228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2299 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2299  6-phosphatase  100 
 
 
468 aa  951    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0558896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1075  Alkaline phosphatase  50.76 
 
 
635 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5695  6-phosphatase  45.23 
 
 
611 aa  347  4e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166468  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  42.7 
 
 
475 aa  314  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  43.37 
 
 
471 aa  309  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  43.15 
 
 
471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  43.15 
 
 
471 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  42.92 
 
 
471 aa  307  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  42.92 
 
 
471 aa  307  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  42.92 
 
 
471 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  42.92 
 
 
471 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  42.7 
 
 
471 aa  305  8.000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  43.37 
 
 
471 aa  305  9.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3809  alkaline phosphatase  43.99 
 
 
467 aa  299  6e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227259  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  42.73 
 
 
481 aa  295  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4018  Alkaline phosphatase  39.78 
 
 
492 aa  294  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.306331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  43.99 
 
 
476 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  42.5 
 
 
454 aa  290  4e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1946  alkaline phosphatase  40.95 
 
 
481 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2291  alkaline phosphatase  40.95 
 
 
481 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1835  alkaline phosphatase  40.95 
 
 
481 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541069  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1828  alkaline phosphatase  43.99 
 
 
476 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4466  alkaline phosphatase  35.8 
 
 
499 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4297  alkaline phosphatase  35.8 
 
 
499 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4197  alkaline phosphatase  35.8 
 
 
499 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  34.11 
 
 
467 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  33.98 
 
 
505 aa  168  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  33.82 
 
 
467 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  33.82 
 
 
467 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  33.61 
 
 
467 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  33.61 
 
 
467 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  33.61 
 
 
467 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  33.61 
 
 
467 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  33.61 
 
 
467 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  35.57 
 
 
584 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  33.69 
 
 
463 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  32.92 
 
 
485 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  32.85 
 
 
485 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  32.77 
 
 
501 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  30.63 
 
 
616 aa  157  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  33.69 
 
 
466 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  31.85 
 
 
467 aa  156  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  35.4 
 
 
584 aa  156  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  31.61 
 
 
486 aa  156  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  29.09 
 
 
565 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  34.08 
 
 
474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  34.08 
 
 
474 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  31.37 
 
 
464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  29.47 
 
 
388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  30.04 
 
 
450 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  31.37 
 
 
464 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  31.64 
 
 
545 aa  148  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  28.57 
 
 
640 aa  147  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  31.34 
 
 
426 aa  147  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  33.08 
 
 
671 aa  146  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  28.49 
 
 
552 aa  146  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  31.1 
 
 
543 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  29.57 
 
 
543 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  35.77 
 
 
584 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  35.56 
 
 
580 aa  143  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  32.6 
 
 
470 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  33.51 
 
 
527 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  28.08 
 
 
506 aa  141  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  31.62 
 
 
489 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  36.29 
 
 
480 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  28.32 
 
 
527 aa  138  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  30.5 
 
 
455 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  35.69 
 
 
478 aa  137  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  29.15 
 
 
545 aa  136  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  29.15 
 
 
545 aa  136  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  29.15 
 
 
545 aa  136  8e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  28.35 
 
 
434 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  32.59 
 
 
548 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  29.15 
 
 
545 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  28.89 
 
 
546 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  28.35 
 
 
434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  28.97 
 
 
532 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2187  alkaline phosphatase family protein  32.15 
 
 
689 aa  134  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.838845  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  28.69 
 
 
546 aa  134  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  28.69 
 
 
546 aa  134  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  32.32 
 
 
468 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  31.89 
 
 
518 aa  133  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  31.93 
 
 
471 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  33.24 
 
 
541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  32.69 
 
 
581 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  33.6 
 
 
568 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  28.04 
 
 
527 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  31.16 
 
 
548 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  32.51 
 
 
581 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  35.79 
 
 
478 aa  130  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  34.06 
 
 
483 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  32.16 
 
 
436 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  28.3 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  30.55 
 
 
535 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  31.52 
 
 
536 aa  125  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  31.65 
 
 
609 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  31.67 
 
 
581 aa  125  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  27.27 
 
 
496 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  30.5 
 
 
547 aa  123  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1253  alkaline phosphatase  29.53 
 
 
335 aa  123  9e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>