 
 
 
589 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  34.51 
 
 
471 aa  137  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2068  Alkaline phosphatase  34.34 
 
 
503 aa  136  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.731445 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  28.49 
 
 
584 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0524  Alkaline phosphatase  32.35 
 
 
537 aa  134  6e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>