227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0714 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  91.68 
 
 		 584 aa  1081    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  76.49 
 
 		 582 aa  904    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  100 
 
 		 589 aa  1176    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  88.35 
 
 		 585 aa  1028    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  53.4 
 
 		 580 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  50.42 
 
 		 581 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  51.01 
 
 		 584 aa  576  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  50.25 
 
 		 581 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  49.23 
 
 		 581 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  50.42 
 
 		 584 aa  570  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  52.52 
 
 		 609 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  50.25 
 
 		 584 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  43.72 
 
 		 671 aa  395  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3000  alkaline phosphatase  40.1 
 
 		 575 aa  341  2e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2364  alkaline phosphatase  39.93 
 
 		 575 aa  338  1.9999999999999998e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0542806  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  38.71 
 
 		 585 aa  320  5e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  38.71 
 
 		 585 aa  320  5e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02493  extracellular phytase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14030)  32.18 
 
 		 663 aa  274  4.0000000000000004e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.468824 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2187  alkaline phosphatase family protein  35.65 
 
 		 689 aa  259  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.838845  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  33.72 
 
 		 478 aa  183  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  31.36 
 
 		 467 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  31.92 
 
 		 463 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  32.72 
 
 		 467 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  32.72 
 
 		 467 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  33 
 
 		 464 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  32.52 
 
 		 467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  32.52 
 
 		 467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  32.79 
 
 		 464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  32.52 
 
 		 467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  32.52 
 
 		 467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  32.52 
 
 		 467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  32.39 
 
 		 466 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  32.33 
 
 		 467 aa  171  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  36.39 
 
 		 541 aa  170  7e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  32.59 
 
 		 501 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  32.59 
 
 		 498 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  32.59 
 
 		 498 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  32.59 
 
 		 498 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  32.02 
 
 		 545 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  31.83 
 
 		 545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  31.83 
 
 		 545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  31.83 
 
 		 545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  31.9 
 
 		 546 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  29.31 
 
 		 485 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  31.9 
 
 		 546 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  30.45 
 
 		 518 aa  163  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  29.11 
 
 		 485 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  32.14 
 
 		 498 aa  163  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  32.14 
 
 		 498 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  32.14 
 
 		 498 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  29.64 
 
 		 505 aa  161  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  32.65 
 
 		 557 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  32.32 
 
 		 468 aa  161  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  32.45 
 
 		 476 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  29.75 
 
 		 543 aa  160  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  32.45 
 
 		 479 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  32.65 
 
 		 509 aa  160  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  31.83 
 
 		 546 aa  160  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  31.79 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  32.47 
 
 		 455 aa  158  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  32.04 
 
 		 577 aa  158  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  32.45 
 
 		 476 aa  158  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  32.45 
 
 		 476 aa  158  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  30.3 
 
 		 486 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  29.85 
 
 		 434 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  32.46 
 
 		 480 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  29.85 
 
 		 434 aa  157  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  30.74 
 
 		 527 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  30.24 
 
 		 496 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  29.72 
 
 		 548 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  32.59 
 
 		 478 aa  154  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  30.6 
 
 		 502 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  32.32 
 
 		 501 aa  153  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  30.85 
 
 		 496 aa  153  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  30.63 
 
 		 499 aa  151  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  33.33 
 
 		 481 aa  150  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  33.72 
 
 		 470 aa  150  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  30.1 
 
 		 543 aa  150  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  29.21 
 
 		 545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  30.14 
 
 		 483 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  38.55 
 
 		 426 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  30.72 
 
 		 548 aa  148  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  32.57 
 
 		 454 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  34.98 
 
 		 547 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  30.17 
 
 		 450 aa  147  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3057  alkaline phosphatase  29.11 
 
 		 557 aa  147  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290343  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  29.45 
 
 		 527 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  34.51 
 
 		 525 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  33.06 
 
 		 471 aa  144  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  32.78 
 
 		 471 aa  144  5e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  33.06 
 
 		 471 aa  144  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2719  alkaline phosphatase  29.54 
 
 		 557 aa  144  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  33.33 
 
 		 471 aa  144  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  32.78 
 
 		 471 aa  143  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  32.78 
 
 		 471 aa  143  9e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  31.89 
 
 		 474 aa  143  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  32.78 
 
 		 471 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2789  alkaline phosphatase  29.54 
 
 		 557 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.670968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  31.89 
 
 		 474 aa  143  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  29.54 
 
 		 557 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>