228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0655 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  100 
 
 
565 aa  1164    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  59.45 
 
 
616 aa  613  9.999999999999999e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  54.23 
 
 
552 aa  587  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  57.29 
 
 
640 aa  566  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  55.53 
 
 
532 aa  551  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  52.72 
 
 
527 aa  544  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  53.18 
 
 
527 aa  525  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  51.95 
 
 
545 aa  527  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  54.3 
 
 
545 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  54.58 
 
 
545 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  54.58 
 
 
545 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  51.71 
 
 
546 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  51.71 
 
 
546 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  51.71 
 
 
546 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  54.58 
 
 
545 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  52.77 
 
 
543 aa  511  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  50.36 
 
 
543 aa  510  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  52.35 
 
 
535 aa  488  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  49.51 
 
 
496 aa  484  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  48.13 
 
 
496 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  48.72 
 
 
501 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  49.51 
 
 
498 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  49.51 
 
 
498 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  48.71 
 
 
499 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  49.31 
 
 
498 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  48.72 
 
 
498 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  48.72 
 
 
498 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  48.72 
 
 
498 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  47.92 
 
 
502 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  47.62 
 
 
505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  49.54 
 
 
548 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  47.08 
 
 
568 aa  440  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  47.52 
 
 
527 aa  434  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  45.64 
 
 
565 aa  382  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  46.23 
 
 
568 aa  385  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1655  alkaline phosphatase  44.67 
 
 
576 aa  373  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.403448  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  41.05 
 
 
501 aa  344  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  38.37 
 
 
467 aa  289  8e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  38.46 
 
 
486 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  37.14 
 
 
464 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  37.5 
 
 
485 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  37.14 
 
 
464 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  38.23 
 
 
485 aa  280  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  38.87 
 
 
470 aa  279  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  38.65 
 
 
467 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  38.65 
 
 
467 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  38.65 
 
 
467 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  38.65 
 
 
467 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  38.65 
 
 
467 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  38.62 
 
 
467 aa  273  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  38.65 
 
 
467 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  38.65 
 
 
467 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  38.19 
 
 
478 aa  270  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  38.24 
 
 
466 aa  270  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  36.77 
 
 
518 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  38.37 
 
 
463 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  38.6 
 
 
483 aa  261  2e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  39.32 
 
 
480 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  38.04 
 
 
468 aa  253  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  40 
 
 
478 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  37.78 
 
 
471 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  36.77 
 
 
557 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  35.7 
 
 
479 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  35.7 
 
 
509 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  35.7 
 
 
577 aa  236  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  35.87 
 
 
476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  35.87 
 
 
476 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  35.87 
 
 
476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737.1  alkaline phosphatase  53.76 
 
 
215 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  34.48 
 
 
434 aa  169  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  33.91 
 
 
434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  32.37 
 
 
455 aa  163  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1075  Alkaline phosphatase  31.79 
 
 
635 aa  156  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  32.53 
 
 
506 aa  150  6e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2299  6-phosphatase  28.49 
 
 
468 aa  146  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0558896 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  28.43 
 
 
581 aa  143  8e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  34.33 
 
 
525 aa  143  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  31.67 
 
 
525 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
559 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  28.31 
 
 
589 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  29.03 
 
 
609 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  33.7 
 
 
671 aa  137  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  27.55 
 
 
585 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  32.35 
 
 
481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  31.25 
 
 
541 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  30.24 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  33.78 
 
 
475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  31.69 
 
 
436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5695  6-phosphatase  29.98 
 
 
611 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166468  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  30.34 
 
 
547 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  32.6 
 
 
584 aa  134  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0502  alkaline phosphatase  33.87 
 
 
554 aa  134  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  30.55 
 
 
388 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  28.14 
 
 
584 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  30.77 
 
 
589 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  29.38 
 
 
581 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  33.02 
 
 
426 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  28.6 
 
 
581 aa  131  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1946  alkaline phosphatase  36.11 
 
 
481 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1835  alkaline phosphatase  36.11 
 
 
481 aa  131  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>