226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3539 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  78.12 
 
 
535 aa  832    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  95.89 
 
 
545 aa  1035    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  80.26 
 
 
543 aa  893    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  98.72 
 
 
546 aa  1103    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  98.72 
 
 
546 aa  1104    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  79.85 
 
 
543 aa  867    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  95.89 
 
 
545 aa  1035    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  100 
 
 
546 aa  1118    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  95.89 
 
 
545 aa  1035    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  95.76 
 
 
545 aa  1048    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  82.35 
 
 
545 aa  937    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  58.11 
 
 
501 aa  555  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  58.11 
 
 
498 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  58.11 
 
 
498 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  55.56 
 
 
552 aa  552  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  58.11 
 
 
498 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  55.53 
 
 
616 aa  550  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  57.7 
 
 
496 aa  545  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  58.32 
 
 
499 aa  541  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  57.49 
 
 
498 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  57.49 
 
 
498 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  57.29 
 
 
498 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  59.31 
 
 
496 aa  536  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  56.88 
 
 
502 aa  538  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  53.85 
 
 
532 aa  526  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  55.25 
 
 
527 aa  524  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  51.14 
 
 
565 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  52.28 
 
 
527 aa  518  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  55.72 
 
 
640 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  54.36 
 
 
505 aa  498  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  52.55 
 
 
548 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  54.2 
 
 
527 aa  481  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  51.8 
 
 
568 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  49.59 
 
 
565 aa  426  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  46.22 
 
 
568 aa  418  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1655  alkaline phosphatase  48.78 
 
 
576 aa  410  1e-113  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.403448  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  44.81 
 
 
501 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  43.69 
 
 
464 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  43.48 
 
 
464 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  43.6 
 
 
467 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  40.17 
 
 
467 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  40.43 
 
 
466 aa  286  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  40.73 
 
 
478 aa  286  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  40.08 
 
 
470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  39.96 
 
 
485 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  39.96 
 
 
485 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  40.63 
 
 
467 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  40.63 
 
 
467 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  40.63 
 
 
467 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  40.63 
 
 
467 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  40.21 
 
 
467 aa  280  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  40.21 
 
 
467 aa  280  6e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  39.62 
 
 
463 aa  279  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  40.42 
 
 
467 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  39.68 
 
 
486 aa  277  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  38.46 
 
 
518 aa  274  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  40.53 
 
 
468 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  39.96 
 
 
479 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  39.96 
 
 
509 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  40 
 
 
557 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  39.96 
 
 
471 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  39.96 
 
 
476 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  39.96 
 
 
476 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  39.96 
 
 
577 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  39.96 
 
 
476 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  40.25 
 
 
480 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  39.92 
 
 
483 aa  261  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  40.37 
 
 
478 aa  259  8e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  38.66 
 
 
671 aa  172  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737.1  alkaline phosphatase  55.15 
 
 
215 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1075  Alkaline phosphatase  31.99 
 
 
635 aa  164  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  30.79 
 
 
434 aa  163  9e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  31.7 
 
 
589 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  30.57 
 
 
434 aa  159  9e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  31.42 
 
 
584 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  30.71 
 
 
581 aa  159  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  32.06 
 
 
585 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  33.71 
 
 
506 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  30.35 
 
 
581 aa  156  8e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  28.83 
 
 
581 aa  153  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  30.12 
 
 
585 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  30.12 
 
 
585 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  33.13 
 
 
436 aa  151  3e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  34.04 
 
 
541 aa  150  7e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  36.09 
 
 
455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  30.29 
 
 
584 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  35.15 
 
 
388 aa  145  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  30.08 
 
 
584 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  30.32 
 
 
582 aa  144  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  32.11 
 
 
589 aa  143  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  32.75 
 
 
609 aa  141  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  35.08 
 
 
525 aa  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  28.66 
 
 
547 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2068  Alkaline phosphatase  33.23 
 
 
503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.731445 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3000  alkaline phosphatase  28.16 
 
 
575 aa  135  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2364  alkaline phosphatase  28.11 
 
 
575 aa  134  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0542806  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  32.37 
 
 
584 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2299  6-phosphatase  32.09 
 
 
468 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0558896 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  28.73 
 
 
580 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  34.7 
 
 
475 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>