227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0413 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  98.73 
 
 
471 aa  955    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  99.36 
 
 
471 aa  961    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  99.36 
 
 
471 aa  961    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  71.62 
 
 
481 aa  662    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3809  alkaline phosphatase  78.86 
 
 
467 aa  706    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227259  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1828  alkaline phosphatase  74.38 
 
 
476 aa  667    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1163  alkaline phosphatase  70.95 
 
 
454 aa  654    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  98.3 
 
 
471 aa  954    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1528  alkaline phosphatase  75.64 
 
 
475 aa  731    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  73.71 
 
 
476 aa  684    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  100 
 
 
471 aa  964    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  98.73 
 
 
471 aa  957    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1835  alkaline phosphatase  76.75 
 
 
481 aa  693    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541069  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1946  alkaline phosphatase  76.75 
 
 
481 aa  693    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2291  alkaline phosphatase  76.75 
 
 
481 aa  693    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  99.36 
 
 
471 aa  959    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  98.73 
 
 
471 aa  955    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  88.75 
 
 
471 aa  870    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4018  Alkaline phosphatase  62.05 
 
 
492 aa  536  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.306331  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5695  6-phosphatase  43.35 
 
 
611 aa  306  7e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.166468  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2299  6-phosphatase  42.7 
 
 
468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0558896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1075  Alkaline phosphatase  42.28 
 
 
635 aa  303  4.0000000000000003e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4466  alkaline phosphatase  40.34 
 
 
499 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4297  alkaline phosphatase  40.34 
 
 
499 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4197  alkaline phosphatase  40.34 
 
 
499 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  40 
 
 
455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2306  Alkaline phosphatase  32.79 
 
 
450 aa  177  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  37.35 
 
 
489 aa  176  9e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2650  alkaline phosphatase  36.68 
 
 
474 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2706  alkaline phosphatase  36.68 
 
 
474 aa  176  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0541  alkaline phosphatase  36.59 
 
 
455 aa  171  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4244  alkaline phosphatase  38.24 
 
 
461 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00456064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4093  alkaline phosphatase  38.53 
 
 
461 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000430815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4574  alkaline phosphatase  38.24 
 
 
461 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4082  alkaline phosphatase  38.24 
 
 
461 aa  168  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000108141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4426  alkaline phosphatase  38.24 
 
 
461 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4478  alkaline phosphatase  38.24 
 
 
461 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0771  alkaline phosphatase  37.94 
 
 
461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000868006  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4427  alkaline phosphatase  37.9 
 
 
461 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000511978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4466  alkaline phosphatase  37.65 
 
 
461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4194  alkaline phosphatase  37.31 
 
 
461 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3069  alkaline phosphatase  37.61 
 
 
461 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.13276  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4547  alkaline phosphatase  34.64 
 
 
464 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.19358  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  34.23 
 
 
501 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  34.55 
 
 
671 aa  159  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  31.57 
 
 
467 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3974  alkaline phosphatase  36.87 
 
 
457 aa  157  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3226  alkaline phosphatase  34.19 
 
 
543 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1220  alkaline phosphatase  34.43 
 
 
454 aa  155  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.199561 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  32.48 
 
 
541 aa  155  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4136  alkaline phosphatase  35.33 
 
 
476 aa  154  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.11383 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  34.76 
 
 
434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  31.39 
 
 
505 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  29.31 
 
 
433 aa  151  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0807  alkaline phosphatase  35.37 
 
 
439 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.157907  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3529  alkaline phosphatase  35.37 
 
 
425 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0832  Alkaline phosphatase  35.37 
 
 
439 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.201361  hitchhiker  0.000000624309 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  34.6 
 
 
581 aa  150  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  30.72 
 
 
464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0839  alkaline phosphatase  35.06 
 
 
439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.029758  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  30.51 
 
 
464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  34.25 
 
 
581 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0573  alkaline phosphatase  33.84 
 
 
492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.949232  normal  0.22493 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  33.9 
 
 
434 aa  147  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0830  alkaline phosphatase  33.74 
 
 
454 aa  147  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  34.25 
 
 
581 aa  147  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3163  alkaline phosphatase  34.45 
 
 
440 aa  147  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0816  Alkaline phosphatase  32.56 
 
 
426 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  33.33 
 
 
584 aa  146  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3334  alkaline phosphatase  34.45 
 
 
464 aa  146  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460032  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3446  alkaline phosphatase  34.45 
 
 
464 aa  146  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00260506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  28.48 
 
 
485 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  30.8 
 
 
467 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0688  alkaline phosphatase  34.45 
 
 
470 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.171118  normal  0.678776 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  32.32 
 
 
584 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  33.08 
 
 
584 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  30.99 
 
 
388 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  33.33 
 
 
585 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  28.51 
 
 
485 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0598  alkaline phosphatase  35.63 
 
 
445 aa  144  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.383819  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  32.5 
 
 
589 aa  143  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  32.68 
 
 
584 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3036  alkaline phosphatase  31.78 
 
 
557 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000723096  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  34.84 
 
 
525 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3038  alkaline phosphatase  31.87 
 
 
553 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146632  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  31.54 
 
 
480 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  29.65 
 
 
470 aa  140  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2976  alkaline phosphatase  34.44 
 
 
461 aa  139  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  34.73 
 
 
525 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  33.23 
 
 
436 aa  138  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3057  alkaline phosphatase  33.05 
 
 
557 aa  139  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290343  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0006  Alkaline phosphatase  29.03 
 
 
610 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.50499  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2719  alkaline phosphatase  31.51 
 
 
557 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.719962  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  32.86 
 
 
582 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  27.39 
 
 
486 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2238  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
557 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.177606  hitchhiker  0.000000857533 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10563  alkaline phosphatase Pho8 (AFU_orthologue; AFUA_2G03110)  30.36 
 
 
606 aa  136  7.000000000000001e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00384867  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  33.79 
 
 
466 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2738  alkaline phosphatase  31.91 
 
 
557 aa  136  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.133398  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3001  alkaline phosphatase  31.78 
 
 
557 aa  136  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00980111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>