224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2890 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1655  alkaline phosphatase  64.96 
 
 
576 aa  729    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.403448  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01900  alkaline phosphatase, placental type  73.4 
 
 
568 aa  800    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.732479  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  100 
 
 
568 aa  1169    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  64.61 
 
 
565 aa  748    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  48.51 
 
 
498 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  48.51 
 
 
501 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  52.02 
 
 
543 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  50.91 
 
 
545 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  50.91 
 
 
545 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  48.51 
 
 
498 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  52.1 
 
 
543 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  50.91 
 
 
545 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  48.51 
 
 
498 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  50.91 
 
 
545 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  48.15 
 
 
546 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  48.15 
 
 
546 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  50.41 
 
 
545 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  49.31 
 
 
498 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  47.96 
 
 
546 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  49.31 
 
 
498 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  49.11 
 
 
498 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  47.8 
 
 
502 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0655  alkaline phosphatase  47.72 
 
 
565 aa  444  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0358582  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  52.43 
 
 
535 aa  434  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  47.05 
 
 
496 aa  434  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  47.79 
 
 
499 aa  435  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3933  alkaline phosphatase family protein  47.49 
 
 
616 aa  428  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  49.49 
 
 
548 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  46.46 
 
 
640 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  45.58 
 
 
496 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  47.22 
 
 
505 aa  413  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3409  alkaline phosphatase  45.97 
 
 
552 aa  415  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  45 
 
 
527 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3229  alkaline phosphatase  47.35 
 
 
527 aa  391  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.657228  normal  0.96521 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  43.76 
 
 
532 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3408  alkaline phosphatase  45.51 
 
 
527 aa  383  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  43.35 
 
 
501 aa  349  7e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  39.06 
 
 
467 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  38.52 
 
 
464 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  37.07 
 
 
470 aa  264  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  38.32 
 
 
464 aa  262  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  37.27 
 
 
467 aa  256  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  36.83 
 
 
518 aa  256  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  38.24 
 
 
467 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  37.35 
 
 
463 aa  252  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  38.24 
 
 
467 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  38.24 
 
 
467 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  38.24 
 
 
467 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  38.24 
 
 
467 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  38.24 
 
 
467 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  38.24 
 
 
467 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  36.47 
 
 
486 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  37.65 
 
 
466 aa  244  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  35.73 
 
 
485 aa  243  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  35.33 
 
 
485 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  37 
 
 
468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  37.85 
 
 
478 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  37.83 
 
 
471 aa  233  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  38.55 
 
 
557 aa  229  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  38.15 
 
 
479 aa  225  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  38.15 
 
 
509 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  38.15 
 
 
476 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  38.15 
 
 
577 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  38.15 
 
 
476 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  38.15 
 
 
476 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  37.72 
 
 
480 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  37.27 
 
 
478 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  34.76 
 
 
483 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  30.35 
 
 
581 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  30.14 
 
 
581 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  29.52 
 
 
581 aa  160  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  30.14 
 
 
671 aa  156  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0737.1  alkaline phosphatase  51.16 
 
 
215 aa  155  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  31.22 
 
 
455 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  29.35 
 
 
580 aa  154  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  28.87 
 
 
584 aa  146  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  28.51 
 
 
584 aa  146  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  29.04 
 
 
609 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  28.74 
 
 
584 aa  145  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  29.16 
 
 
584 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  29.7 
 
 
585 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2889  alkaline phosphatase  33.03 
 
 
388 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  28.83 
 
 
589 aa  136  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  33.42 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1200  alkaline phosphatase  31.82 
 
 
481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  32.63 
 
 
434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  33.42 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  32.33 
 
 
434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  33.16 
 
 
471 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  32.89 
 
 
471 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2299  6-phosphatase  33.76 
 
 
468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0558896 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  33.33 
 
 
471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  32.89 
 
 
471 aa  131  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  28.65 
 
 
582 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  32.54 
 
 
471 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  32.81 
 
 
471 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2068  Alkaline phosphatase  33.03 
 
 
503 aa  130  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.731445 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0541  alkaline phosphatase  31.01 
 
 
506 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.208558  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  33.06 
 
 
525 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  33.24 
 
 
471 aa  129  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>