225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2187 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2187  alkaline phosphatase family protein  100 
 
 
689 aa  1402    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.838845  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  35.73 
 
 
584 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  35.67 
 
 
584 aa  286  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  34.78 
 
 
580 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  33.75 
 
 
609 aa  277  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  34.16 
 
 
671 aa  271  2.9999999999999997e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  37.2 
 
 
582 aa  264  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  35.71 
 
 
584 aa  259  9e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  35.65 
 
 
589 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  36.17 
 
 
584 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  33.45 
 
 
581 aa  257  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  34.1 
 
 
581 aa  256  8e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  34.42 
 
 
581 aa  256  8e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  35.52 
 
 
585 aa  250  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  31.32 
 
 
585 aa  230  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  31.32 
 
 
585 aa  230  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3000  alkaline phosphatase  32.96 
 
 
575 aa  226  8e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2364  alkaline phosphatase  32.33 
 
 
575 aa  219  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0542806  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02493  extracellular phytase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14030)  28.97 
 
 
663 aa  184  6e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.468824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  34.65 
 
 
467 aa  163  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  34.65 
 
 
464 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  35.96 
 
 
478 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  34.12 
 
 
464 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  30.83 
 
 
485 aa  153  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  30.64 
 
 
485 aa  152  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  31.93 
 
 
467 aa  151  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  31.93 
 
 
467 aa  151  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  31.93 
 
 
467 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  31.75 
 
 
467 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  31.75 
 
 
467 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  31.75 
 
 
467 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  31.75 
 
 
467 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  35.51 
 
 
480 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  34.21 
 
 
466 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  32.52 
 
 
450 aa  145  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  30.11 
 
 
478 aa  140  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  30.79 
 
 
518 aa  139  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  31.57 
 
 
463 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  29.1 
 
 
467 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  32.2 
 
 
468 aa  138  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  28.21 
 
 
433 aa  138  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  33.33 
 
 
426 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  28.21 
 
 
470 aa  137  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  27.54 
 
 
436 aa  137  9e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  32.64 
 
 
483 aa  134  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  31.94 
 
 
471 aa  134  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  28.6 
 
 
486 aa  134  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2299  6-phosphatase  32.15 
 
 
468 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0558896 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  28.32 
 
 
434 aa  132  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  28.68 
 
 
474 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  28.68 
 
 
474 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  32.36 
 
 
527 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5695  6-phosphatase  31.84 
 
 
611 aa  128  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166468  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  28.12 
 
 
434 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  32.23 
 
 
455 aa  126  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  31.59 
 
 
548 aa  126  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  31.98 
 
 
505 aa  125  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  29.97 
 
 
541 aa  124  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  32.38 
 
 
471 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  32.38 
 
 
471 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3809  alkaline phosphatase  31.78 
 
 
467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227259  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  32.38 
 
 
471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  29.94 
 
 
557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4547  alkaline phosphatase  31.7 
 
 
464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19358  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  32.12 
 
 
471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1376  alkaline phosphatase  30.46 
 
 
558 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0116315  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  32.38 
 
 
471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  32.38 
 
 
471 aa  122  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  29.74 
 
 
552 aa  122  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  27.54 
 
 
545 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  32.38 
 
 
471 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  32.38 
 
 
471 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  27.54 
 
 
545 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  27.54 
 
 
545 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  27.54 
 
 
545 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  29.94 
 
 
509 aa  120  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  29.94 
 
 
476 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  30.48 
 
 
559 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  30.13 
 
 
479 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  29.94 
 
 
577 aa  118  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2999  alkaline phosphatase  28.92 
 
 
557 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886968 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  30.13 
 
 
476 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  30.13 
 
 
476 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2789  alkaline phosphatase  28.92 
 
 
557 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.670968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  28.92 
 
 
557 aa  117  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  31.01 
 
 
476 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  27.74 
 
 
545 aa  117  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1253  alkaline phosphatase  28.5 
 
 
335 aa  117  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  29.06 
 
 
547 aa  117  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  29.32 
 
 
489 aa  117  8.999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1963  alkaline phosphatase  25.94 
 
 
477 aa  117  8.999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2627  alkaline phosphatase  28.57 
 
 
530 aa  117  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0512  alkaline phosphatase  28.23 
 
 
521 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4466  alkaline phosphatase  28.12 
 
 
499 aa  117  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4297  alkaline phosphatase  28.12 
 
 
499 aa  117  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4197  alkaline phosphatase  28.12 
 
 
499 aa  117  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  28.53 
 
 
525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1075  Alkaline phosphatase  28.91 
 
 
635 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3577  alkaline phosphatase  28.61 
 
 
437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0130051  normal  0.0343201 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  27.45 
 
 
543 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>