226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0573 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0573  alkaline phosphatase  100 
 
 
492 aa  1001    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.949232  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3163  alkaline phosphatase  70.39 
 
 
440 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3529  alkaline phosphatase  68.72 
 
 
425 aa  581  1e-164  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0839  alkaline phosphatase  69.06 
 
 
439 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029758  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0598  alkaline phosphatase  67.21 
 
 
445 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.383819  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0832  Alkaline phosphatase  69.06 
 
 
439 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.201361  hitchhiker  0.000000624309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0807  alkaline phosphatase  69.06 
 
 
439 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.157907  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0541  alkaline phosphatase  66.99 
 
 
455 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3334  alkaline phosphatase  67.5 
 
 
464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460032  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3446  alkaline phosphatase  67.5 
 
 
464 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00260506 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0688  alkaline phosphatase  68.54 
 
 
470 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.678776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3974  alkaline phosphatase  68.87 
 
 
457 aa  558  1e-157  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4136  alkaline phosphatase  64.22 
 
 
476 aa  554  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0830  alkaline phosphatase  69.63 
 
 
454 aa  546  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3226  alkaline phosphatase  59.8 
 
 
543 aa  541  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2976  alkaline phosphatase  61.58 
 
 
461 aa  513  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1216  alkaline phosphatase  50.23 
 
 
429 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1207  alkaline phosphatase  47.62 
 
 
464 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0124836  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0989  alkaline phosphatase  44.03 
 
 
480 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.544846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1963  alkaline phosphatase  44 
 
 
477 aa  356  5e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1098  putative alkaline phosphatase  44.59 
 
 
473 aa  340  4e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.374892  decreased coverage  0.00462057 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01328  alkaline phosphatase  48.1 
 
 
488 aa  335  9e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.29586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  43.91 
 
 
461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  43.68 
 
 
461 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  43.91 
 
 
461 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  44.26 
 
 
461 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  44.02 
 
 
461 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  43.44 
 
 
461 aa  302  9e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  43.44 
 
 
461 aa  302  9e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  44.02 
 
 
461 aa  301  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  44.02 
 
 
461 aa  302  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  43.44 
 
 
461 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3069  alkaline phosphatase  43.54 
 
 
461 aa  300  5e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.13276  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  37.41 
 
 
489 aa  296  7e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  37.41 
 
 
474 aa  286  5e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  37.41 
 
 
474 aa  286  5e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  38.67 
 
 
455 aa  252  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  34.32 
 
 
434 aa  225  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  33.87 
 
 
434 aa  223  6e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  31.66 
 
 
547 aa  211  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  33.48 
 
 
541 aa  206  6e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  29.89 
 
 
536 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  33.1 
 
 
506 aa  197  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  31.59 
 
 
589 aa  195  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1220  alkaline phosphatase  31.01 
 
 
454 aa  189  9e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.199561 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  30.43 
 
 
450 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82654  vacuolar alkaline phosphatase  32.3 
 
 
560 aa  187  5e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.134835 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10563  alkaline phosphatase Pho8 (AFU_orthologue; AFUA_2G03110)  31.5 
 
 
606 aa  184  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00384867  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2238  alkaline phosphatase  31.72 
 
 
557 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177606  hitchhiker  0.000000857533 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  31.64 
 
 
436 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3038  alkaline phosphatase  31.75 
 
 
553 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3003  alkaline phosphatase  31.28 
 
 
557 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2789  alkaline phosphatase  31.04 
 
 
557 aa  183  7e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.670968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  31.04 
 
 
557 aa  183  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3057  alkaline phosphatase  30.23 
 
 
557 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2999  alkaline phosphatase  31.01 
 
 
557 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886968 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  33.65 
 
 
433 aa  182  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2719  alkaline phosphatase  30.79 
 
 
557 aa  179  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3036  alkaline phosphatase  30.34 
 
 
557 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000723096  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1253  alkaline phosphatase  33.53 
 
 
335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2738  alkaline phosphatase  30.11 
 
 
557 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.133398  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0524  Alkaline phosphatase  30.71 
 
 
537 aa  171  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  30.8 
 
 
548 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2627  alkaline phosphatase  33.53 
 
 
530 aa  170  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1376  alkaline phosphatase  31.32 
 
 
558 aa  170  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0116315  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2693  alkaline phosphatase  29.68 
 
 
501 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0890  alkaline phosphatase, putative  29.26 
 
 
563 aa  165  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  34.4 
 
 
471 aa  161  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  34.4 
 
 
471 aa  160  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  34.4 
 
 
471 aa  160  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4547  alkaline phosphatase  30.77 
 
 
464 aa  160  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19358  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  34.4 
 
 
471 aa  160  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  34.4 
 
 
471 aa  160  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2292  Alkaline phosphatase  31.59 
 
 
487 aa  160  7e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  34.11 
 
 
471 aa  160  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  33.82 
 
 
471 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  33.82 
 
 
471 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  33.48 
 
 
426 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2472  Alkaline phosphatase  33.63 
 
 
481 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000616832  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  32.5 
 
 
525 aa  154  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  28.52 
 
 
559 aa  151  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1700  Alkaline phosphatase  31.15 
 
 
490 aa  151  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  32.7 
 
 
525 aa  151  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  32.94 
 
 
471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0502  alkaline phosphatase  32.93 
 
 
554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  35.67 
 
 
388 aa  148  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43722  vacuolar alkaline phosphatase  31.45 
 
 
501 aa  147  4.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.563768  normal  0.0682876 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  33.33 
 
 
585 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2447  Alkaline phosphatase  31.01 
 
 
486 aa  147  5e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2225  Alkaline phosphatase  31.57 
 
 
481 aa  147  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2068  Alkaline phosphatase  29.53 
 
 
503 aa  147  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.731445 
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  31.53 
 
 
481 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2085  alkaline phosphatase  31.32 
 
 
491 aa  144  4e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419871  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1216  alkaline phosphatase  29.65 
 
 
494 aa  143  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516371  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  32.69 
 
 
584 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  33.53 
 
 
475 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0512  alkaline phosphatase  31.43 
 
 
521 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  32.17 
 
 
589 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  32.01 
 
 
454 aa  140  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3577  alkaline phosphatase  28.64 
 
 
437 aa  140  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0130051  normal  0.0343201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>