227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3653 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  85.87 
 
 		 467 aa  791    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  100 
 
 		 464 aa  940    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  98.71 
 
 		 464 aa  932    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  70.55 
 
 		 468 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  70.95 
 
 		 471 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  68.74 
 
 		 467 aa  599  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  59.92 
 
 		 518 aa  544  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  64.51 
 
 		 467 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  64.51 
 
 		 467 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  64.29 
 
 		 467 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  64.29 
 
 		 467 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  64.29 
 
 		 467 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  64.29 
 
 		 467 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  64.29 
 
 		 467 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  63.39 
 
 		 463 aa  534  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  63.51 
 
 		 466 aa  530  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  56.6 
 
 		 485 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  56.54 
 
 		 485 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  55.7 
 
 		 486 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  53.65 
 
 		 470 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  56.6 
 
 		 480 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  57.05 
 
 		 478 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  56.19 
 
 		 483 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  53.7 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  55.46 
 
 		 557 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  54.32 
 
 		 509 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  54.55 
 
 		 479 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  54.55 
 
 		 476 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  54.55 
 
 		 577 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  54.55 
 
 		 476 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  54.55 
 
 		 476 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  41.37 
 
 		 505 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  42 
 
 		 527 aa  325  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  41.87 
 
 		 502 aa  318  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  40.53 
 
 		 496 aa  317  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  40.53 
 
 		 532 aa  315  9e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  43.48 
 
 		 545 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  43.48 
 
 		 545 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  43.48 
 
 		 545 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  42.71 
 
 		 545 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  39 
 
 		 616 aa  314  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  43.27 
 
 		 545 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  40.51 
 
 		 498 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  40.51 
 
 		 498 aa  311  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  40.37 
 
 		 552 aa  311  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  39.06 
 
 		 496 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  39.8 
 
 		 640 aa  310  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  40.3 
 
 		 498 aa  309  8e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  43.89 
 
 		 546 aa  309  8e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  38.73 
 
 		 527 aa  308  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  41.11 
 
 		 548 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  43.89 
 
 		 546 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  42.77 
 
 		 543 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  43.69 
 
 		 546 aa  307  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  40 
 
 		 499 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  41.06 
 
 		 543 aa  301  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  40.38 
 
 		 501 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  39.75 
 
 		 498 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  39.75 
 
 		 498 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  39.75 
 
 		 498 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  39.75 
 
 		 501 aa  300  4e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  39.39 
 
 		 527 aa  297  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  42.24 
 
 		 535 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  37.14 
 
 		 565 aa  283  5.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  38.24 
 
 		 568 aa  262  8e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  38.15 
 
 		 565 aa  244  3e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  37.55 
 
 		 568 aa  242  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1655  alkaline phosphatase  37.45 
 
 		 576 aa  226  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.403448  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  37.2 
 
 		 671 aa  207  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  32.86 
 
 		 582 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  32.7 
 
 		 455 aa  189  8e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  34.12 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  33.95 
 
 		 584 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  34.02 
 
 		 584 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  33.47 
 
 		 585 aa  182  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  33.47 
 
 		 585 aa  182  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  31.97 
 
 		 609 aa  182  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  30.19 
 
 		 434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  34.23 
 
 		 581 aa  180  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  30.19 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  32.85 
 
 		 580 aa  177  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  34.02 
 
 		 541 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  32.79 
 
 		 589 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  32.02 
 
 		 581 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  33.95 
 
 		 584 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  31.48 
 
 		 585 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  31.82 
 
 		 581 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  33.74 
 
 		 584 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3000  alkaline phosphatase  32.02 
 
 		 575 aa  171  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1376  alkaline phosphatase  32.93 
 
 		 558 aa  168  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0116315  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2364  alkaline phosphatase  31.68 
 
 		 575 aa  168  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0542806  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  31.38 
 
 		 547 aa  166  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  35.62 
 
 		 676 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  35.51 
 
 		 536 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  35.93 
 
 		 450 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  34.76 
 
 		 525 aa  163  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  34.29 
 
 		 525 aa  163  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  30.74 
 
 		 548 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2789  alkaline phosphatase  34.07 
 
 		 557 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.670968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  34.07 
 
 		 557 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>