224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3932 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  100 
 
 
527 aa  1082    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  71.71 
 
 
616 aa  763    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  72.46 
 
 
532 aa  766    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  70.04 
 
 
640 aa  689    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  69.23 
 
 
527 aa  738    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  70.74 
 
 
552 aa  735    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  56.87 
 
 
496 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  58.41 
 
 
496 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  55.95 
 
 
501 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  56.45 
 
 
498 aa  571  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  56.45 
 
 
498 aa  571  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  56.45 
 
 
498 aa  571  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  56.17 
 
 
499 aa  567  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  56.45 
 
 
498 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  56.65 
 
 
498 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  56.45 
 
 
498 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  54.94 
 
 
502 aa  555  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  52.8 
 
 
565 aa  547  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  54.85 
 
 
543 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  55.05 
 
 
545 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  53.86 
 
 
543 aa  533  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  55.05 
 
 
535 aa  528  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  52.87 
 
 
545 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  53.19 
 
 
545 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  53.19 
 
 
545 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  53.19 
 
 
545 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  52.29 
 
 
546 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  52.09 
 
 
546 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  52.09 
 
 
546 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  51.54 
 
 
505 aa  484  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  49.9 
 
 
527 aa  461  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  48.71 
 
 
548 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  46.15 
 
 
568 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  45.61 
 
 
565 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1655  alkaline phosphatase  44.24 
 
 
576 aa  376  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.403448  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  44.77 
 
 
568 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  42.22 
 
 
501 aa  368  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  39.96 
 
 
467 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  38.93 
 
 
464 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  38.73 
 
 
464 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  39.21 
 
 
518 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  39.36 
 
 
486 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  37.18 
 
 
485 aa  280  7e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  37.35 
 
 
485 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  37.63 
 
 
468 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  36.99 
 
 
467 aa  276  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  36.69 
 
 
471 aa  269  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  36.77 
 
 
470 aa  267  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  36.53 
 
 
467 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  36.53 
 
 
467 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  36.53 
 
 
467 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  36.33 
 
 
467 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  36.33 
 
 
467 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  36.33 
 
 
467 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  36.33 
 
 
467 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  37.75 
 
 
483 aa  257  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  39.19 
 
 
478 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  36.12 
 
 
463 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  35.31 
 
 
466 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  37.82 
 
 
480 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  37.57 
 
 
478 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  37.48 
 
 
557 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  37.29 
 
 
479 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  37.29 
 
 
476 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  37.29 
 
 
509 aa  231  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  36.72 
 
 
476 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  36.72 
 
 
476 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  36.72 
 
 
577 aa  228  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737.1  alkaline phosphatase  58.24 
 
 
215 aa  204  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  31.4 
 
 
581 aa  157  5.0000000000000005e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  28.66 
 
 
434 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  29.37 
 
 
671 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  28.45 
 
 
434 aa  152  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  29.63 
 
 
581 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  29.87 
 
 
581 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  29.63 
 
 
585 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  30.85 
 
 
455 aa  144  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  33.82 
 
 
436 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  27.81 
 
 
506 aa  137  5e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  29.91 
 
 
676 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  31.03 
 
 
541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1075  Alkaline phosphatase  28.6 
 
 
635 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  33.24 
 
 
589 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2299  6-phosphatase  31.67 
 
 
468 aa  134  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0558896 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  29.26 
 
 
584 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  28.6 
 
 
585 aa  134  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  28.6 
 
 
585 aa  134  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  27.82 
 
 
433 aa  133  7.999999999999999e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  32.51 
 
 
584 aa  133  9e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  31.08 
 
 
471 aa  133  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  30 
 
 
582 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  31.08 
 
 
471 aa  131  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  28.88 
 
 
584 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  31.08 
 
 
471 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  31.08 
 
 
471 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2364  alkaline phosphatase  27.38 
 
 
575 aa  129  9.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0542806  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  30.6 
 
 
471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  31.33 
 
 
471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  27.33 
 
 
584 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  30.84 
 
 
471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>