228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4114 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  61.74 
 
 
584 aa  743    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  100 
 
 
581 aa  1194    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  59.83 
 
 
580 aa  733    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  58.36 
 
 
584 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  57.37 
 
 
609 aa  683    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  60.35 
 
 
584 aa  721    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  98.97 
 
 
581 aa  1184    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  53.53 
 
 
581 aa  637    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  52.05 
 
 
582 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  50.42 
 
 
589 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  50.77 
 
 
584 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  51.67 
 
 
585 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  43.58 
 
 
671 aa  423  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  39.97 
 
 
585 aa  369  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  39.97 
 
 
585 aa  369  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2364  alkaline phosphatase  38.37 
 
 
575 aa  355  1e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0542806  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3000  alkaline phosphatase  38.08 
 
 
575 aa  347  4e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2187  alkaline phosphatase family protein  34.42 
 
 
689 aa  256  8e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.838845  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02493  extracellular phytase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14030)  28.68 
 
 
663 aa  242  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.468824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  29.69 
 
 
467 aa  175  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  32.02 
 
 
464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  31.82 
 
 
464 aa  174  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  30.72 
 
 
548 aa  173  9e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  31.03 
 
 
545 aa  169  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  30.92 
 
 
545 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  30.92 
 
 
545 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  31.05 
 
 
470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  30.92 
 
 
545 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  30.35 
 
 
568 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  30.53 
 
 
546 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  34.27 
 
 
426 aa  160  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  30.53 
 
 
546 aa  160  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  33.07 
 
 
505 aa  159  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  30.43 
 
 
545 aa  158  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  29.35 
 
 
498 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  29.35 
 
 
498 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  29.35 
 
 
498 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  29.35 
 
 
501 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  30.35 
 
 
546 aa  157  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  30.63 
 
 
543 aa  156  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  30.85 
 
 
565 aa  156  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  34.83 
 
 
468 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  29.78 
 
 
518 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  30.78 
 
 
543 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  29.98 
 
 
471 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  30.3 
 
 
486 aa  154  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  29.86 
 
 
478 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  29.45 
 
 
502 aa  150  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  30.61 
 
 
467 aa  150  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  30.61 
 
 
467 aa  150  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  29.63 
 
 
527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  30.61 
 
 
467 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  29.98 
 
 
480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  29.46 
 
 
498 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  29.26 
 
 
498 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  29.9 
 
 
498 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  30.4 
 
 
467 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  30.4 
 
 
467 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  30.4 
 
 
467 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  30.4 
 
 
467 aa  148  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  29.46 
 
 
455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  34.53 
 
 
471 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  29.65 
 
 
463 aa  147  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  34.53 
 
 
471 aa  147  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  34.53 
 
 
471 aa  147  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  34.25 
 
 
471 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  29.88 
 
 
616 aa  147  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  29.28 
 
 
496 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  29.01 
 
 
485 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  34.25 
 
 
471 aa  146  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  34.25 
 
 
471 aa  146  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  34.25 
 
 
471 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  32.55 
 
 
481 aa  146  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  32.63 
 
 
454 aa  145  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  34.25 
 
 
471 aa  145  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  31.52 
 
 
450 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  26.77 
 
 
552 aa  144  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  28.8 
 
 
485 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  29.62 
 
 
466 aa  144  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  29.84 
 
 
483 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  28.49 
 
 
527 aa  143  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  27.72 
 
 
434 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  30.48 
 
 
478 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  27.72 
 
 
434 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  28.97 
 
 
467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  29.49 
 
 
489 aa  141  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  32.4 
 
 
541 aa  141  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  28.29 
 
 
496 aa  140  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  34.16 
 
 
471 aa  140  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  28.13 
 
 
433 aa  139  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  30.36 
 
 
535 aa  139  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1655  alkaline phosphatase  29.84 
 
 
576 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.403448  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  28.07 
 
 
532 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  28.77 
 
 
527 aa  138  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  28.6 
 
 
568 aa  137  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1480  Alkaline phosphatase  29.51 
 
 
548 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4547  alkaline phosphatase  31.65 
 
 
464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19358  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  33.03 
 
 
474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  33.03 
 
 
474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  28.78 
 
 
499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>