224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2542 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  71.76 
 
 		 527 aa  769    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  67.38 
 
 		 616 aa  719    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  100 
 
 		 532 aa  1087    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  69.91 
 
 		 640 aa  754    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  69.02 
 
 		 527 aa  724    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  65.37 
 
 		 552 aa  706    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  55.15 
 
 		 565 aa  555  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  53.7 
 
 		 496 aa  542  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  55.45 
 
 		 543 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  53.9 
 
 		 496 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  53.8 
 
 		 499 aa  533  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  55.64 
 
 		 545 aa  534  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  51.59 
 
 		 502 aa  530  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  55.25 
 
 		 543 aa  527  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  54.06 
 
 		 546 aa  525  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  51.62 
 
 		 501 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  54.06 
 
 		 546 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  54.06 
 
 		 546 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  51.62 
 
 		 498 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  51.62 
 
 		 498 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  53.66 
 
 		 545 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  51.62 
 
 		 498 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  53.57 
 
 		 545 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  53.57 
 
 		 545 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  53.57 
 
 		 545 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  51.9 
 
 		 498 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  51.9 
 
 		 498 aa  519  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  52.09 
 
 		 498 aa  520  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  55.45 
 
 		 535 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  51.86 
 
 		 527 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  51.59 
 
 		 505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  47.01 
 
 		 548 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  44.47 
 
 		 568 aa  386  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  44.1 
 
 		 568 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  42.86 
 
 		 565 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1655  alkaline phosphatase  41.77 
 
 		 576 aa  358  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.403448  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  42.25 
 
 		 501 aa  355  7.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  40.73 
 
 		 464 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  40.82 
 
 		 467 aa  318  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  40.53 
 
 		 464 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  39.13 
 
 		 518 aa  292  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  39.76 
 
 		 486 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  37.5 
 
 		 485 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  37.5 
 
 		 485 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  38.43 
 
 		 467 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  37.4 
 
 		 467 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  37.4 
 
 		 467 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  37.42 
 
 		 470 aa  275  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  37.4 
 
 		 467 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  37.4 
 
 		 466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  37.2 
 
 		 467 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  37.2 
 
 		 467 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  37.2 
 
 		 467 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  37.2 
 
 		 467 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  37.6 
 
 		 468 aa  269  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  37.58 
 
 		 463 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  37.07 
 
 		 471 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  38 
 
 		 483 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  37.94 
 
 		 478 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  37.97 
 
 		 478 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  37.52 
 
 		 480 aa  259  8e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  38.05 
 
 		 557 aa  237  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  37.83 
 
 		 509 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  37.83 
 
 		 479 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  37.83 
 
 		 476 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  37.83 
 
 		 476 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  37.83 
 
 		 476 aa  229  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  37.83 
 
 		 577 aa  229  9e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737.1  alkaline phosphatase  56.52 
 
 		 215 aa  195  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  29.06 
 
 		 581 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  33.91 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  30.12 
 
 		 455 aa  156  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  30.6 
 
 		 671 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  33.62 
 
 		 434 aa  155  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  31.41 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3000  alkaline phosphatase  28.63 
 
 		 575 aa  140  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  31.62 
 
 		 541 aa  140  7e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  28.43 
 
 		 581 aa  139  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  28.07 
 
 		 581 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  32.07 
 
 		 433 aa  138  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  29.01 
 
 		 585 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  29.01 
 
 		 585 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2364  alkaline phosphatase  28.11 
 
 		 575 aa  135  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0542806  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  31.69 
 
 		 481 aa  133  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  27.41 
 
 		 506 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  28.17 
 
 		 584 aa  133  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10563  alkaline phosphatase Pho8 (AFU_orthologue; AFUA_2G03110)  31.36 
 
 		 606 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00384867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  27.7 
 
 		 547 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2789  alkaline phosphatase  30.14 
 
 		 557 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.670968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2738  alkaline phosphatase  30.88 
 
 		 557 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.133398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  30.14 
 
 		 557 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2999  alkaline phosphatase  30.14 
 
 		 557 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886968 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  29.22 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  30.6 
 
 		 471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2719  alkaline phosphatase  30.42 
 
 		 557 aa  127  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2299  6-phosphatase  31.4 
 
 		 468 aa  126  9e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0558896 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  31.32 
 
 		 585 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  31.4 
 
 		 559 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4297  alkaline phosphatase  29.46 
 
 		 499 aa  126  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4197  alkaline phosphatase  29.46 
 
 		 499 aa  126  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>