241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3933 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  71.71 
 
 
527 aa  762    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  100 
 
 
616 aa  1263    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  68.13 
 
 
532 aa  716    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  67.44 
 
 
640 aa  827    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  66.47 
 
 
527 aa  691    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  67.63 
 
 
552 aa  763    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  59.45 
 
 
565 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  58.71 
 
 
545 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  58.67 
 
 
543 aa  565  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  58.12 
 
 
543 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  55.64 
 
 
545 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  57.59 
 
 
535 aa  545  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  55.42 
 
 
545 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  55.42 
 
 
545 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  55.31 
 
 
546 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  55.42 
 
 
545 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  54.72 
 
 
546 aa  534  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  54.72 
 
 
546 aa  535  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  54.09 
 
 
496 aa  513  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  54.51 
 
 
496 aa  509  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  51.98 
 
 
499 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  52.78 
 
 
502 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  50.86 
 
 
498 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  50.67 
 
 
498 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  49.71 
 
 
498 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  49.71 
 
 
498 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  54.73 
 
 
505 aa  497  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  50.86 
 
 
498 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  49.71 
 
 
501 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  49.71 
 
 
498 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  51.55 
 
 
527 aa  476  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  48.41 
 
 
548 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  48.68 
 
 
568 aa  426  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  47.01 
 
 
565 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  47.53 
 
 
568 aa  405  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1655  alkaline phosphatase  46.17 
 
 
576 aa  395  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.403448  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  41.43 
 
 
501 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  41.7 
 
 
467 aa  319  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  40 
 
 
464 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  39.8 
 
 
464 aa  312  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  39.68 
 
 
486 aa  293  7e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  39.6 
 
 
518 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  39.4 
 
 
485 aa  286  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  38.18 
 
 
467 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  39.44 
 
 
468 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  39.08 
 
 
485 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  38.18 
 
 
470 aa  281  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  39.03 
 
 
471 aa  278  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  38.6 
 
 
467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  38.6 
 
 
467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  38.6 
 
 
467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  38.6 
 
 
467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  38.6 
 
 
467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  38.6 
 
 
467 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  38.6 
 
 
467 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  39.16 
 
 
480 aa  273  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  39.16 
 
 
478 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  37.84 
 
 
466 aa  266  8e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  38.46 
 
 
463 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  37.85 
 
 
483 aa  265  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  38.99 
 
 
478 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  38.83 
 
 
479 aa  238  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  38.83 
 
 
509 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  38.83 
 
 
476 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  38.91 
 
 
557 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  38.83 
 
 
577 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  38.83 
 
 
476 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  38.83 
 
 
476 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737.1  alkaline phosphatase  57.62 
 
 
215 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  31.5 
 
 
455 aa  162  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  30.43 
 
 
434 aa  161  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  29.76 
 
 
434 aa  156  8e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  30.32 
 
 
581 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2299  6-phosphatase  30.43 
 
 
468 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0558896 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  29.71 
 
 
581 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  30.81 
 
 
506 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  34.59 
 
 
559 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  29.88 
 
 
581 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0502  alkaline phosphatase  35.33 
 
 
554 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  32.28 
 
 
461 aa  144  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  33.7 
 
 
525 aa  143  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  32.26 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  31.49 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  32.26 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  32.63 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  32.63 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  32.28 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  32.26 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  31.88 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  31.74 
 
 
461 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  33.24 
 
 
671 aa  141  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  32.78 
 
 
525 aa  141  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1075  Alkaline phosphatase  30.02 
 
 
635 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  32.75 
 
 
388 aa  140  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1231  alkaline phosphatase  30.89 
 
 
589 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21484  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  32.08 
 
 
436 aa  138  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  31.25 
 
 
541 aa  137  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2068  Alkaline phosphatase  31.01 
 
 
503 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.731445 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  26.36 
 
 
547 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  28.4 
 
 
548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>