225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1592 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  53.53 
 
 
581 aa  637    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  100 
 
 
581 aa  1197    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  53.53 
 
 
581 aa  634  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  50.61 
 
 
580 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  50.7 
 
 
609 aa  601  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  51.21 
 
 
584 aa  599  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  49.4 
 
 
584 aa  590  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  48.19 
 
 
584 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  49.23 
 
 
589 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  49.05 
 
 
584 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  50.52 
 
 
582 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  49.57 
 
 
585 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  40.65 
 
 
671 aa  395  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2364  alkaline phosphatase  40.11 
 
 
575 aa  375  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0542806  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  38.49 
 
 
585 aa  366  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  38.49 
 
 
585 aa  366  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3000  alkaline phosphatase  39.12 
 
 
575 aa  362  1e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2187  alkaline phosphatase family protein  33.45 
 
 
689 aa  257  4e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.838845  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02493  extracellular phytase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14030)  31.62 
 
 
663 aa  254  4.0000000000000004e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.468824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  32.06 
 
 
470 aa  187  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  31.19 
 
 
467 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  31.81 
 
 
468 aa  181  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  34.23 
 
 
464 aa  180  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  34.02 
 
 
464 aa  179  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  33.47 
 
 
467 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  32.31 
 
 
466 aa  178  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  31.43 
 
 
505 aa  177  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  31.98 
 
 
471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  31.96 
 
 
467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  31.96 
 
 
467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  31.96 
 
 
467 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  31.77 
 
 
547 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  31.75 
 
 
467 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  31.75 
 
 
467 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  31.75 
 
 
467 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  31.75 
 
 
467 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  30.22 
 
 
548 aa  172  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  30.94 
 
 
478 aa  169  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  30.86 
 
 
480 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  30.88 
 
 
478 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  31.42 
 
 
463 aa  166  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  30.02 
 
 
543 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  30.99 
 
 
545 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  29.55 
 
 
498 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  29.55 
 
 
501 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  29.55 
 
 
498 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  29.55 
 
 
498 aa  164  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  30.77 
 
 
485 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  30.65 
 
 
486 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  34.47 
 
 
541 aa  162  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  30.57 
 
 
485 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  29.52 
 
 
568 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  29.49 
 
 
532 aa  160  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  30.2 
 
 
498 aa  160  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  30.2 
 
 
498 aa  159  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  29.76 
 
 
545 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  30.39 
 
 
498 aa  159  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  29.56 
 
 
545 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  29.74 
 
 
568 aa  159  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  31.39 
 
 
518 aa  159  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  29.56 
 
 
545 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  29.56 
 
 
545 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  30.1 
 
 
565 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  31.4 
 
 
527 aa  157  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  28.69 
 
 
543 aa  157  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  28.51 
 
 
548 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  30.99 
 
 
557 aa  155  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  29.08 
 
 
546 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  30.92 
 
 
489 aa  154  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  29.01 
 
 
546 aa  153  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  28.75 
 
 
546 aa  153  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  28.46 
 
 
496 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  35.31 
 
 
476 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  29.58 
 
 
483 aa  152  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  35.15 
 
 
471 aa  152  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  29.13 
 
 
455 aa  152  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  34.88 
 
 
471 aa  151  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  34.88 
 
 
471 aa  151  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  30.43 
 
 
509 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  34.88 
 
 
471 aa  151  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  32.42 
 
 
525 aa  151  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  30.43 
 
 
479 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  30.43 
 
 
476 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  29.85 
 
 
434 aa  150  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  34.88 
 
 
471 aa  150  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  34.88 
 
 
471 aa  150  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  34.6 
 
 
471 aa  150  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  34.6 
 
 
471 aa  150  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  36.12 
 
 
426 aa  150  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  30.37 
 
 
476 aa  150  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  30.37 
 
 
476 aa  150  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  31.26 
 
 
640 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  29.71 
 
 
616 aa  149  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  30.36 
 
 
496 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  28.8 
 
 
552 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  30.37 
 
 
577 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  28.97 
 
 
502 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  33.84 
 
 
525 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  34.66 
 
 
471 aa  147  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  29.4 
 
 
527 aa  147  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>