228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1200 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  71.85 
 
 
471 aa  662    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  71.62 
 
 
471 aa  661    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  67.52 
 
 
475 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1835  alkaline phosphatase  71.14 
 
 
481 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  71.62 
 
 
471 aa  660    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  100 
 
 
481 aa  989    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1946  alkaline phosphatase  71.14 
 
 
481 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  71.4 
 
 
471 aa  658    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  71.4 
 
 
471 aa  659    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  71.85 
 
 
471 aa  662    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  98.46 
 
 
454 aa  919    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2291  alkaline phosphatase  71.14 
 
 
481 aa  643    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  71.62 
 
 
471 aa  662    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  67.88 
 
 
476 aa  647    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  71.85 
 
 
471 aa  662    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  67.58 
 
 
471 aa  653    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1828  alkaline phosphatase  67.67 
 
 
476 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3809  alkaline phosphatase  67.95 
 
 
467 aa  612  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227259  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4018  Alkaline phosphatase  56.92 
 
 
492 aa  496  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.306331  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1075  Alkaline phosphatase  42.76 
 
 
635 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5695  6-phosphatase  42.6 
 
 
611 aa  294  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166468  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2299  6-phosphatase  42.73 
 
 
468 aa  292  7e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0558896 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  40.61 
 
 
455 aa  208  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4466  alkaline phosphatase  40.06 
 
 
499 aa  196  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4297  alkaline phosphatase  40.06 
 
 
499 aa  196  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4197  alkaline phosphatase  40.06 
 
 
499 aa  196  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  35.92 
 
 
474 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  35.92 
 
 
474 aa  182  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  37.39 
 
 
489 aa  179  9e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  33.03 
 
 
450 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  32.28 
 
 
467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  31.98 
 
 
434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  33 
 
 
470 aa  163  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  29.82 
 
 
433 aa  162  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  31.34 
 
 
434 aa  159  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0541  alkaline phosphatase  35.09 
 
 
455 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4547  alkaline phosphatase  32.79 
 
 
464 aa  157  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19358  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  31.33 
 
 
485 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1220  alkaline phosphatase  33.82 
 
 
454 aa  157  4e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.199561 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  31.33 
 
 
485 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  31.22 
 
 
464 aa  156  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  32.82 
 
 
426 aa  155  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  32.5 
 
 
478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  31.01 
 
 
464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2976  alkaline phosphatase  31.72 
 
 
461 aa  154  4e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  37.54 
 
 
461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  37.54 
 
 
461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  37.54 
 
 
461 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  37.54 
 
 
461 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4136  alkaline phosphatase  35.05 
 
 
476 aa  152  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  37.54 
 
 
461 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  37.54 
 
 
461 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  32.24 
 
 
483 aa  151  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  36.94 
 
 
461 aa  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  36.29 
 
 
501 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
589 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  32.99 
 
 
480 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  36.9 
 
 
461 aa  150  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3069  alkaline phosphatase  37.24 
 
 
461 aa  150  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.13276  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  33.2 
 
 
478 aa  149  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  30.23 
 
 
486 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  33.9 
 
 
671 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  33.42 
 
 
581 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  36.64 
 
 
461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  29.36 
 
 
541 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  31.44 
 
 
536 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  37.2 
 
 
461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  34 
 
 
584 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  33.71 
 
 
585 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  32.55 
 
 
581 aa  146  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3226  alkaline phosphatase  33.53 
 
 
543 aa  145  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  32.44 
 
 
548 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2068  Alkaline phosphatase  31.53 
 
 
503 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.731445 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  32.36 
 
 
581 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3163  alkaline phosphatase  34.99 
 
 
440 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  32.16 
 
 
509 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  31.83 
 
 
557 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  32.99 
 
 
577 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0830  alkaline phosphatase  34.02 
 
 
454 aa  144  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  33.79 
 
 
467 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  33.61 
 
 
466 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3446  alkaline phosphatase  34.4 
 
 
464 aa  144  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00260506 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  33.79 
 
 
467 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  33.79 
 
 
467 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  32.16 
 
 
476 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  32.16 
 
 
476 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  33.79 
 
 
467 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0688  alkaline phosphatase  34.4 
 
 
470 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.678776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3334  alkaline phosphatase  34.4 
 
 
464 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460032  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  32.16 
 
 
479 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  33.79 
 
 
467 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  32.16 
 
 
476 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  33.79 
 
 
467 aa  144  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  33.79 
 
 
467 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  31.23 
 
 
388 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  29.74 
 
 
505 aa  141  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2627  alkaline phosphatase  30.96 
 
 
530 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  31.55 
 
 
584 aa  140  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  33.06 
 
 
463 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  34.18 
 
 
525 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>