224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1250 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  87.1 
 
 		 496 aa  913    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  81.65 
 
 		 499 aa  847    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  79.23 
 
 		 498 aa  830    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  79.23 
 
 		 501 aa  831    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  79.03 
 
 		 498 aa  811    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  79.03 
 
 		 498 aa  812    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  100 
 
 		 496 aa  1023    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  79.23 
 
 		 498 aa  813    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  79.23 
 
 		 498 aa  830    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  79.23 
 
 		 498 aa  830    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  81.85 
 
 		 502 aa  865    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  58.86 
 
 		 527 aa  573  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  57.06 
 
 		 543 aa  542  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  57.29 
 
 		 543 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  59.52 
 
 		 546 aa  538  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  59.31 
 
 		 546 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  59.31 
 
 		 546 aa  535  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  53.9 
 
 		 532 aa  533  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  58.66 
 
 		 545 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  56.47 
 
 		 545 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  56.47 
 
 		 545 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  56.47 
 
 		 545 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  54.43 
 
 		 527 aa  529  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  55.65 
 
 		 545 aa  525  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  57.29 
 
 		 535 aa  518  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  54.51 
 
 		 616 aa  509  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  50.37 
 
 		 552 aa  508  1e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  58.21 
 
 		 527 aa  506  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  52.26 
 
 		 640 aa  488  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  49.51 
 
 		 565 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  51.07 
 
 		 505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  49.81 
 
 		 548 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  47.05 
 
 		 568 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  46.88 
 
 		 565 aa  409  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  45.67 
 
 		 568 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1655  alkaline phosphatase  46.48 
 
 		 576 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.403448  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  46.25 
 
 		 501 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  41.9 
 
 		 464 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  42.67 
 
 		 467 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  41.47 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  37.88 
 
 		 518 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  40.47 
 
 		 470 aa  286  8e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  40.69 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  41.95 
 
 		 478 aa  280  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  38.84 
 
 		 485 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  39.29 
 
 		 485 aa  276  5e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737.1  alkaline phosphatase  73.68 
 
 		 215 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  39.4 
 
 		 471 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  40.17 
 
 		 468 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  40.22 
 
 		 463 aa  269  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  41.95 
 
 		 557 aa  269  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  38.53 
 
 		 486 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  39.35 
 
 		 467 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  39.35 
 
 		 467 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  39.35 
 
 		 467 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  39.35 
 
 		 467 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  39.35 
 
 		 467 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  39.35 
 
 		 467 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  39.35 
 
 		 467 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  41.74 
 
 		 476 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  41.53 
 
 		 479 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  41.74 
 
 		 476 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  41.53 
 
 		 509 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  41.74 
 
 		 577 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  41.53 
 
 		 476 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  38.95 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  39.16 
 
 		 483 aa  254  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  39.5 
 
 		 480 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  40 
 
 		 478 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  30.85 
 
 		 589 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  32.83 
 
 		 434 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  29.55 
 
 		 584 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  30.06 
 
 		 585 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  28.72 
 
 		 671 aa  151  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  32.52 
 
 		 434 aa  149  8e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  28.75 
 
 		 455 aa  149  9e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  30.36 
 
 		 581 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  33.84 
 
 		 506 aa  145  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  28.89 
 
 		 584 aa  143  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1137  alkaline phosphatase  31.83 
 
 		 436 aa  143  9e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2754  Alkaline phosphatase  27.46 
 
 		 547 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  28.29 
 
 		 581 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  28.29 
 
 		 581 aa  140  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  29.3 
 
 		 582 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  28.51 
 
 		 585 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0524  Alkaline phosphatase  33.63 
 
 		 676 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  28.51 
 
 		 585 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  28.05 
 
 		 584 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  28.46 
 
 		 609 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  27.57 
 
 		 584 aa  133  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  29.98 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  29.11 
 
 		 471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1075  Alkaline phosphatase  30.37 
 
 		 635 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2371  alkaline phosphatase  33.06 
 
 		 559 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  29.11 
 
 		 471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  28.78 
 
 		 471 aa  131  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  26.64 
 
 		 580 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  28.93 
 
 		 471 aa  130  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  30.51 
 
 		 388 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03057  alkaline phosphatase  30.25 
 
 		 525 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>