225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1655 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  98.41 
 
 
565 aa  1110    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  64.96 
 
 
568 aa  753    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1655  alkaline phosphatase  100 
 
 
576 aa  1188    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.403448  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  70.66 
 
 
568 aa  771    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  49.8 
 
 
545 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  50.71 
 
 
543 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  49.8 
 
 
545 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  49.8 
 
 
545 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  49.8 
 
 
545 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  49.8 
 
 
545 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  49.7 
 
 
543 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  49.19 
 
 
546 aa  445  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  49.19 
 
 
546 aa  445  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  49.19 
 
 
546 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  44.96 
 
 
502 aa  444  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  48.09 
 
 
498 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  48.09 
 
 
498 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  48.09 
 
 
501 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  48.09 
 
 
498 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  48.09 
 
 
499 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  48.09 
 
 
498 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  48.09 
 
 
498 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  49.8 
 
 
535 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  47.89 
 
 
498 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  46.54 
 
 
616 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  46.68 
 
 
496 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  47.57 
 
 
548 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  48.95 
 
 
552 aa  422  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  45.88 
 
 
496 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  49.1 
 
 
505 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  47.05 
 
 
640 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  45.59 
 
 
527 aa  411  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  44.67 
 
 
565 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  47.09 
 
 
527 aa  394  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  46.02 
 
 
527 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  43.98 
 
 
532 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  42.77 
 
 
501 aa  322  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  39.92 
 
 
467 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  38.19 
 
 
464 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  38.4 
 
 
464 aa  260  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  39.75 
 
 
467 aa  260  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  37.05 
 
 
518 aa  255  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  36.73 
 
 
470 aa  253  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  38.64 
 
 
467 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  38.64 
 
 
467 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  38.64 
 
 
467 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  38.64 
 
 
467 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  38.64 
 
 
467 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  38.14 
 
 
463 aa  246  8e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  38.64 
 
 
467 aa  246  9e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  38.64 
 
 
467 aa  246  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  39.27 
 
 
478 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  39.09 
 
 
468 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  36.35 
 
 
485 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  36.14 
 
 
485 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  37.84 
 
 
466 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  39.59 
 
 
471 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  36.14 
 
 
486 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  39.11 
 
 
478 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  39.2 
 
 
480 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  38.91 
 
 
509 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  38.91 
 
 
479 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  38.91 
 
 
476 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  39.11 
 
 
577 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  38.91 
 
 
476 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  38.91 
 
 
476 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  38.71 
 
 
557 aa  226  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  35.93 
 
 
483 aa  219  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  32.34 
 
 
671 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  30.65 
 
 
581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  32.72 
 
 
455 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  30.65 
 
 
581 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  30.12 
 
 
581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  31.52 
 
 
609 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  29.09 
 
 
580 aa  151  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  30.38 
 
 
584 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  30.22 
 
 
584 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  30.26 
 
 
584 aa  146  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  30.94 
 
 
585 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  29.26 
 
 
434 aa  145  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  29.26 
 
 
434 aa  143  9e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737.1  alkaline phosphatase  47.56 
 
 
215 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  28.37 
 
 
584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  29.3 
 
 
582 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  29.76 
 
 
589 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  28.42 
 
 
506 aa  137  8e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  28.21 
 
 
433 aa  131  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  33.24 
 
 
525 aa  131  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  32.68 
 
 
525 aa  130  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  30.69 
 
 
461 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3809  alkaline phosphatase  33.25 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227259  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  29.03 
 
 
585 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  29.03 
 
 
585 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  30.93 
 
 
461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  30.93 
 
 
461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  30.93 
 
 
461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  33.23 
 
 
436 aa  127  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  30.74 
 
 
461 aa  127  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  31.64 
 
 
541 aa  127  6e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  30.28 
 
 
461 aa  127  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>