225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1207 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1207  alkaline phosphatase  100 
 
 
464 aa  963    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0124836  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0989  alkaline phosphatase  65.27 
 
 
480 aa  599  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.544846  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1098  putative alkaline phosphatase  64.88 
 
 
473 aa  589  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.374892  decreased coverage  0.00462057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0598  alkaline phosphatase  48.93 
 
 
445 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.383819  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3163  alkaline phosphatase  48.83 
 
 
440 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0541  alkaline phosphatase  47.88 
 
 
455 aa  392  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3529  alkaline phosphatase  48.45 
 
 
425 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0832  Alkaline phosphatase  48.45 
 
 
439 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.201361  hitchhiker  0.000000624309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0807  alkaline phosphatase  48.45 
 
 
439 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.157907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0839  alkaline phosphatase  48.21 
 
 
439 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029758  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2976  alkaline phosphatase  46.36 
 
 
461 aa  371  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0688  alkaline phosphatase  49.4 
 
 
470 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.678776 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3334  alkaline phosphatase  49.4 
 
 
464 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460032  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3446  alkaline phosphatase  49.4 
 
 
464 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00260506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0573  alkaline phosphatase  47.18 
 
 
492 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.949232  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3974  alkaline phosphatase  46.94 
 
 
457 aa  363  4e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1963  alkaline phosphatase  44.47 
 
 
477 aa  363  5.0000000000000005e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220862  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4136  alkaline phosphatase  48.15 
 
 
476 aa  361  1e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3226  alkaline phosphatase  47.73 
 
 
543 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0830  alkaline phosphatase  48.93 
 
 
454 aa  356  5e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1216  alkaline phosphatase  47.1 
 
 
429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01328  alkaline phosphatase  43.72 
 
 
488 aa  341  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.29586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  40.61 
 
 
461 aa  312  9e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  40.39 
 
 
461 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  40.39 
 
 
461 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  40.39 
 
 
461 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  40.39 
 
 
461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  40.17 
 
 
461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3069  alkaline phosphatase  42.72 
 
 
461 aa  310  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.13276  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  36.73 
 
 
489 aa  309  5.9999999999999995e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  40.39 
 
 
461 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  40.17 
 
 
461 aa  308  9e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  40.17 
 
 
461 aa  309  9e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  40.17 
 
 
461 aa  308  9e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  35.01 
 
 
474 aa  279  9e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  35.01 
 
 
474 aa  279  9e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  34.97 
 
 
455 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  34.51 
 
 
434 aa  204  2e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  34.43 
 
 
434 aa  203  6e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3829  Alkaline phosphatase  28.76 
 
 
536 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  30.48 
 
 
433 aa  186  7e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  32.45 
 
 
436 aa  182  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82654  vacuolar alkaline phosphatase  31.89 
 
 
560 aa  180  5.999999999999999e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.134835 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  31.21 
 
 
589 aa  179  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1220  alkaline phosphatase  32.03 
 
 
454 aa  178  1e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.199561 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  29.79 
 
 
547 aa  176  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10563  alkaline phosphatase Pho8 (AFU_orthologue; AFUA_2G03110)  30.58 
 
 
606 aa  173  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00384867  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  28.92 
 
 
541 aa  169  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2627  alkaline phosphatase  29.36 
 
 
530 aa  168  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  33.99 
 
 
525 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2068  Alkaline phosphatase  30.79 
 
 
503 aa  161  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.731445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  37.7 
 
 
388 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  32.97 
 
 
525 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0524  Alkaline phosphatase  27.78 
 
 
537 aa  160  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2789  alkaline phosphatase  27.54 
 
 
557 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.670968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2738  alkaline phosphatase  26.6 
 
 
557 aa  157  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.133398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2719  alkaline phosphatase  26.93 
 
 
557 aa  157  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  27.54 
 
 
557 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3057  alkaline phosphatase  27.53 
 
 
557 aa  156  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290343  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2999  alkaline phosphatase  27.54 
 
 
557 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000886968 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3038  alkaline phosphatase  26.93 
 
 
553 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146632  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3249  alkaline phosphatase  39.58 
 
 
607 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.565022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3003  alkaline phosphatase  28.04 
 
 
557 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  31.68 
 
 
506 aa  154  4e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2238  alkaline phosphatase  27.63 
 
 
557 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177606  hitchhiker  0.000000857533 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  31.99 
 
 
450 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2292  Alkaline phosphatase  28.71 
 
 
487 aa  151  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0502  alkaline phosphatase  28.38 
 
 
554 aa  150  5e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  34.74 
 
 
475 aa  150  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3036  alkaline phosphatase  26.19 
 
 
557 aa  150  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000723096  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2225  Alkaline phosphatase  29.94 
 
 
481 aa  149  7e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43722  vacuolar alkaline phosphatase  31.66 
 
 
501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.563768  normal  0.0682876 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  27.29 
 
 
548 aa  146  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4547  alkaline phosphatase  30.68 
 
 
464 aa  146  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19358  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2693  alkaline phosphatase  27.76 
 
 
501 aa  146  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2472  Alkaline phosphatase  30.38 
 
 
481 aa  145  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000616832  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1700  Alkaline phosphatase  28.6 
 
 
490 aa  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  28.54 
 
 
559 aa  141  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  32.69 
 
 
426 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0512  Alkaline phosphatase  29.61 
 
 
501 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.239781  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  33.63 
 
 
481 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2447  Alkaline phosphatase  30.1 
 
 
486 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  32.17 
 
 
476 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0006  Alkaline phosphatase  34.62 
 
 
610 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50499  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  33.13 
 
 
609 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  33.63 
 
 
454 aa  134  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  33.04 
 
 
471 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  33.04 
 
 
471 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1376  alkaline phosphatase  31.03 
 
 
558 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0116315  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  33.04 
 
 
471 aa  133  9e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  33.04 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  33.04 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  32.74 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  32.34 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  33.04 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  26.68 
 
 
581 aa  129  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1253  alkaline phosphatase  31.29 
 
 
335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  27.59 
 
 
585 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  27.59 
 
 
585 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0930  Alkaline phosphatase  25.83 
 
 
537 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>