224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3229 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  100 
 
 
527 aa  1093    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  53.26 
 
 
548 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  54.67 
 
 
496 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  54.56 
 
 
496 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  51.3 
 
 
505 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  53.4 
 
 
501 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  53.4 
 
 
498 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  53.4 
 
 
498 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  53.4 
 
 
498 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  53.17 
 
 
502 aa  499  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  52.92 
 
 
499 aa  497  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  52.72 
 
 
498 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  52.92 
 
 
498 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  53.11 
 
 
498 aa  491  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  51.85 
 
 
552 aa  488  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  54 
 
 
545 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  54 
 
 
545 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  54.4 
 
 
546 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  54.4 
 
 
546 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  54 
 
 
545 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  54 
 
 
545 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  53.51 
 
 
545 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  54.2 
 
 
546 aa  481  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  53.28 
 
 
543 aa  481  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  51.55 
 
 
616 aa  477  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  52.68 
 
 
543 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  51.86 
 
 
532 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  52.56 
 
 
640 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  54.29 
 
 
535 aa  462  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  49.9 
 
 
527 aa  461  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  48.07 
 
 
527 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  46.8 
 
 
565 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  45.39 
 
 
568 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  45.08 
 
 
501 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  45.88 
 
 
565 aa  378  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  44.28 
 
 
568 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1655  alkaline phosphatase  45.69 
 
 
576 aa  361  1e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.403448  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  42.62 
 
 
467 aa  331  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  42.12 
 
 
464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  41.91 
 
 
464 aa  326  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  40.45 
 
 
468 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  39.64 
 
 
467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  39.3 
 
 
471 aa  286  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  38.29 
 
 
470 aa  270  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  37.27 
 
 
486 aa  264  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  38.29 
 
 
467 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  38.09 
 
 
466 aa  264  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  38.29 
 
 
467 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  38.29 
 
 
467 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  38.29 
 
 
467 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  38.29 
 
 
467 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  38.29 
 
 
467 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  38.29 
 
 
467 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  37.65 
 
 
518 aa  263  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  38.4 
 
 
463 aa  258  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  35.79 
 
 
485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  35.79 
 
 
485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  38.56 
 
 
478 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  37.7 
 
 
480 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  37.6 
 
 
478 aa  240  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  36.2 
 
 
483 aa  239  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  38.34 
 
 
557 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  37.32 
 
 
476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  38.14 
 
 
509 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  37.32 
 
 
479 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  37.32 
 
 
476 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  37.32 
 
 
476 aa  233  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  38.14 
 
 
577 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  30.48 
 
 
434 aa  164  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  30.48 
 
 
434 aa  161  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  28.63 
 
 
547 aa  159  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  30.74 
 
 
589 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737.1  alkaline phosphatase  48.13 
 
 
215 aa  152  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  29.82 
 
 
584 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1075  Alkaline phosphatase  29.88 
 
 
635 aa  150  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  30.08 
 
 
671 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  29.6 
 
 
581 aa  147  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  32.28 
 
 
436 aa  147  6e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  28.63 
 
 
609 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  32.46 
 
 
506 aa  146  9e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  32.95 
 
 
589 aa  145  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  29.39 
 
 
585 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  29.54 
 
 
584 aa  143  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  28.49 
 
 
581 aa  143  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  28.94 
 
 
584 aa  143  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  28.49 
 
 
581 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  29.54 
 
 
455 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  28.54 
 
 
582 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2299  6-phosphatase  33.51 
 
 
468 aa  141  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0558896 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  29.11 
 
 
584 aa  141  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  31.33 
 
 
388 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  32.04 
 
 
559 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  32.83 
 
 
475 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  30.27 
 
 
471 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  30.27 
 
 
471 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0502  alkaline phosphatase  32.43 
 
 
554 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  28.29 
 
 
580 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  30.27 
 
 
471 aa  137  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  30.27 
 
 
471 aa  136  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  31.48 
 
 
474 aa  136  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>