226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4018 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_4018  Alkaline phosphatase  100 
 
 
492 aa  992    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.306331  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  62.5 
 
 
471 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  62.5 
 
 
471 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  62.05 
 
 
471 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  62.05 
 
 
471 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  62.27 
 
 
471 aa  537  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  62.05 
 
 
471 aa  535  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  61.59 
 
 
471 aa  533  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  61.59 
 
 
471 aa  533  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  61.14 
 
 
471 aa  527  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  56.51 
 
 
475 aa  522  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  54.81 
 
 
476 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  54.43 
 
 
481 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3809  alkaline phosphatase  58.18 
 
 
467 aa  496  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227259  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1828  alkaline phosphatase  55.02 
 
 
476 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  56.43 
 
 
454 aa  491  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1946  alkaline phosphatase  58.86 
 
 
481 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1835  alkaline phosphatase  58.86 
 
 
481 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541069  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2291  alkaline phosphatase  58.86 
 
 
481 aa  486  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2299  6-phosphatase  40.09 
 
 
468 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0558896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5695  6-phosphatase  40.18 
 
 
611 aa  283  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166468  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1075  Alkaline phosphatase  38.7 
 
 
635 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4466  alkaline phosphatase  32.99 
 
 
499 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4297  alkaline phosphatase  32.99 
 
 
499 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4197  alkaline phosphatase  32.99 
 
 
499 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  33.99 
 
 
455 aa  176  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  37.08 
 
 
489 aa  156  9e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  30.34 
 
 
434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  29.28 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  35.63 
 
 
474 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  35.63 
 
 
474 aa  147  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1220  alkaline phosphatase  34.55 
 
 
454 aa  147  4.0000000000000006e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.199561 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  29.5 
 
 
434 aa  143  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  31.02 
 
 
450 aa  143  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  34.38 
 
 
581 aa  141  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  32.62 
 
 
436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  29.14 
 
 
467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0541  alkaline phosphatase  33.13 
 
 
455 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  32.72 
 
 
426 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  35.34 
 
 
505 aa  138  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4547  alkaline phosphatase  33.48 
 
 
464 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19358  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  32.67 
 
 
506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  31.67 
 
 
671 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3226  alkaline phosphatase  31.02 
 
 
543 aa  133  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  31.87 
 
 
536 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  31.52 
 
 
584 aa  131  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  29.28 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3069  alkaline phosphatase  34.51 
 
 
461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.13276  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  28.96 
 
 
485 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  28.54 
 
 
485 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  29.24 
 
 
466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  34.73 
 
 
461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1963  alkaline phosphatase  30.59 
 
 
477 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0830  alkaline phosphatase  32.73 
 
 
454 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  34.73 
 
 
461 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  34.73 
 
 
461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  34.73 
 
 
461 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0832  Alkaline phosphatase  33.73 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.201361  hitchhiker  0.000000624309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0807  alkaline phosphatase  33.73 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.157907  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  34.43 
 
 
461 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  31.28 
 
 
585 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  32.11 
 
 
609 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  34.73 
 
 
461 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  30.71 
 
 
589 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3057  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
557 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290343  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3529  alkaline phosphatase  33.73 
 
 
425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  27.7 
 
 
467 aa  126  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  31.21 
 
 
565 aa  127  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  34.26 
 
 
501 aa  127  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  31.02 
 
 
467 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  28.85 
 
 
548 aa  126  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  34.43 
 
 
461 aa  126  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  34.13 
 
 
461 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  32.58 
 
 
580 aa  126  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  30.56 
 
 
584 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  31.02 
 
 
467 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  31.02 
 
 
467 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  34.13 
 
 
461 aa  126  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0839  alkaline phosphatase  33.43 
 
 
439 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029758  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  28.78 
 
 
468 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  30.72 
 
 
541 aa  125  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  32.86 
 
 
584 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  28.33 
 
 
486 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2068  Alkaline phosphatase  28.27 
 
 
503 aa  125  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.731445 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10563  alkaline phosphatase Pho8 (AFU_orthologue; AFUA_2G03110)  29.34 
 
 
606 aa  124  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00384867  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  30.75 
 
 
467 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  30.75 
 
 
467 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  30.75 
 
 
467 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  30.75 
 
 
467 aa  124  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3163  alkaline phosphatase  32.53 
 
 
440 aa  123  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  31.27 
 
 
525 aa  123  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3334  alkaline phosphatase  32.23 
 
 
464 aa  123  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460032  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3446  alkaline phosphatase  32.23 
 
 
464 aa  123  8e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00260506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  30.38 
 
 
584 aa  123  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2627  alkaline phosphatase  29.95 
 
 
530 aa  123  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  31.59 
 
 
478 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  30.47 
 
 
463 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  30.6 
 
 
559 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1216  alkaline phosphatase  32.22 
 
 
429 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0688  alkaline phosphatase  32.23 
 
 
470 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.678776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>