227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3334 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0807  alkaline phosphatase  91.44 
 
 
439 aa  796    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.157907  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0830  alkaline phosphatase  92.2 
 
 
454 aa  754    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0839  alkaline phosphatase  90.77 
 
 
439 aa  791    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029758  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0832  Alkaline phosphatase  91.22 
 
 
439 aa  795    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.201361  hitchhiker  0.000000624309 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0688  alkaline phosphatase  100 
 
 
470 aa  847    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.678776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3334  alkaline phosphatase  100 
 
 
464 aa  950    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460032  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3446  alkaline phosphatase  99.78 
 
 
464 aa  946    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00260506 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3529  alkaline phosphatase  91.73 
 
 
425 aa  790    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3163  alkaline phosphatase  92.12 
 
 
440 aa  805    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0541  alkaline phosphatase  71.15 
 
 
455 aa  624  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0598  alkaline phosphatase  70.76 
 
 
445 aa  589  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.383819  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0573  alkaline phosphatase  68.53 
 
 
492 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.949232  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3974  alkaline phosphatase  72.36 
 
 
457 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3226  alkaline phosphatase  64.23 
 
 
543 aa  566  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4136  alkaline phosphatase  69.88 
 
 
476 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2976  alkaline phosphatase  64.12 
 
 
461 aa  555  1e-157  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1207  alkaline phosphatase  49.4 
 
 
464 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0124836  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1216  alkaline phosphatase  52.68 
 
 
429 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0989  alkaline phosphatase  46.76 
 
 
480 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.544846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1963  alkaline phosphatase  47.73 
 
 
477 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01328  alkaline phosphatase  49.67 
 
 
488 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.29586  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1098  putative alkaline phosphatase  48.45 
 
 
473 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.374892  decreased coverage  0.00462057 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  37.72 
 
 
474 aa  316  7e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  37.72 
 
 
474 aa  316  7e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  42.99 
 
 
461 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  42.99 
 
 
461 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  42.99 
 
 
461 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  42.53 
 
 
461 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  42.31 
 
 
461 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  42.76 
 
 
461 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  42.31 
 
 
461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  42.08 
 
 
461 aa  310  5e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  42.08 
 
 
461 aa  310  5e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  42.08 
 
 
461 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3069  alkaline phosphatase  41.4 
 
 
461 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.13276  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  37.79 
 
 
489 aa  293  4e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  39 
 
 
455 aa  265  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  34.62 
 
 
434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  34.3 
 
 
434 aa  234  3e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  32.1 
 
 
536 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  32.18 
 
 
547 aa  205  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  32.87 
 
 
506 aa  205  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  32.07 
 
 
589 aa  203  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  33.25 
 
 
436 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  31.76 
 
 
541 aa  200  6e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  34.05 
 
 
433 aa  198  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10563  alkaline phosphatase Pho8 (AFU_orthologue; AFUA_2G03110)  32.9 
 
 
606 aa  195  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00384867  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1220  alkaline phosphatase  32.72 
 
 
454 aa  194  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.199561 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  31.95 
 
 
450 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3036  alkaline phosphatase  32.04 
 
 
557 aa  193  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000723096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2789  alkaline phosphatase  32.34 
 
 
557 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.670968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  32.34 
 
 
557 aa  193  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2999  alkaline phosphatase  32.13 
 
 
557 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886968 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3038  alkaline phosphatase  32.57 
 
 
553 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2738  alkaline phosphatase  31.91 
 
 
557 aa  192  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.133398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2719  alkaline phosphatase  32.73 
 
 
557 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82654  vacuolar alkaline phosphatase  32.74 
 
 
560 aa  191  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.134835 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1253  alkaline phosphatase  36.42 
 
 
335 aa  190  5.999999999999999e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2238  alkaline phosphatase  31.46 
 
 
557 aa  189  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177606  hitchhiker  0.000000857533 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3003  alkaline phosphatase  31.46 
 
 
557 aa  189  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3057  alkaline phosphatase  31.41 
 
 
557 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290343  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0524  Alkaline phosphatase  30.4 
 
 
537 aa  186  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  32.13 
 
 
426 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2292  Alkaline phosphatase  32.38 
 
 
487 aa  177  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  29.7 
 
 
548 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2627  alkaline phosphatase  35 
 
 
530 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0399  Alkaline phosphatase  32.95 
 
 
469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2068  Alkaline phosphatase  34.67 
 
 
503 aa  170  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.731445 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2693  alkaline phosphatase  29.9 
 
 
501 aa  167  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0930  Alkaline phosphatase  30.38 
 
 
537 aa  167  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0890  alkaline phosphatase, putative  30.67 
 
 
563 aa  164  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  28.99 
 
 
525 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  33.44 
 
 
525 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  37.29 
 
 
388 aa  159  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4547  alkaline phosphatase  35.8 
 
 
464 aa  159  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19358  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2447  Alkaline phosphatase  32.42 
 
 
486 aa  157  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  35.33 
 
 
471 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  35.03 
 
 
471 aa  157  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  35.33 
 
 
471 aa  157  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  35.33 
 
 
471 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  34.76 
 
 
471 aa  157  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  35.03 
 
 
471 aa  156  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1700  Alkaline phosphatase  30.49 
 
 
490 aa  156  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  35.03 
 
 
471 aa  156  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  35.33 
 
 
471 aa  156  8e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  34.4 
 
 
481 aa  155  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43722  vacuolar alkaline phosphatase  31.69 
 
 
501 aa  155  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.563768  normal  0.0682876 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  28.91 
 
 
559 aa  155  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3187  alkaline phosphatase  29.6 
 
 
468 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  34.12 
 
 
471 aa  153  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0502  alkaline phosphatase  29.72 
 
 
554 aa  153  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1216  alkaline phosphatase  28.89 
 
 
494 aa  152  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516371  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1376  alkaline phosphatase  32.69 
 
 
558 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0116315  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0924  Alkaline phosphatase  29.87 
 
 
527 aa  151  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000229427  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3577  alkaline phosphatase  29.86 
 
 
437 aa  150  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0130051  normal  0.0343201 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  34.11 
 
 
454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0512  Alkaline phosphatase  29.77 
 
 
501 aa  147  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.239781  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2472  Alkaline phosphatase  31.4 
 
 
481 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000616832  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  32.64 
 
 
475 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
476 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>