228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1157 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  83.21 
 
 		 543 aa  902    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  82.62 
 
 		 545 aa  907    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  81.72 
 
 		 546 aa  904    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  81.72 
 
 		 546 aa  904    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  81.89 
 
 		 543 aa  889    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  82.46 
 
 		 546 aa  910    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  82.62 
 
 		 545 aa  907    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  82.62 
 
 		 545 aa  907    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  82.39 
 
 		 545 aa  920    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  100 
 
 		 545 aa  1117    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  80.26 
 
 		 535 aa  857    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  59.06 
 
 		 552 aa  575  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  58.71 
 
 		 616 aa  574  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  57.79 
 
 		 498 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  57.79 
 
 		 498 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  57.79 
 
 		 501 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  57.79 
 
 		 498 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  60.71 
 
 		 640 aa  545  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  55.05 
 
 		 527 aa  539  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  56.88 
 
 		 496 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  57.29 
 
 		 502 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  56.97 
 
 		 498 aa  538  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  56.26 
 
 		 498 aa  535  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  56.76 
 
 		 498 aa  536  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  57.29 
 
 		 499 aa  533  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  55.64 
 
 		 532 aa  533  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  55.65 
 
 		 496 aa  525  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  51.95 
 
 		 565 aa  527  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  56.24 
 
 		 527 aa  528  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  56.35 
 
 		 505 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  53.51 
 
 		 527 aa  483  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  52.85 
 
 		 548 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  50.41 
 
 		 568 aa  451  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  50 
 
 		 565 aa  436  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1655  alkaline phosphatase  49.8 
 
 		 576 aa  426  1e-118  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.403448  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  46.14 
 
 		 568 aa  422  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  44.61 
 
 		 501 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  42.59 
 
 		 464 aa  313  4.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  42.38 
 
 		 464 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  42.19 
 
 		 467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  40.17 
 
 		 467 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  40.17 
 
 		 467 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  40.17 
 
 		 467 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  40.17 
 
 		 467 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  40.17 
 
 		 467 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  40.17 
 
 		 467 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  39.79 
 
 		 485 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  39.33 
 
 		 485 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  39.96 
 
 		 467 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  40.29 
 
 		 468 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  39 
 
 		 470 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  39 
 
 		 467 aa  280  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  39.83 
 
 		 463 aa  279  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  39.75 
 
 		 466 aa  279  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  39.08 
 
 		 518 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  39.35 
 
 		 486 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  39.06 
 
 		 478 aa  270  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  39.38 
 
 		 471 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  39.55 
 
 		 483 aa  260  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  39.34 
 
 		 480 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  39.15 
 
 		 478 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  38.56 
 
 		 557 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  38.24 
 
 		 479 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  38.24 
 
 		 509 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  38.24 
 
 		 476 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  38.24 
 
 		 476 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  38.24 
 
 		 476 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  38.24 
 
 		 577 aa  249  8e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1075  Alkaline phosphatase  32.48 
 
 		 635 aa  169  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  31.97 
 
 		 455 aa  167  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  33.6 
 
 		 671 aa  164  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  30.99 
 
 		 581 aa  164  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737.1  alkaline phosphatase  54.82 
 
 		 215 aa  161  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  30.82 
 
 		 434 aa  160  6e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  30.63 
 
 		 581 aa  159  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  30.43 
 
 		 581 aa  158  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  30.82 
 
 		 434 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  33.87 
 
 		 506 aa  156  8e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  34.15 
 
 		 436 aa  156  9e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  36.16 
 
 		 525 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  30.56 
 
 		 584 aa  150  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  28.91 
 
 		 584 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  29.21 
 
 		 589 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  29.57 
 
 		 585 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  30.25 
 
 		 584 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  35.35 
 
 		 388 aa  146  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  32.53 
 
 		 541 aa  145  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2299  6-phosphatase  31.03 
 
 		 468 aa  143  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0558896 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  29.7 
 
 		 585 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  29.7 
 
 		 585 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  34.25 
 
 		 525 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  34.4 
 
 		 547 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2068  Alkaline phosphatase  33.94 
 
 		 503 aa  141  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.731445 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  30.28 
 
 		 609 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  34.13 
 
 		 589 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  28.49 
 
 		 582 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0524  Alkaline phosphatase  31.53 
 
 		 537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  33.96 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  31.42 
 
 		 433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  33.8 
 
 		 559 aa  134  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>