228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0098 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  100 
 
 		 467 aa  943    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  86.3 
 
 		 464 aa  796    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  86.08 
 
 		 464 aa  791    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  74.32 
 
 		 471 aa  634    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  74.72 
 
 		 468 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  68.95 
 
 		 467 aa  613  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  58.86 
 
 		 518 aa  550  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  64.19 
 
 		 467 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  64.19 
 
 		 467 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  63.74 
 
 		 467 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  63.74 
 
 		 467 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  63.06 
 
 		 463 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  63.74 
 
 		 467 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  63.74 
 
 		 467 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  63.74 
 
 		 467 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  63.06 
 
 		 466 aa  531  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  55.63 
 
 		 485 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  56.38 
 
 		 485 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  55.26 
 
 		 486 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  58.61 
 
 		 480 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  54.53 
 
 		 470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  58.61 
 
 		 478 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  55.22 
 
 		 483 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  54.49 
 
 		 478 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  56.12 
 
 		 557 aa  398  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  55.21 
 
 		 509 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  55.21 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  55.21 
 
 		 479 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  55.21 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  55.21 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  55.21 
 
 		 577 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  42.62 
 
 		 527 aa  331  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  41.19 
 
 		 505 aa  323  5e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  42.95 
 
 		 502 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  41.29 
 
 		 616 aa  319  7e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  40.82 
 
 		 532 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  41.09 
 
 		 496 aa  316  5e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  39.96 
 
 		 527 aa  312  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  42.11 
 
 		 501 aa  311  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  41.77 
 
 		 496 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  40.25 
 
 		 640 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  40.75 
 
 		 552 aa  309  5.9999999999999995e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  42.19 
 
 		 545 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  41.68 
 
 		 498 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  43.06 
 
 		 545 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  41.47 
 
 		 498 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  43.06 
 
 		 545 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  43.06 
 
 		 545 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  43.06 
 
 		 545 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  41.47 
 
 		 498 aa  306  6e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  43.8 
 
 		 546 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  41.3 
 
 		 548 aa  305  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  43.8 
 
 		 546 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  41.08 
 
 		 499 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  43.6 
 
 		 546 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  42.09 
 
 		 543 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  40 
 
 		 527 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  40.82 
 
 		 501 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  40.82 
 
 		 498 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  40.82 
 
 		 498 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  40.82 
 
 		 498 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  40.86 
 
 		 543 aa  293  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  38.17 
 
 		 565 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  41.86 
 
 		 535 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  39.06 
 
 		 568 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  39.88 
 
 		 565 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  38.17 
 
 		 568 aa  244  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1655  alkaline phosphatase  39.67 
 
 		 576 aa  232  1e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.403448  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  35.64 
 
 		 671 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  34.22 
 
 		 455 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  32.1 
 
 		 582 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  32.02 
 
 		 584 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  33.12 
 
 		 388 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  34.62 
 
 		 585 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  34.62 
 
 		 585 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  32.17 
 
 		 609 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  31.07 
 
 		 580 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  35.76 
 
 		 541 aa  187  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  31.47 
 
 		 434 aa  186  9e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  31.83 
 
 		 584 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  31.03 
 
 		 434 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  31.36 
 
 		 589 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  31.25 
 
 		 581 aa  182  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  32.72 
 
 		 584 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2364  alkaline phosphatase  31.56 
 
 		 575 aa  179  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0542806  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  32.72 
 
 		 584 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  31.59 
 
 		 585 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  29.84 
 
 		 581 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  29.65 
 
 		 581 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3000  alkaline phosphatase  32.25 
 
 		 575 aa  176  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  29.41 
 
 		 589 aa  171  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1376  alkaline phosphatase  32.33 
 
 		 558 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0116315  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  36.14 
 
 		 433 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  32.28 
 
 		 481 aa  166  8e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  37.11 
 
 		 547 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  33.05 
 
 		 525 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  33.64 
 
 		 536 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2187  alkaline phosphatase family protein  33.92 
 
 		 689 aa  163  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.838845  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  29.96 
 
 		 548 aa  163  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  34.46 
 
 		 525 aa  163  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>