226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1289 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  68.91 
 
 
609 aa  813    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  100 
 
 
580 aa  1182    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  59.83 
 
 
581 aa  733    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  59.86 
 
 
581 aa  736    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  75.13 
 
 
584 aa  902    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  71.85 
 
 
584 aa  853    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  72.37 
 
 
584 aa  863    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  53.34 
 
 
582 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  50.61 
 
 
581 aa  606  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  53.4 
 
 
589 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  54.69 
 
 
584 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  53.05 
 
 
585 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  44.63 
 
 
671 aa  439  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  40 
 
 
585 aa  393  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  40 
 
 
585 aa  393  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3000  alkaline phosphatase  40.56 
 
 
575 aa  383  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2364  alkaline phosphatase  40.28 
 
 
575 aa  382  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0542806  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2187  alkaline phosphatase family protein  34.78 
 
 
689 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.838845  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02493  extracellular phytase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14030)  30.61 
 
 
663 aa  265  2e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.468824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  31.62 
 
 
467 aa  187  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  32.78 
 
 
464 aa  175  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  32.64 
 
 
464 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  31.62 
 
 
468 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  32.37 
 
 
471 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  31.63 
 
 
518 aa  169  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  31.42 
 
 
478 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  30.95 
 
 
470 aa  167  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  32.15 
 
 
466 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  29.6 
 
 
548 aa  164  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  32.63 
 
 
467 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  32.63 
 
 
467 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  32.35 
 
 
467 aa  163  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  32.56 
 
 
467 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  32.56 
 
 
467 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  32.56 
 
 
467 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  32.56 
 
 
467 aa  161  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  31.25 
 
 
463 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  31.94 
 
 
557 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  30.55 
 
 
467 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  29.65 
 
 
450 aa  158  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  29.61 
 
 
485 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  30.68 
 
 
436 aa  156  9e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  34.62 
 
 
485 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  34.76 
 
 
541 aa  155  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  28.86 
 
 
568 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  31.12 
 
 
480 aa  153  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  30.79 
 
 
536 aa  153  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  28.04 
 
 
434 aa  151  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  30.94 
 
 
479 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  30.94 
 
 
509 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  33.62 
 
 
474 aa  150  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  33.62 
 
 
474 aa  150  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  30.28 
 
 
426 aa  150  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  32.98 
 
 
489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  35.71 
 
 
547 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  27.94 
 
 
434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  36.26 
 
 
478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  30.94 
 
 
476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  30.94 
 
 
577 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  30.94 
 
 
476 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  30.94 
 
 
476 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  29.84 
 
 
486 aa  148  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  33.99 
 
 
501 aa  147  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  29.47 
 
 
505 aa  147  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  30.93 
 
 
455 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  33.86 
 
 
483 aa  144  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2299  6-phosphatase  35.56 
 
 
468 aa  143  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0558896 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  27.94 
 
 
502 aa  143  8e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  28.51 
 
 
565 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  30.62 
 
 
433 aa  141  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5695  6-phosphatase  34.25 
 
 
611 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166468  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  32.68 
 
 
525 aa  140  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  32.67 
 
 
476 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  26.93 
 
 
498 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  26.93 
 
 
498 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  33.65 
 
 
388 aa  139  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  26.93 
 
 
498 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  26.93 
 
 
501 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  28.29 
 
 
527 aa  137  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4547  alkaline phosphatase  32.78 
 
 
464 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19358  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  33.15 
 
 
471 aa  136  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  33.14 
 
 
454 aa  136  9e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  32.87 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  32.87 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  32.87 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  32.87 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  27.92 
 
 
498 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  27.92 
 
 
498 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  35.28 
 
 
461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  32.87 
 
 
471 aa  135  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  27.72 
 
 
498 aa  135  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  32.59 
 
 
471 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1376  alkaline phosphatase  34.3 
 
 
558 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0116315  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  32.59 
 
 
471 aa  134  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  32.63 
 
 
525 aa  133  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  27.76 
 
 
568 aa  133  7.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  31.93 
 
 
589 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  34.86 
 
 
461 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1253  alkaline phosphatase  39.91 
 
 
335 aa  133  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  34.86 
 
 
461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>